MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 8915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015859	CG	3	6	1347840	1347845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_015859	AAC	2	6	1347881	1347886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_015859	CCGA	2	8	1351103	1351110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_015859	CCG	2	6	1351147	1351152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_015859	GGGTCC	2	12	1351179	1351190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015859	TA	3	6	1351236	1351241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015859	AAGG	2	8	1351244	1351251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015859	ACCGG	2	10	1354201	1354210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4009	NC_015859	GCG	2	6	1354217	1354222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_015859	CGC	2	6	1354236	1354241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_015859	CCG	2	6	1354247	1354252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015859	CGG	2	6	1354272	1354277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015859	ACG	2	6	1354295	1354300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015859	CGAAC	2	10	1354357	1354366	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4015	NC_015859	CGG	2	6	1354392	1354397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_015859	GCG	2	6	1354403	1354408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015859	CCA	2	6	1354410	1354415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_015859	GGT	2	6	1354552	1354557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015859	CAC	2	6	1354593	1354598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_015859	CAC	2	6	1354603	1354608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_015859	CGG	2	6	1354683	1354688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015859	CAC	2	6	1354708	1354713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_015859	GAG	2	6	1354723	1354728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015859	TCC	2	6	1354751	1354756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_015859	GAC	2	6	1354777	1354782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015859	ACC	2	6	1354789	1354794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_015859	CAG	2	6	1354813	1354818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015859	GAG	2	6	1354847	1354852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015859	CGT	2	6	1354881	1354886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015859	CCG	2	6	1354976	1354981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_015859	GTGGG	2	10	1355050	1355059	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015859	CCG	2	6	1358257	1358262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_015859	GGA	2	6	1358306	1358311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015859	CG	4	8	1361049	1361056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_015859	GCG	3	9	1361054	1361062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_015859	GAC	2	6	1361068	1361073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_015859	GGT	2	6	1361152	1361157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015859	TGC	2	6	1364576	1364581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_015859	GCC	2	6	1364608	1364613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_015859	GCC	2	6	1365957	1365962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_015859	GGT	2	6	1365977	1365982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015859	GGC	2	6	1366004	1366009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015859	CCG	2	6	1366019	1366024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_015859	CCTC	2	8	1366037	1366044	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4045	NC_015859	GGCC	2	8	1366052	1366059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_015859	CG	3	6	1366083	1366088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_015859	GCT	2	6	1366106	1366111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015859	GCG	2	6	1366141	1366146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_015859	CCG	2	6	1366195	1366200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_015859	AAG	2	6	1366251	1366256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015859	CGC	2	6	1366275	1366280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_015859	CGC	2	6	1366349	1366354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_015859	CGC	2	6	1366455	1366460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_015859	CTC	2	6	1366583	1366588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_015859	CGA	2	6	1366595	1366600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_015859	GGGC	2	8	1366609	1366616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4057	NC_015859	GGC	2	6	1366656	1366661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015859	AGG	2	6	1366786	1366791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015859	CAG	2	6	1366826	1366831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015859	GCC	2	6	1367218	1367223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_015859	CGA	2	6	1367248	1367253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_015859	CGG	2	6	1367273	1367278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015859	CGTC	2	8	1367320	1367327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_015859	GGA	2	6	1367385	1367390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015859	CTT	2	6	1367415	1367420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_015859	TCG	2	6	1367516	1367521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_015859	CTG	2	6	1367584	1367589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015859	GGT	2	6	1376921	1376926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015859	CCGTC	2	10	1379339	1379348	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4070	NC_015859	TG	3	6	1379352	1379357	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015859	GAG	2	6	1379399	1379404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015859	TCAAGG	2	12	1382467	1382478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4073	NC_015859	TCT	2	6	1382503	1382508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_015859	CTG	3	9	1382529	1382537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_015859	ACC	2	6	1384402	1384407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_015859	GGC	2	6	1387108	1387113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015859	CCA	2	6	1393637	1393642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_015859	CAGG	2	8	1395106	1395113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4079	NC_015859	GGCA	2	8	1398684	1398691	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4080	NC_015859	CAG	2	6	1399116	1399121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_015859	CCG	2	6	1399263	1399268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_015859	CGA	2	6	1399291	1399296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015859	CGA	2	6	1400960	1400965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015859	GAC	2	6	1400988	1400993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_015859	CGG	2	6	1401017	1401022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015859	GCC	2	6	1403387	1403392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_015859	GCC	2	6	1404206	1404211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_015859	CTG	2	6	1404239	1404244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_015859	CGA	2	6	1404306	1404311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_015859	CGG	2	6	1404313	1404318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_015859	GAC	2	6	1407636	1407641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_015859	TCC	2	6	1408697	1408702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_015859	GGA	2	6	1409911	1409916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015859	TGCGG	2	10	1409954	1409963	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_015859	CGG	2	6	1409970	1409975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_015859	CTG	2	6	1411519	1411524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_015859	GCG	2	6	1412412	1412417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015859	GGT	2	6	1412424	1412429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015859	TTCC	2	8	1412436	1412443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_015859	TC	4	8	1412482	1412489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_015859	TGG	3	9	1414652	1414660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015859	AGT	2	6	1414664	1414669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015859	GT	3	6	1417009	1417014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015859	GCC	2	6	1417048	1417053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_015859	ATGT	2	8	1417060	1417067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015859	CAA	2	6	1417126	1417131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_015859	GCC	2	6	1417184	1417189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_015859	ACG	3	9	1417212	1417220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015859	CTG	2	6	1423441	1423446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_015859	CAC	2	6	1426584	1426589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_015859	TGT	2	6	1426615	1426620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015859	GAA	2	6	1426684	1426689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015859	ACC	2	6	1431490	1431495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_015859	CGG	2	6	1431517	1431522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_015859	TTC	2	6	1431672	1431677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015859	TGG	2	6	1431689	1431694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015859	GGAC	2	8	1431750	1431757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_015859	CA	4	8	1431764	1431771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_015859	GAG	2	6	1431809	1431814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015859	TCA	2	6	1431818	1431823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015859	TCG	2	6	1431872	1431877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_015859	CGA	2	6	1431912	1431917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015859	CGACCT	2	12	1431942	1431953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_015859	GCC	2	6	1431978	1431983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_015859	CGCCA	2	10	1432347	1432356	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4126	NC_015859	CAA	2	6	1432629	1432634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_015859	CAC	2	6	1433089	1433094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_015859	GTC	2	6	1433127	1433132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015859	CGC	2	6	1433148	1433153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_015859	CGCAG	2	10	1434090	1434099	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4131	NC_015859	GAT	2	6	1434109	1434114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015859	GAT	2	6	1434138	1434143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_015859	GCA	2	6	1434161	1434166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_015859	CG	3	6	1435216	1435221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4135	NC_015859	CCT	2	6	1435230	1435235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4137	NC_015859	CGC	2	6	1437867	1437872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4138	NC_015859	GGC	2	6	1437891	1437896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4139	NC_015859	ACC	2	6	1439010	1439015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4141	NC_015859	GAGAA	2	10	1439045	1439054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4142	NC_015859	CTG	2	6	1443338	1443343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_015859	CAT	2	6	1443768	1443773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_015859	ATC	2	6	1443784	1443789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_015859	ACCGG	2	10	1448052	1448061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4148	NC_015859	AGAA	2	8	1449091	1449098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_015859	AG	4	8	1450787	1450794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4150	NC_015859	CGA	2	6	1451152	1451157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4151	NC_015859	CCG	2	6	1451160	1451165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4152	NC_015859	TGG	2	6	1452295	1452300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_015859	TGG	2	6	1453673	1453678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_015859	TGT	2	6	1453694	1453699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4158	NC_015859	T	6	6	1453729	1453734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4159	NC_015859	TGG	2	6	1453752	1453757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4161	NC_015859	GTTG	2	8	1453817	1453824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4162	NC_015859	CAG	2	6	1453898	1453903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4186	NC_015859	GGT	2	6	1455198	1455203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4227	NC_015859	CGT	2	6	1457125	1457130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4230	NC_015859	GT	3	6	1457337	1457342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4231	NC_015859	ATG	2	6	1457349	1457354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4240	NC_015859	GTTCG	2	10	1458125	1458134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4251	NC_015859	GT	4	8	1459031	1459038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_015859	GT	3	6	1459045	1459050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_015859	GGT	2	6	1459057	1459062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4255	NC_015859	CGC	2	6	1459160	1459165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_015859	TGA	2	6	1459184	1459189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_015859	GAGG	2	8	1459196	1459203	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_015859	CCTC	2	8	1459221	1459228	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4259	NC_015859	GCA	2	6	1459246	1459251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_015859	TCCC	2	8	1459269	1459276	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4261	NC_015859	CCG	2	6	1460629	1460634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4263	NC_015859	CGA	2	6	1462662	1462667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4379	NC_015859	CAT	2	6	1536272	1536277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4382	NC_015859	CCA	2	6	1537437	1537442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4383	NC_015859	CTC	2	6	1539100	1539105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4384	NC_015859	CA	3	6	1540609	1540614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_015859	CCA	2	6	1540645	1540650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4386	NC_015859	CTGTC	2	10	1542207	1542216	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4387	NC_015859	GTG	2	6	1543250	1543255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4389	NC_015859	TCG	2	6	1543269	1543274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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