MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 12721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_015856	CAA	2	6	5106676	5106681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_015856	TGT	2	6	5109202	5109207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_015856	T	6	6	5109221	5109226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_015856	GCT	2	6	5111604	5111609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_015856	CT	3	6	5113331	5113336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_015856	TGC	2	6	5113358	5113363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_015856	ATG	2	6	5113873	5113878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_015856	GCC	2	6	5113919	5113924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_015856	CGC	2	6	5113932	5113937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_015856	ACA	2	6	5114825	5114830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_015856	A	6	6	5114830	5114835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_015856	GCT	2	6	5114845	5114850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_015856	TTG	2	6	5114856	5114861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_015856	AT	3	6	5116820	5116825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_015856	AAAT	2	8	5116827	5116834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_015856	CAG	2	6	5120396	5120401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_015856	A	7	7	5120709	5120715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_015856	CAAAAC	2	12	5120716	5120727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_015856	AAC	2	6	5120731	5120736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_015856	AGC	2	6	5121998	5122003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_015856	T	7	7	5122212	5122218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_015856	TA	3	6	5123216	5123221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_015856	CGTT	2	8	5124706	5124713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12525	NC_015856	AGT	2	6	5125447	5125452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12531	NC_015856	CCAG	2	8	5128553	5128560	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12536	NC_015856	CGCAG	2	10	5130545	5130554	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12537	NC_015856	GCGCG	2	10	5130576	5130585	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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12539	NC_015856	T	7	7	5133544	5133550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12544	NC_015856	GAAT	2	8	5135437	5135444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12551	NC_015856	TAC	2	6	5137119	5137124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12553	NC_015856	T	6	6	5138055	5138060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12555	NC_015856	T	6	6	5138078	5138083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_015856	T	6	6	5138094	5138099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_015856	TA	5	10	5138120	5138129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12562	NC_015856	TCT	2	6	5138344	5138349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12572	NC_015856	TAG	4	12	5138523	5138534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12579	NC_015856	TA	3	6	5138867	5138872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12589	NC_015856	GGCT	2	8	5144659	5144666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12599	NC_015856	TC	3	6	5151660	5151665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12602	NC_015856	TAGC	2	8	5151749	5151756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12608	NC_015856	GCT	2	6	5151965	5151970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12612	NC_015856	ATT	2	6	5154648	5154653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_015856	ATT	2	6	5154811	5154816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12618	NC_015856	GCCC	2	8	5155571	5155578	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12619	NC_015856	A	7	7	5155581	5155587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_015856	GTTTT	2	10	5155606	5155615	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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12622	NC_015856	A	6	6	5157661	5157666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12628	NC_015856	T	7	7	5157919	5157925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.