MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 12721

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015856	TGA	2	6	2495742	2495747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015856	GCG	2	6	2495865	2495870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015856	GCC	2	6	2495875	2495880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_015856	AGC	2	6	2495887	2495892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015856	TGC	2	6	2495976	2495981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_015856	TGA	2	6	2496073	2496078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015856	GCT	2	6	2496094	2496099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015856	TTC	2	6	2496147	2496152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015856	AT	3	6	2496154	2496159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015856	TCT	2	6	2496501	2496506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015856	AGGGG	2	10	2496537	2496546	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015856	TCT	3	9	2496552	2496560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015856	TGT	2	6	2498095	2498100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015856	ATT	2	6	2498127	2498132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015856	CTG	2	6	2498158	2498163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015856	ATC	2	6	2498187	2498192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015856	TTC	2	6	2498224	2498229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_015856	CCG	2	6	2498256	2498261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_015856	ATT	2	6	2498282	2498287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015856	CTG	2	6	2498293	2498298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_015856	AGT	2	6	2498328	2498333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015856	TGA	2	6	2498365	2498370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015856	A	7	7	2498425	2498431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015856	GTT	2	6	2498453	2498458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015856	AAG	2	6	2498489	2498494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015856	TGA	2	6	2498626	2498631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015856	T	6	6	2498884	2498889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015856	ACG	2	6	2498949	2498954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_015856	T	6	6	2499048	2499053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015856	TGCC	2	8	2499198	2499205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_015856	ATG	2	6	2499256	2499261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015856	TTG	2	6	2499323	2499328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015856	TGA	2	6	2499342	2499347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015856	GCCG	2	8	2499351	2499358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_015856	CAG	2	6	2499432	2499437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_015856	ATG	2	6	2499457	2499462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015856	AGC	2	6	2499467	2499472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015856	T	6	6	2499534	2499539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015856	AGGGC	2	10	2499549	2499558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_015856	GCA	2	6	2499580	2499585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015856	ATCG	2	8	2499748	2499755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_015856	AAG	2	6	2499846	2499851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015856	CT	3	6	2499879	2499884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_015856	TGG	2	6	2499886	2499891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015856	CGG	2	6	2499916	2499921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015856	CAT	2	6	2499934	2499939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015856	TGG	2	6	2499940	2499945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_015856	C	6	6	2499946	2499951	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6049	NC_015856	TGG	2	6	2500052	2500057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015856	GGTC	2	8	2500138	2500145	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_015856	CGGCAT	2	12	2500157	2500168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015856	GCC	2	6	2500296	2500301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015856	CCTG	2	8	2500499	2500506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_015856	GACC	2	8	2500534	2500541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_015856	CCG	2	6	2500557	2500562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_015856	ACTGTG	2	12	2500567	2500578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6057	NC_015856	GGTC	2	8	2500611	2500618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6058	NC_015856	GC	3	6	2500717	2500722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_015856	GT	3	6	2500765	2500770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015856	GCC	2	6	2500829	2500834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_015856	TGCG	2	8	2500855	2500862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6062	NC_015856	GAT	2	6	2500971	2500976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015856	CGG	2	6	2500977	2500982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_015856	GCG	2	6	2501145	2501150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_015856	GCT	2	6	2501183	2501188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_015856	GGC	2	6	2501256	2501261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015856	GCG	2	6	2501284	2501289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_015856	GGC	2	6	2501439	2501444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015856	ATTT	2	8	2501504	2501511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015856	T	6	6	2501509	2501514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015856	GCT	2	6	2501525	2501530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_015856	TG	4	8	2501551	2501558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015856	AAAAG	2	10	2501566	2501575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015856	CTTG	2	8	2501635	2501642	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_015856	TAT	2	6	2501679	2501684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015856	GCT	2	6	2501742	2501747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015856	GCACT	2	10	2501753	2501762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6078	NC_015856	CAG	2	6	2501818	2501823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_015856	T	6	6	2501827	2501832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015856	CGC	2	6	2501858	2501863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6081	NC_015856	ATT	2	6	2501872	2501877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015856	CAT	3	9	2501929	2501937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_015856	TTTTC	2	10	2503000	2503009	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6084	NC_015856	GCG	2	6	2503120	2503125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_015856	CGCGC	2	10	2503129	2503138	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6086	NC_015856	CCCGC	2	10	2503165	2503174	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6087	NC_015856	AAC	2	6	2503201	2503206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_015856	CAC	2	6	2503257	2503262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_015856	GCA	2	6	2503354	2503359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_015856	CACGTT	2	12	2503465	2503476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015856	CAGC	2	8	2503543	2503550	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_015856	A	6	6	2504821	2504826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_015856	CTG	2	6	2504912	2504917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_015856	ATG	2	6	2506541	2506546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015856	GGA	2	6	2506630	2506635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015856	ACG	2	6	2506637	2506642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_015856	AGC	2	6	2506655	2506660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_015856	CAGA	2	8	2506732	2506739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_015856	GCA	3	9	2506752	2506760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015856	AACA	2	8	2506778	2506785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6101	NC_015856	CAG	2	6	2506792	2506797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015856	GAAC	2	8	2506815	2506822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6103	NC_015856	CCT	2	6	2506849	2506854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_015856	AAC	2	6	2506857	2506862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015856	CAA	3	9	2506947	2506955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015856	CAC	2	6	2506983	2506988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_015856	TTG	2	6	2507052	2507057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_015856	ACG	2	6	2507114	2507119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015856	TTC	2	6	2507132	2507137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015856	CAT	3	9	2507143	2507151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015856	CGA	2	6	2507187	2507192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015856	A	6	6	2507197	2507202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015856	ACG	2	6	2507217	2507222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015856	CCGC	2	8	2507245	2507252	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6115	NC_015856	CAG	2	6	2507278	2507283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015856	GAG	2	6	2507296	2507301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_015856	TCA	2	6	2507302	2507307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_015856	GAAA	2	8	2507791	2507798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015856	CTA	2	6	2507808	2507813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_015856	GCG	2	6	2507920	2507925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_015856	CAA	2	6	2508047	2508052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_015856	CAA	2	6	2508098	2508103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_015856	A	6	6	2508106	2508111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015856	AAT	2	6	2508588	2508593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015856	AC	3	6	2508601	2508606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_015856	GCC	2	6	2508661	2508666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_015856	TCCA	2	8	2508678	2508685	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6128	NC_015856	CCAT	2	8	2508707	2508714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_015856	TGT	3	9	2508779	2508787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015856	TCT	2	6	2508827	2508832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015856	AGCC	2	8	2508860	2508867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_015856	GAC	2	6	2508898	2508903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6137	NC_015856	AGCC	2	8	2509173	2509180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_015856	GCAA	2	8	2509322	2509329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6139	NC_015856	CAGGA	2	10	2509330	2509339	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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6145	NC_015856	TCG	2	6	2509590	2509595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6163	NC_015856	CTGA	2	8	2510508	2510515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6254	NC_015856	TCTA	2	8	2538805	2538812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6255	NC_015856	GCC	2	6	2538829	2538834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_015856	AGG	2	6	2538884	2538889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_015856	CTG	2	6	2540846	2540851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6260	NC_015856	TTTTA	2	10	2541053	2541062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6263	NC_015856	TACAC	2	10	2542217	2542226	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6264	NC_015856	AAT	2	6	2542267	2542272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6368	NC_015856	TCCG	2	8	2635235	2635242	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6369	NC_015856	TAA	2	6	2635259	2635264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6372	NC_015856	CGC	2	6	2635349	2635354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6373	NC_015856	TTGAT	2	10	2635371	2635380	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6374	NC_015856	A	7	7	2635486	2635492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6375	NC_015856	GTT	2	6	2635525	2635530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6380	NC_015856	TG	3	6	2636007	2636012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6381	NC_015856	TGCAG	2	10	2636017	2636026	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6382	NC_015856	A	10	10	2636046	2636055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6383	NC_015856	GCA	2	6	2636062	2636067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6384	NC_015856	T	8	8	2642183	2642190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6385	NC_015856	CGT	2	6	2642201	2642206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6388	NC_015856	GCCA	2	8	2642412	2642419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6389	NC_015856	AGATG	2	10	2643603	2643612	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6390	NC_015856	GCT	2	6	2646785	2646790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6391	NC_015856	CTA	2	6	2648040	2648045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6392	NC_015856	ACT	2	6	2648078	2648083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6393	NC_015856	ATTA	3	12	2653443	2653454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6394	NC_015856	TTTC	2	8	2655547	2655554	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6395	NC_015856	CAT	2	6	2655589	2655594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6396	NC_015856	CCTT	2	8	2656792	2656799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6397	NC_015856	AATA	2	8	2656809	2656816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6398	NC_015856	GCT	2	6	2656889	2656894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6399	NC_015856	TTC	2	6	2656925	2656930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_015856	GAAT	2	8	2656941	2656948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_015856	CAGG	2	8	2656959	2656966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6402	NC_015856	AG	3	6	2656993	2656998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6403	NC_015856	CAGA	2	8	2657011	2657018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6404	NC_015856	TCG	2	6	2657068	2657073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6405	NC_015856	CTG	2	6	2657105	2657110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6412	NC_015856	CTG	2	6	2657365	2657370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6419	NC_015856	TTCTC	2	10	2658041	2658050	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6421	NC_015856	TGAT	2	8	2658083	2658090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6422	NC_015856	GTG	2	6	2658110	2658115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6424	NC_015856	TCCG	2	8	2658178	2658185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6425	NC_015856	ATAA	2	8	2658193	2658200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6426	NC_015856	TCC	2	6	2658221	2658226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6429	NC_015856	GCGCA	2	10	2658286	2658295	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6430	NC_015856	AGAC	2	8	2658373	2658380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6431	NC_015856	AGT	2	6	2658433	2658438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_015856	AAT	2	6	2658507	2658512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_015856	AGT	2	6	2658600	2658605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6435	NC_015856	TTG	2	6	2658688	2658693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6441	NC_015856	GCATC	2	10	2659163	2659172	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6442	NC_015856	A	6	6	2659249	2659254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6443	NC_015856	ACC	2	6	2659303	2659308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6451	NC_015856	T	7	7	2659501	2659507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6472	NC_015856	AAT	2	6	2672652	2672657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6482	NC_015856	A	6	6	2680156	2680161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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