MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Capnocytophaga canimorsus Cc5 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015846	TTTTGG	2	12	25882	25893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015846	TACAAG	2	12	27728	27739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015846	ACGAAT	2	12	82681	82692	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015846	TATTTT	2	12	149771	149782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015846	CAAAAG	2	12	156098	156109	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015846	TTTTAA	2	12	180211	180222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015846	TTTACT	2	12	187289	187300	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_015846	TAAATA	2	12	196976	196987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015846	TTTTTA	2	12	206289	206300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015846	TTTAGG	2	12	213718	213729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015846	AATTAA	2	12	265022	265033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015846	ATCTTA	2	12	273682	273693	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015846	TATTTT	2	12	291191	291202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015846	GCTCTT	2	12	292936	292947	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015846	TCTTTT	2	12	292977	292988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_015846	TTACCT	2	12	352760	352771	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015846	TTCTAT	2	12	387937	387948	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015846	TTATTT	2	12	395595	395606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015846	ATGACA	2	12	408487	408498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015846	GTAGCT	2	12	428079	428090	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015846	TACCAT	2	12	445680	445691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015846	AAATCA	2	12	531076	531087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015846	TAATTT	2	12	633712	633723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015846	TAAAAA	2	12	644414	644425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015846	ATTTTT	2	12	668649	668660	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015846	TGTATC	2	12	668750	668761	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015846	AGAACA	2	12	692463	692474	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015846	TGATTT	2	12	717221	717232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015846	ATAAAA	2	12	741127	741138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015846	ATAAAA	2	12	786391	786402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015846	ATTTTT	2	12	852668	852679	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015846	TCTGAA	2	12	872943	872954	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015846	ATAAAA	2	12	901556	901567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015846	TAAAAA	2	12	903560	903571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015846	GAATAA	2	12	940620	940631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015846	ATCTTT	2	12	1012133	1012144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015846	CCAAAT	2	12	1012367	1012378	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015846	TTTTTA	2	12	1029674	1029685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015846	CTTTTT	2	12	1030300	1030311	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015846	ATTTTT	2	12	1064507	1064518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015846	ACATTC	2	12	1070363	1070374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015846	CAAAAA	2	12	1071600	1071611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_015846	CTTTAA	2	12	1074435	1074446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015846	TAATTT	2	12	1074706	1074717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015846	TATTTT	2	12	1086729	1086740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015846	TAAAGT	2	12	1101134	1101145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015846	TTTATA	2	12	1133931	1133942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015846	AAGTAA	2	12	1136039	1136050	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015846	TTTAAC	2	12	1139177	1139188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015846	AATTAA	2	12	1174602	1174613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015846	TAATTT	2	12	1178596	1178607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015846	AGTAAT	2	12	1207706	1207717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015846	ATCAAA	2	12	1220782	1220793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015846	TTCCTA	2	12	1233179	1233190	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015846	TCAAAA	2	12	1237799	1237810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015846	AAATAC	2	12	1294712	1294723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015846	TGTTTT	2	12	1333183	1333194	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015846	TAAAAA	2	12	1361778	1361789	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015846	ATTTTT	2	12	1382640	1382651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015846	TATAGA	2	12	1382826	1382837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015846	CAATAA	2	12	1398927	1398938	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015846	TTTACC	2	12	1399025	1399036	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015846	TACAAA	2	12	1424482	1424493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015846	ATTTTT	2	12	1434042	1434053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015846	AAAATA	2	12	1451344	1451355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015846	TTATTT	2	12	1451376	1451387	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015846	AAAACA	2	12	1459120	1459131	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015846	TTAAAG	2	12	1543384	1543395	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015846	AATTAA	2	12	1543860	1543871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015846	ACTTCG	2	12	1564732	1564743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015846	ACTTCG	2	12	1567106	1567117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015846	AAAAGA	2	12	1567171	1567182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015846	TGGAAA	2	12	1578224	1578235	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015846	AATTAA	2	12	1589202	1589213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015846	CTTAAC	2	12	1624002	1624013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015846	TAAAAA	2	12	1631564	1631575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015846	CTGAAA	2	12	1638484	1638495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015846	TATTTT	2	12	1645380	1645391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015846	AATTAA	2	12	1659035	1659046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015846	CAAAAT	2	12	1667773	1667784	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015846	ATTTTT	2	12	1695242	1695253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015846	TAAAAT	2	12	1729717	1729728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015846	GACTTC	2	12	1741445	1741456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015846	TACAAA	2	12	1765515	1765526	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015846	ATTAAA	2	12	1861179	1861190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015846	CAAAAA	2	12	1865310	1865321	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015846	TTAAAT	2	12	1868179	1868190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015846	GGGGAT	2	12	1882942	1882953	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015846	TATTTT	2	12	1911300	1911311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015846	AAAAAC	2	12	1941756	1941767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015846	ATAATT	2	12	1951186	1951197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015846	AAAACT	2	12	1957606	1957617	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015846	AAAACT	2	12	1958984	1958995	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015846	TTTGTT	2	12	1962517	1962528	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015846	GATATT	2	12	1982777	1982788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015846	TCGTAT	2	12	2036374	2036385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015846	ATATTA	2	12	2058911	2058922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015846	GTTTTT	2	12	2086621	2086632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015846	TATTTT	2	12	2116368	2116379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015846	TAATTT	2	12	2123681	2123692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015846	AAAAAT	2	12	2163975	2163986	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015846	CACTAA	2	12	2168554	2168565	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015846	ATTTCT	2	12	2196521	2196532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_015846	AATGAA	2	12	2203887	2203898	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015846	TTTATT	2	12	2216062	2216073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015846	TGAAAA	2	12	2216310	2216321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015846	AATCAG	2	12	2238388	2238399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015846	TGTTCT	2	12	2251855	2251866	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015846	ATTATA	2	12	2270942	2270953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015846	ATAACA	2	12	2273257	2273268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015846	ACAAAA	2	12	2280613	2280624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_015846	GGTAAA	2	12	2308126	2308137	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015846	AAAACA	2	12	2316708	2316719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_015846	TATTGG	2	12	2382596	2382607	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015846	TTTTCA	2	12	2405471	2405482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_015846	TTTGTT	2	12	2420437	2420448	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015846	AAACAG	2	12	2425231	2425242	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_015846	AAATAA	2	12	2463150	2463161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015846	TTAAAA	2	12	2466859	2466870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015846	GATTAC	2	12	2479422	2479433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_015846	AAAACA	2	12	2532098	2532109	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_015846	TACCTT	2	12	2547759	2547770	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.