MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Capnocytophaga canimorsus Cc5 chromosome

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015846	ATTTC	2	10	1048	1057	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015846	CTATT	2	10	2459	2468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015846	TTTAT	2	10	5959	5968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015846	TTTGT	2	10	9648	9657	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015846	ATAAA	2	10	9888	9897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015846	ATTAA	2	10	25974	25983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015846	TTTTA	2	10	25989	25998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015846	ATTTT	2	10	37817	37826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015846	TAAAA	2	10	39422	39431	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015846	ATAAA	2	10	41940	41949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015846	TTTCA	2	10	60159	60168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015846	TAAAA	2	10	61036	61045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015846	ATTTT	2	10	63631	63640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015846	AATAG	2	10	83125	83134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015846	TTTTA	2	10	93111	93120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015846	ATTTT	2	10	97311	97320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015846	AAAAG	2	10	102005	102014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015846	CCTTT	2	10	102408	102417	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_015846	TAATT	2	10	106174	106183	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015846	ATTTT	2	10	111308	111317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015846	TTATA	2	10	125957	125966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015846	AAAGG	2	10	132629	132638	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015846	CCTTT	2	10	132657	132666	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015846	ATAAG	2	10	135413	135422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015846	AAACA	2	10	141602	141611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015846	CCCTA	2	10	142877	142886	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015846	AAACT	2	10	151610	151619	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015846	CAAAG	2	10	153394	153403	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015846	TAAAA	2	10	153546	153555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015846	TAAAA	2	10	155990	155999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015846	TTTGG	2	10	163478	163487	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015846	AGCTG	2	10	177925	177934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_015846	AATCA	2	10	182782	182791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015846	AATTT	2	10	184958	184967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015846	AATTT	2	10	187338	187347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015846	AAAAT	2	10	188880	188889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015846	AAATA	2	10	190162	190171	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015846	CTTTG	2	10	190339	190348	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015846	TATTT	2	10	191718	191727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015846	AAAGA	2	10	191750	191759	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015846	TTTAG	2	10	196859	196868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015846	AATTT	2	10	202372	202381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015846	AACAG	2	10	208803	208812	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015846	TAAAA	2	10	213691	213700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015846	TAATT	2	10	224633	224642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015846	TATTT	2	10	230809	230818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015846	TATTT	2	10	230973	230982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015846	GTAAA	2	10	233724	233733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015846	ATTTT	2	10	267924	267933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015846	AAATT	2	10	267984	267993	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015846	TAAAC	2	10	273650	273659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015846	AAACC	2	10	282589	282598	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015846	CAAAA	2	10	282888	282897	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015846	TATTC	2	10	302630	302639	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015846	TAAAA	2	10	308729	308738	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015846	ATTTT	2	10	309194	309203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015846	TTTTC	2	10	311022	311031	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015846	ACAAA	2	10	311188	311197	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015846	TTTCC	2	10	311309	311318	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015846	TTATA	2	10	382069	382078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015846	TTTTG	2	10	394126	394135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015846	CAAAT	2	10	394234	394243	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015846	AATTT	2	10	398983	398992	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015846	GTCCT	2	10	404573	404582	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015846	TAAAA	2	10	412117	412126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015846	TTTTC	2	10	416218	416227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015846	AATAA	2	10	416785	416794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015846	GATAA	2	10	417972	417981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015846	CTTTT	2	10	421441	421450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015846	AAAAT	2	10	423651	423660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015846	TATTT	2	10	435264	435273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015846	GAAAA	2	10	437239	437248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015846	AATTA	2	10	444964	444973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015846	TAAAA	2	10	444974	444983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015846	GCACG	2	10	445290	445299	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_015846	ATTAT	2	10	471643	471652	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015846	TTACA	2	10	478874	478883	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015846	ATAAA	2	10	479181	479190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015846	ACGTA	2	10	479347	479356	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015846	ATTTG	2	10	482186	482195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015846	GAGAA	2	10	485375	485384	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015846	ATTCT	2	10	493269	493278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015846	TAAAA	2	10	493987	493996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015846	AAAAT	2	10	494017	494026	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015846	TTTTG	2	10	494036	494045	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015846	AAAGA	2	10	503800	503809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015846	AAATC	2	10	513658	513667	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015846	TAATA	2	10	515488	515497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015846	ATTTT	2	10	517866	517875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015846	TGTAG	2	10	538860	538869	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015846	TCGGA	2	10	539475	539484	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015846	CTGAA	2	10	540526	540535	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_015846	AGAAA	2	10	541621	541630	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015846	CCGTA	2	10	541936	541945	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_015846	ATTGA	2	10	542192	542201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015846	TGGGA	2	10	543033	543042	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015846	AACGG	2	10	544836	544845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015846	TGGGG	2	10	545935	545944	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015846	TAATT	2	10	547818	547827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015846	AGGGG	2	10	562476	562485	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015846	CTTGT	2	10	565431	565440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015846	TTTCA	2	10	592470	592479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015846	GCAAT	2	10	599617	599626	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015846	TATTT	2	10	603246	603255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015846	ATTTT	2	10	618857	618866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015846	GCACA	12	60	623975	624034	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015846	TAAAT	2	10	628465	628474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015846	ATTCA	2	10	631898	631907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015846	TAAAA	2	10	634154	634163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015846	ATTTA	2	10	640080	640089	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015846	GATTT	2	10	640174	640183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015846	AAATC	2	10	646932	646941	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015846	ACCTT	2	10	662552	662561	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_015846	CTTTT	2	10	670351	670360	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015846	AGATT	2	10	678307	678316	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015846	TTTTG	2	10	685059	685068	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015846	AACAA	2	10	692448	692457	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015846	TAACT	2	10	692599	692608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015846	TTGTT	2	10	695269	695278	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015846	AATGA	2	10	695299	695308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015846	AATTT	2	10	702284	702293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015846	ATTAT	2	10	705154	705163	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015846	ATTCA	2	10	708270	708279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015846	TAACT	2	10	713512	713521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015846	ATTTT	2	10	740960	740969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015846	TGTAT	2	10	741103	741112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015846	TTTTC	2	10	743413	743422	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015846	ATATA	2	10	750943	750952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015846	TTTTA	2	10	760246	760255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015846	TGTAA	2	10	760301	760310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015846	TAAAT	2	10	764963	764972	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015846	TGTTT	2	10	778642	778651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015846	TGGTA	2	10	778735	778744	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015846	ATGAA	2	10	783836	783845	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015846	AAAAC	2	10	789460	789469	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015846	CTACA	2	10	796174	796183	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015846	TGTAG	2	10	798758	798767	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015846	TCGGA	2	10	799375	799384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_015846	CTGAA	2	10	800413	800422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015846	AGAAA	2	10	801508	801517	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015846	CCGTA	2	10	801823	801832	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_015846	ATTGA	2	10	802079	802088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015846	TGGGA	2	10	802921	802930	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015846	AAGAA	2	10	815585	815594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015846	AAAAC	2	10	815622	815631	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015846	AAAAG	2	10	822745	822754	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015846	TAATA	2	10	822856	822865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015846	AAATA	2	10	828461	828470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015846	ATTTT	2	10	828498	828507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015846	TTTTG	2	10	840721	840730	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015846	ATTTT	2	10	854275	854284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015846	AAAAT	2	10	863800	863809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015846	GTTTT	2	10	911464	911473	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_015846	ATATT	2	10	951164	951173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015846	ATTTT	2	10	962729	962738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_015846	TTTTA	2	10	1056713	1056722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015846	ATTTT	2	10	1060171	1060180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_015846	AGAAA	2	10	1079976	1079985	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015846	ATTGA	2	10	1080547	1080556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015846	TGGGA	2	10	1081388	1081397	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015846	ATTTT	2	10	1082038	1082047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.