MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 1233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015744	GAA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015744	TAA	2	6	257	262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015744	ACA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015744	TCA	2	6	355	360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015744	ATA	2	6	412	417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015744	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015744	TTG	2	6	493	498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015744	ATG	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015744	TTC	2	6	635	640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015744	AAG	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015744	GAA	3	9	723	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015744	TGA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015744	GGT	2	6	812	817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015744	GCT	2	6	855	860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015744	GGT	2	6	871	876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015744	TAA	2	6	892	897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015744	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015744	GAA	2	6	1015	1020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015744	GCA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015744	TAA	3	9	2919	2927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015744	CAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015744	TTG	2	6	5206	5211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015744	GAA	2	6	5242	5247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015744	ACA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015744	AGC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015744	TAT	2	6	13667	13672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015744	TGA	2	6	16295	16300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015744	TTC	2	6	16521	16526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015744	CGG	2	6	16540	16545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015744	GAA	2	6	16629	16634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015744	TTC	2	6	16671	16676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015744	TCA	2	6	16706	16711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015744	TTC	2	6	16850	16855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015744	TGC	2	6	16864	16869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015744	GAA	2	6	16896	16901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015744	CGA	2	6	20835	20840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015744	TAT	2	6	30023	30028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015744	TCT	2	6	32160	32165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015744	CGG	2	6	32294	32299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015744	AGA	2	6	32331	32336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015744	CTT	2	6	32493	32498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015744	CTT	2	6	32897	32902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015744	GAA	2	6	32919	32924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015744	TAA	2	6	32942	32947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015744	GAA	2	6	32951	32956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015744	AGG	2	6	33275	33280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015744	AAG	2	6	34305	34310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015744	TCT	2	6	34698	34703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015744	AAT	2	6	38157	38162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015744	GTA	2	6	38170	38175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015744	TCT	2	6	38186	38191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015744	ATG	2	6	38409	38414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015744	AGA	2	6	38435	38440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015744	ATG	2	6	39698	39703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015744	GCT	2	6	39874	39879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015744	TTC	2	6	43082	43087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015744	TAT	2	6	44872	44877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015744	TAG	2	6	46134	46139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015744	GTC	2	6	53186	53191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015744	AGG	2	6	53288	53293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015744	TGA	2	6	54974	54979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015744	TCT	2	6	58452	58457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015744	TTG	2	6	58477	58482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015744	AGG	2	6	58494	58499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015744	TTA	2	6	58578	58583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015744	TTA	2	6	58587	58592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015744	GGC	2	6	59873	59878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015744	AGC	2	6	59951	59956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015744	GAA	2	6	60045	60050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015744	CCT	2	6	60062	60067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015744	TTG	2	6	60186	60191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015744	GTT	2	6	60240	60245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015744	TAC	2	6	60367	60372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015744	ATA	2	6	65016	65021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015744	TGA	2	6	65064	65069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015744	AGG	2	6	65073	65078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015744	TGT	2	6	69701	69706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015744	CTA	2	6	72467	72472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015744	AGG	2	6	72562	72567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015744	TTC	2	6	74627	74632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015744	AGG	2	6	75986	75991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015744	AAG	2	6	76117	76122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015744	TAA	2	6	76134	76139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015744	CGG	2	6	76168	76173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015744	ATA	2	6	78435	78440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015744	GAA	2	6	78451	78456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015744	AGC	2	6	81638	81643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015744	GAT	2	6	81689	81694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015744	AAG	2	6	81705	81710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015744	GAA	2	6	81719	81724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015744	CTT	2	6	81818	81823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015744	AAG	2	6	81861	81866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015744	TTG	2	6	84394	84399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015744	TAT	2	6	88025	88030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015744	TAA	2	6	88034	88039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015744	AAT	2	6	89561	89566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015744	GAA	2	6	89570	89575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015744	ATG	2	6	92888	92893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015744	TGA	2	6	94314	94319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015744	GAA	2	6	94382	94387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015744	GAA	2	6	94539	94544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015744	ATT	2	6	101043	101048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015744	GAT	2	6	101125	101130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015744	GAA	3	9	105806	105814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015744	TCC	2	6	110450	110455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_015744	TCT	2	6	111656	111661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015744	GAT	2	6	114326	114331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015744	GAG	2	6	114430	114435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015744	CTT	2	6	114438	114443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015744	ATG	2	6	114469	114474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015744	GTT	2	6	114521	114526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015744	TTA	2	6	114555	114560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015744	CTA	2	6	119779	119784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015744	CTC	2	6	120549	120554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015744	AGA	2	6	124873	124878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015744	CTT	2	6	126288	126293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015744	AAG	2	6	126401	126406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015744	TAA	2	6	126588	126593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015744	TAC	2	6	126608	126613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015744	AGT	2	6	127399	127404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015744	AGT	2	6	133295	133300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015744	AAG	2	6	133318	133323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015744	ACG	2	6	133329	133334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015744	TAA	2	6	133872	133877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015744	GGC	2	6	133929	133934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015744	AAG	2	6	134096	134101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015744	TGG	2	6	134153	134158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015744	GCC	2	6	134206	134211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015744	CGC	2	6	134298	134303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015744	AGA	2	6	134354	134359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015744	AAG	2	6	134395	134400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015744	CAG	2	6	134419	134424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015744	GAA	2	6	134611	134616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015744	GCC	2	6	134779	134784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015744	GAG	2	6	134786	134791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015744	TGC	2	6	134949	134954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015744	GTC	2	6	134961	134966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015744	AGG	2	6	135073	135078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015744	CAT	2	6	135309	135314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015744	TGA	2	6	135380	135385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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