MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 2621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015744	AAG	2	6	362390	362395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015744	T	8	8	362480	362487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015744	AG	3	6	364420	364425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015744	AAG	2	6	364437	364442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015744	CT	3	6	364486	364491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015744	TGCAA	2	10	364497	364506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_015744	ATG	2	6	364547	364552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015744	GAG	2	6	364561	364566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015744	T	6	6	364606	364611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015744	A	7	7	364752	364758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015744	GAT	2	6	364776	364781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015744	AAG	2	6	364782	364787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015744	AG	3	6	364816	364821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015744	A	6	6	364822	364827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015744	GGA	2	6	364834	364839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015744	TAA	2	6	364932	364937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015744	AAG	2	6	365285	365290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015744	TC	3	6	365908	365913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_015744	TGTT	2	8	365917	365924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015744	A	7	7	365956	365962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015744	AATA	2	8	366155	366162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015744	ACT	2	6	366163	366168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_015744	AAG	2	6	368014	368019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015744	AAGT	2	8	370076	370083	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015744	TAA	2	6	370085	370090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015744	GAA	2	6	370101	370106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015744	GAAGA	2	10	370109	370118	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015744	G	9	9	370119	370127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015744	AG	3	6	370144	370149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015744	TGT	2	6	370163	370168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015744	T	8	8	370709	370716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015744	GTC	2	6	370841	370846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1035	NC_015744	TAT	2	6	370892	370897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_015744	TAA	2	6	373510	373515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_015744	GAT	2	6	374075	374080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_015744	T	6	6	374119	374124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015744	TATT	2	8	374126	374133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015744	AAG	2	6	374153	374158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015744	AAT	2	6	374180	374185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_015744	ATT	2	6	374192	374197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015744	T	6	6	375178	375183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015744	T	6	6	375193	375198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_015744	TGTT	2	8	375994	376001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015744	AATTT	2	10	376002	376011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015744	T	6	6	376009	376014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015744	TAAT	2	8	376038	376045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015744	GA	3	6	377547	377552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015744	T	6	6	379265	379270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015744	T	6	6	381008	381013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015744	T	6	6	381035	381040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015744	AAG	2	6	382819	382824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_015744	A	9	9	382851	382859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015744	T	7	7	382871	382877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_015744	T	7	7	393863	393869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015744	CTTGC	2	10	393889	393898	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1094	NC_015744	GATA	2	8	393913	393920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_015744	ATCTAG	2	12	398590	398601	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1102	NC_015744	AAAAG	2	10	398639	398648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015744	CTT	2	6	398671	398676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015744	ATCAA	2	10	400337	400346	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_015744	A	6	6	400380	400385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015744	GAG	3	9	400431	400439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015744	AGG	2	6	400462	400467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015744	A	6	6	400475	400480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015744	ACC	2	6	400513	400518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_015744	A	8	8	400594	400601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015744	A	6	6	400611	400616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015744	A	7	7	400619	400625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015744	TTA	2	6	401165	401170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015744	T	7	7	401194	401200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015744	T	6	6	401272	401277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_015744	T	6	6	401297	401302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1119	NC_015744	TAG	2	6	401383	401388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1121	NC_015744	GTT	2	6	401435	401440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015744	GTT	2	6	401477	401482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015744	ATT	2	6	401486	401491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_015744	TAG	2	6	401688	401693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1131	NC_015744	GTA	2	6	407058	407063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015744	TTTGT	2	10	407076	407085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015744	AGC	2	6	407130	407135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015744	TA	3	6	407182	407187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015744	AAT	2	6	407197	407202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015744	AT	3	6	407201	407206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_015744	AGC	2	6	407269	407274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_015744	ATG	2	6	409287	409292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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