MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 1109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015737	CTTG	2	8	28	35	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015737	AACC	2	8	13874	13881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015737	GCAG	2	8	15860	15867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015737	CCTG	2	8	15868	15875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015737	GAAA	2	8	20975	20982	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015737	AGAT	2	8	23645	23652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015737	AACA	2	8	28056	28063	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015737	ATCA	2	8	29140	29147	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015737	AATT	2	8	29276	29283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015737	CAAA	2	8	29900	29907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015737	TCTT	2	8	30267	30274	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015737	GAAA	2	8	32180	32187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015737	AACG	2	8	33328	33335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015737	CCGT	2	8	33609	33616	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015737	TCCT	2	8	38902	38909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015737	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015737	CCGC	2	8	43924	43931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_015737	TCTG	2	8	46730	46737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015737	TGTC	2	8	47552	47559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015737	CATT	2	8	47666	47673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_015737	TTTC	2	8	49427	49434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015737	ATCT	2	8	53674	53681	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015737	CCTT	2	8	58920	58927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015737	TCTG	2	8	60754	60761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015737	TTTC	2	8	60783	60790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015737	CTGC	2	8	60801	60808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015737	ACCT	2	8	63039	63046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015737	TCTG	2	8	63570	63577	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015737	TTTC	2	8	63599	63606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015737	TCCT	2	8	66038	66045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015737	TATG	2	8	66064	66071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015737	ATCT	2	8	66091	66098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015737	TAAA	2	8	66239	66246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015737	CTTT	2	8	66592	66599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015737	AATG	2	8	66680	66687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015737	TCAT	2	8	66837	66844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015737	TCAA	2	8	67051	67058	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015737	GCAG	2	8	70468	70475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015737	CCTT	2	8	71764	71771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015737	TATT	2	8	71844	71851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015737	CTTT	2	8	74919	74926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015737	AACA	2	8	75003	75010	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015737	CTTT	2	8	79151	79158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015737	TCTT	2	8	83003	83010	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015737	CCAT	2	8	87533	87540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015737	GAAT	2	8	87550	87557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015737	CATT	2	8	87568	87575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015737	GGAA	2	8	92179	92186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015737	CGAG	2	8	92457	92464	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015737	CTTG	2	8	92736	92743	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015737	ATTT	2	8	93242	93249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015737	CATA	2	8	98603	98610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015737	AACG	2	8	99716	99723	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015737	TTCT	2	8	103155	103162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015737	ATTT	2	8	106884	106891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015737	ATTC	2	8	118220	118227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015737	CCAG	2	8	118251	118258	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015737	GATT	2	8	118498	118505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015737	TGCA	2	8	118534	118541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015737	CCTG	2	8	127314	127321	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015737	ACAG	2	8	127338	127345	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015737	CAAT	2	8	132810	132817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015737	CTTA	2	8	140977	140984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015737	TTAC	2	8	141965	141972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015737	CGTG	2	8	148278	148285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015737	TTTA	2	8	149815	149822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015737	CTTT	2	8	158223	158230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015737	TGCA	2	8	161418	161425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015737	CTTT	2	8	164068	164075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015737	CTTT	2	8	165722	165729	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015737	CCGG	2	8	165746	165753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015737	TCCT	2	8	167561	167568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015737	CTTT	2	8	167581	167588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015737	ATGT	2	8	167911	167918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015737	TCAC	2	8	168385	168392	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015737	TTGT	2	8	168475	168482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015737	TTTC	2	8	173711	173718	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015737	ATTG	2	8	174604	174611	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015737	CGTG	2	8	176134	176141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015737	GGAC	2	8	176499	176506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015737	GACC	2	8	176605	176612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015737	GCTT	2	8	177047	177054	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015737	GTCC	2	8	177272	177279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015737	TGAA	2	8	178827	178834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015737	CGCA	2	8	179359	179366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015737	GCAC	2	8	179661	179668	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015737	TCGC	2	8	179691	179698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015737	TTTC	2	8	179719	179726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015737	TCTT	2	8	179930	179937	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015737	ACGG	2	8	180012	180019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015737	CTTG	2	8	180085	180092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015737	TCTT	2	8	180175	180182	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015737	CTCC	2	8	180705	180712	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_015737	CCTC	2	8	180908	180915	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_015737	AACT	2	8	181888	181895	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015737	TTCG	2	8	182087	182094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_015737	TGCT	2	8	182323	182330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015737	ATTT	2	8	182904	182911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015737	TGAA	2	8	193936	193943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015737	CCCG	2	8	194251	194258	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_015737	TACA	2	8	194279	194286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015737	TCTG	2	8	206845	206852	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015737	TATT	2	8	214577	214584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015737	TGTT	2	8	222478	222485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015737	CTGC	2	8	223637	223644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015737	AATA	2	8	233609	233616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015737	TTTG	2	8	233830	233837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015737	CAAA	2	8	233906	233913	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015737	GTCA	2	8	234640	234647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015737	CGGC	2	8	234650	234657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015737	CAAG	2	8	236669	236676	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015737	ATAC	2	8	239816	239823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015737	TTTC	2	8	241667	241674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015737	GCAG	2	8	241866	241873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015737	TCCT	2	8	242953	242960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_015737	AAGG	2	8	245234	245241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015737	ATCC	2	8	256275	256282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015737	TCTG	2	8	259510	259517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015737	TCAG	2	8	259541	259548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015737	GCCG	2	8	265104	265111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015737	TGTC	2	8	268547	268554	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015737	TCTT	2	8	269011	269018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015737	TTTC	2	8	269864	269871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015737	CTGT	2	8	271227	271234	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015737	TTGT	2	8	279902	279909	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015737	TACT	2	8	287995	288002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015737	TGCA	2	8	288139	288146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_015737	CCTG	2	8	290851	290858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015737	GATT	2	8	294218	294225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015737	TCTG	2	8	305730	305737	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015737	TTTC	2	8	306800	306807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015737	ATGA	2	8	306910	306917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015737	CCGC	2	8	310164	310171	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_015737	TGAT	2	8	310858	310865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015737	TAGT	2	8	312747	312754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015737	AAAG	2	8	313810	313817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015737	TCGA	2	8	314956	314963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015737	TCTG	2	8	316440	316447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015737	AAAT	2	8	316509	316516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015737	AGGA	2	8	316662	316669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015737	TGTT	2	8	316678	316685	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015737	TGTT	2	8	316697	316704	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015737	TCCT	2	8	325886	325893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015737	CGAA	2	8	328142	328149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_015737	CTGC	2	8	329371	329378	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015737	CCGG	2	8	332009	332016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015737	AGAA	2	8	332063	332070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015737	TGTT	2	8	335262	335269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015737	TCTT	2	8	335273	335280	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015737	CCGG	2	8	343697	343704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_015737	GAAA	2	8	351025	351032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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