MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCIT chromosome

Total Repeats: 636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015736	TGG	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015736	GCA	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015736	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015736	CCT	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015736	CAG	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015736	ATG	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015736	TGC	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015736	TGC	2	6	3933	3938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015736	AAG	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015736	GCC	2	6	3974	3979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_015736	CCT	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_015736	GCA	2	6	4170	4175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015736	GCA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015736	GTA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015736	TGC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015736	ACG	2	6	4898	4903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015736	GCT	2	6	4936	4941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015736	GCA	2	6	6451	6456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015736	GCT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015736	CTG	2	6	8511	8516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015736	GGA	2	6	8543	8548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015736	TGG	2	6	9924	9929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015736	CTG	2	6	10049	10054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015736	AGC	2	6	10114	10119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015736	TGC	2	6	10278	10283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015736	CGC	2	6	10360	10365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015736	CAG	2	6	10397	10402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015736	CGT	2	6	10461	10466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015736	TGG	2	6	10495	10500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015736	TGC	2	6	10548	10553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015736	GCA	2	6	10613	10618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015736	GTT	2	6	10662	10667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015736	CTT	2	6	10849	10854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015736	ATG	2	6	10899	10904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015736	GAT	2	6	10988	10993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015736	GCC	2	6	11367	11372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015736	GCA	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015736	AGC	2	6	11724	11729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015736	CGG	2	6	11746	11751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015736	CAT	2	6	11758	11763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015736	AGG	2	6	11772	11777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015736	GCG	2	6	12195	12200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015736	GAG	2	6	13415	13420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015736	ACG	2	6	15416	15421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015736	CTA	2	6	15507	15512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015736	AGC	2	6	15599	15604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015736	AGA	2	6	15714	15719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015736	CGC	2	6	15730	15735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_015736	CCT	3	9	15748	15756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015736	TCC	2	6	15829	15834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015736	CGC	2	6	15875	15880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015736	GCA	2	6	15933	15938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015736	GTC	2	6	17445	17450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015736	CGT	2	6	17510	17515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015736	CAT	2	6	17614	17619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015736	CCG	2	6	17640	17645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_015736	GAA	2	6	17724	17729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015736	GAA	2	6	17781	17786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015736	GCG	2	6	17854	17859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015736	CAG	2	6	17911	17916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015736	CGC	2	6	18001	18006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015736	AGA	2	6	18066	18071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015736	TGC	2	6	18121	18126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015736	GCA	2	6	18192	18197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015736	TCT	2	6	20608	20613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015736	CGG	2	6	20633	20638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015736	GTT	2	6	20685	20690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015736	GCA	2	6	20922	20927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015736	GTT	2	6	21092	21097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015736	CCT	2	6	21108	21113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015736	CGT	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015736	GCT	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015736	GCA	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015736	TGC	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015736	GCA	2	6	21327	21332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015736	CAC	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_015736	ACG	2	6	21432	21437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015736	GGA	2	6	21472	21477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015736	ATG	2	6	21484	21489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015736	TGG	2	6	21519	21524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015736	CGA	2	6	21544	21549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015736	TAG	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015736	ACT	2	6	21669	21674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015736	GTC	2	6	21721	21726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015736	AAC	2	6	21750	21755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015736	TGC	2	6	21768	21773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015736	GCA	2	6	21802	21807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015736	GGA	2	6	21951	21956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015736	AAC	2	6	21996	22001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015736	ATG	2	6	22081	22086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015736	CTG	2	6	22935	22940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015736	CAA	2	6	23007	23012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015736	GAC	2	6	23035	23040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015736	TGC	2	6	23127	23132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015736	AGG	2	6	23261	23266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015736	GCC	2	6	23319	23324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015736	ACG	2	6	23367	23372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015736	CAG	2	6	23519	23524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015736	TGC	2	6	23555	23560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015736	TGG	2	6	23915	23920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015736	CCT	2	6	23946	23951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015736	TGC	2	6	23978	23983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015736	GCG	2	6	23993	23998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015736	CAA	2	6	24080	24085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015736	ACG	2	6	24101	24106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015736	ACG	2	6	24160	24165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015736	TGC	2	6	24228	24233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015736	CTT	2	6	24254	24259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015736	GCG	2	6	24337	24342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015736	GTT	2	6	24404	24409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015736	ACG	2	6	24433	24438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_015736	AGT	2	6	24458	24463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015736	ACT	2	6	24480	24485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015736	CAA	2	6	24567	24572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015736	CGT	2	6	24633	24638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015736	TGC	2	6	24686	24691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015736	AGC	2	6	24712	24717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015736	TCG	2	6	24887	24892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015736	CTG	2	6	24916	24921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015736	TGC	2	6	25017	25022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015736	GCT	2	6	25114	25119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015736	GAT	2	6	25150	25155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015736	GCT	2	6	25156	25161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015736	GAG	2	6	25231	25236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015736	AGC	2	6	25241	25246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015736	ACA	2	6	25347	25352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015736	GCA	2	6	25488	25493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015736	GCC	2	6	25522	25527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015736	TGG	2	6	25540	25545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015736	CGG	2	6	25617	25622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015736	TGA	2	6	25671	25676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015736	CGC	2	6	25700	25705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_015736	TGC	2	6	26492	26497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015736	AGC	2	6	26837	26842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015736	TGG	2	6	28671	28676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015736	CTG	2	6	28796	28801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015736	CCT	2	6	28867	28872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_015736	TGG	2	6	28928	28933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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