MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCIT chromosome

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015735	CTTTTG	2	12	5219	5230	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015735	ATTTCA	2	12	6191	6202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015735	ATGCTA	2	12	8409	8420	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015735	AATTTT	2	12	22578	22589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015735	TAAAAT	2	12	24741	24752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015735	TTATAT	2	12	26080	26091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015735	CATACT	2	12	31383	31394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015735	TAACAA	2	12	43821	43832	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015735	TTAACC	2	12	63667	63678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015735	TTAACA	2	12	82286	82297	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015735	TATAGG	2	12	92441	92452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015735	CATAAA	2	12	103940	103951	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_015735	GTAAAA	2	12	104946	104957	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015735	TGTAAT	2	12	122590	122601	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015735	GCCACC	2	12	134865	134876	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015735	GAAAAC	2	12	147262	147273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015735	AAAAAT	2	12	156427	156438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015735	CGCACC	2	12	176572	176583	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015735	TATTTA	2	12	211501	211512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015735	GGCAAT	2	12	212144	212155	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_015735	AATACT	2	12	217742	217753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015735	AGCTTC	2	12	222796	222807	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015735	CTAAAA	2	12	222814	222825	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015735	AGTCGC	2	12	254751	254762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015735	AGCTAG	2	12	256776	256787	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015735	AATATC	2	12	258757	258768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015735	GCATAA	2	12	261802	261813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_015735	TTTATG	2	12	265624	265635	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015735	GGCGGA	2	12	266321	266332	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_015735	AGTGCA	2	12	269098	269109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015735	TTTAAT	2	12	293054	293065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015735	TTAGCA	2	12	308121	308132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_015735	GTATGC	2	12	308206	308217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015735	TGAAAT	2	12	310340	310351	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015735	AGCAAA	2	12	311310	311321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015735	ATTAGC	2	12	319319	319330	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015735	TAACTA	2	12	323618	323629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015735	TTTAGT	2	12	323780	323791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015735	TGTAGA	2	12	324182	324193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015735	CTAGGA	2	12	327765	327776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015735	TATATG	2	12	329744	329755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015735	CTGCGG	2	12	331995	332006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015735	CAGTAA	2	12	332114	332125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_015735	GCAAAC	2	12	334267	334278	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015735	ATTAAT	2	12	339169	339180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015735	GTACCA	2	12	339948	339959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015735	AATATT	2	12	343396	343407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015735	AGGTAA	2	12	349818	349829	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015735	TGTTAC	2	12	354831	354842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015735	GTTACT	2	12	355073	355084	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_015735	CAGCTA	2	12	356244	356255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015735	TTGCTG	2	12	358078	358089	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015735	GAAGCT	2	12	369568	369579	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015735	TTTTAC	2	12	383219	383230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015735	TACTTC	2	12	391924	391935	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015735	TTATCA	2	12	400345	400356	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015735	GATGGT	2	12	408860	408871	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015735	TAGTGG	2	12	408883	408894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015735	ATTTTT	2	12	408990	409001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015735	GTAATA	2	12	409025	409036	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015735	ATTAAG	2	12	417950	417961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015735	GATAAT	2	12	422328	422339	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015735	CCCTGG	2	12	422432	422443	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015735	TAGCTG	2	12	428342	428353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015735	AGAACT	2	12	443328	443339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_015735	CATCTA	2	12	445536	445547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015735	TTTGGT	2	12	465449	465460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015735	AGTACC	2	12	478880	478891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015735	TTCAAT	2	12	480364	480375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015735	GTCAGT	2	12	482396	482407	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015735	AGTAAA	2	12	486609	486620	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015735	GGTGAC	2	12	489627	489638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015735	GGATAA	2	12	490116	490127	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015735	ACAGTA	2	12	503142	503153	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015735	CTTTTA	2	12	505602	505613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015735	AATGGT	2	12	531607	531618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015735	CAAGAA	2	12	531661	531672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015735	ATCGTA	2	12	531981	531992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.