MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCIT chromosome

Total Repeats: 198

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015735	GTGCT	2	10	4501	4510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015735	CCTAT	2	10	6092	6101	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_015735	GCCTT	2	10	6858	6867	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_015735	TCGGT	2	10	7483	7492	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015735	GCATA	2	10	8320	8329	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015735	TTTAA	2	10	10478	10487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015735	TAAAT	2	10	10647	10656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015735	AAAAT	2	10	10921	10930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015735	TTAAA	2	10	14123	14132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015735	AAACT	2	10	14847	14856	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015735	TAAAA	2	10	17566	17575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015735	CTTTT	2	10	22299	22308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015735	AATTT	2	10	22783	22792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015735	TAGAA	2	10	23925	23934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015735	TATAA	2	10	24005	24014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015735	ATAGT	2	10	24271	24280	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015735	CATAA	2	10	25691	25700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_015735	AAATT	2	10	25752	25761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015735	AAGAA	2	10	25895	25904	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015735	AGCTG	2	10	26465	26474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015735	TTAAT	2	10	29034	29043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015735	TTATA	2	10	31095	31104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015735	CAAAT	2	10	31254	31263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015735	CTGAA	2	10	33942	33951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015735	AACAG	2	10	36913	36922	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015735	ATAAC	2	10	37291	37300	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015735	GTATT	2	10	37497	37506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015735	TTAGT	2	10	41824	41833	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015735	GTCTT	2	10	42770	42779	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015735	CATTC	2	10	43518	43527	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015735	TGGGA	2	10	43537	43546	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015735	AATTA	2	10	43872	43881	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015735	TAAGC	2	10	45893	45902	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015735	TATTT	2	10	48160	48169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015735	CTTAA	2	10	50470	50479	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015735	AATAG	2	10	51147	51156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015735	CATGC	2	10	52858	52867	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_015735	TTCTT	2	10	53426	53435	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_015735	TTGAC	2	10	66227	66236	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015735	ATTTA	2	10	81061	81070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015735	TATTT	2	10	82578	82587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015735	TTTAA	2	10	85054	85063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015735	TGGTC	2	10	86723	86732	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_015735	ACCAT	2	10	86906	86915	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_015735	TAAAT	2	10	92458	92467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015735	TCATA	2	10	99931	99940	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015735	TACAA	2	10	103702	103711	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015735	AATAC	2	10	104709	104718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015735	ACATA	2	10	108099	108108	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015735	GCATC	2	10	108630	108639	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015735	TCTAG	2	10	115974	115983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015735	TGCAT	2	10	116086	116095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015735	TAAAC	2	10	118228	118237	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015735	AACTA	2	10	118426	118435	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_015735	GTAAT	2	10	118554	118563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015735	TAATA	2	10	119216	119225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015735	AGTGG	2	10	119297	119306	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015735	TCATA	2	10	119495	119504	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_015735	GTTCA	2	10	127994	128003	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015735	ACTTT	2	10	128094	128103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015735	TAATT	2	10	133882	133891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015735	TGTTA	2	10	140481	140490	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015735	CTTAA	2	10	143887	143896	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015735	TAGCT	2	10	147205	147214	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015735	TGAAT	2	10	147326	147335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015735	ATATG	2	10	154559	154568	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015735	TATAA	2	10	168110	168119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015735	GATTA	2	10	168879	168888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015735	TCATT	2	10	173992	174001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015735	GCCTA	2	10	174008	174017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015735	CCAGT	2	10	177001	177010	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015735	ACTGG	2	10	177403	177412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_015735	TAATA	2	10	177450	177459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015735	TTATA	2	10	178854	178863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015735	AGCTA	2	10	185199	185208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015735	ATTTT	2	10	188530	188539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015735	ACTAT	2	10	188814	188823	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015735	CCGTT	2	10	193392	193401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_015735	ACTAA	2	10	193630	193639	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_015735	GATAC	2	10	193640	193649	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_015735	CAAAA	2	10	194121	194130	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015735	CTTAG	2	10	195782	195791	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015735	CTATT	2	10	200808	200817	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015735	ATGTA	2	10	205784	205793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015735	TGTAA	2	10	211527	211536	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015735	TGTCT	2	10	211549	211558	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015735	TACAA	2	10	214304	214313	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015735	ACTAG	2	10	222474	222483	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015735	CCGTG	2	10	225438	225447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_015735	AGTAT	2	10	233641	233650	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015735	AAAAT	2	10	239977	239986	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015735	TAAAA	2	10	240080	240089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015735	CGAGA	2	10	244149	244158	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015735	ATAAA	2	10	244952	244961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015735	TTGTT	2	10	248189	248198	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015735	ATTAT	2	10	251395	251404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015735	CAAGA	2	10	252603	252612	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015735	TATAA	2	10	253350	253359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015735	CAATA	2	10	256978	256987	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015735	CAGGC	2	10	257283	257292	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015735	ACCAC	2	10	258811	258820	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_015735	AGTGG	2	10	259026	259035	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015735	AACAC	2	10	266171	266180	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015735	AGTCC	2	10	273074	273083	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_015735	AAACA	2	10	274396	274405	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015735	TCAGC	2	10	283979	283988	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015735	GCATT	2	10	284016	284025	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015735	GTTAT	2	10	285692	285701	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015735	TGTTA	2	10	292815	292824	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015735	GTTAA	2	10	292958	292967	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015735	ACACT	2	10	294935	294944	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_015735	CTATG	2	10	296292	296301	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_015735	CTTAG	2	10	296558	296567	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_015735	TACGA	2	10	296573	296582	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_015735	GTTAT	2	10	296739	296748	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015735	TTAGC	2	10	296869	296878	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_015735	GCTAA	2	10	296891	296900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015735	TAGTA	2	10	299727	299736	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015735	TATCA	2	10	302800	302809	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015735	TATAT	2	10	306108	306117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015735	TAATA	2	10	306283	306292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015735	AAGGC	2	10	309675	309684	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015735	TTTAG	2	10	311461	311470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015735	TAATT	2	10	318153	318162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015735	TAACA	2	10	319356	319365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015735	CTCAT	2	10	324232	324241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015735	ATGTT	2	10	327684	327693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015735	TAACC	2	10	328893	328902	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_015735	ACTAT	2	10	329872	329881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015735	GCTAC	2	10	330102	330111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_015735	TAATT	2	10	330158	330167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015735	AATAA	2	10	334234	334243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015735	CGATG	2	10	338049	338058	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015735	AGCAC	2	10	340518	340527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_015735	ATTAG	2	10	345773	345782	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015735	TTTTA	2	10	349418	349427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015735	ACCAT	2	10	353978	353987	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015735	TATAA	2	10	354926	354935	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015735	AGCAT	2	10	355029	355038	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015735	CGATA	2	10	357707	357716	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_015735	CATGT	2	10	357762	357771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015735	CCTGG	2	10	363121	363130	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_015735	GTTAC	2	10	371847	371856	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015735	CTGGT	2	10	371862	371871	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015735	TCCGG	2	10	374123	374132	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
146	NC_015735	AGGTC	2	10	374439	374448	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015735	TATGC	2	10	374454	374463	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015735	TATTG	2	10	377467	377476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015735	GTTCA	2	10	388925	388934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015735	TGCCG	2	10	391826	391835	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_015735	CATAT	2	10	391882	391891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015735	TGATA	2	10	395947	395956	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015735	CTCTG	2	10	396028	396037	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
154	NC_015735	ATAGA	3	15	400199	400213	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015735	TTTTG	2	10	400316	400325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015735	ATGTT	2	10	400488	400497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015735	CATGC	2	10	405138	405147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_015735	AATAA	2	10	408802	408811	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015735	GTGAC	2	10	420297	420306	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_015735	ATGCC	2	10	422157	422166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_015735	GTACA	2	10	429536	429545	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_015735	CAAAA	2	10	429666	429675	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_015735	CATTA	2	10	430642	430651	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_015735	GGTGA	2	10	435636	435645	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015735	AGAGA	2	10	435694	435703	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015735	TGCCG	2	10	435947	435956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_015735	CATAC	2	10	439372	439381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_015735	GAATA	2	10	439571	439580	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015735	CTATT	2	10	448075	448084	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_015735	CATAC	2	10	461123	461132	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
171	NC_015735	TAGCA	2	10	465525	465534	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_015735	AGCAG	2	10	466339	466348	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_015735	GAATC	2	10	473411	473420	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_015735	AAAAG	2	10	479915	479924	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015735	TTTTA	2	10	480344	480353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015735	GTTCA	2	10	482056	482065	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_015735	TTCAC	2	10	482556	482565	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_015735	ACACG	2	10	482729	482738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
179	NC_015735	TCAGG	2	10	483581	483590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
180	NC_015735	GGGCG	2	10	483671	483680	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
181	NC_015735	CTAAA	2	10	484295	484304	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_015735	AGCAA	2	10	484701	484710	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015735	TTTTA	2	10	488343	488352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015735	CTGGC	2	10	489469	489478	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
185	NC_015735	TTCTG	2	10	491600	491609	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_015735	TAGTG	2	10	491892	491901	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015735	TTTAC	2	10	492310	492319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_015735	TTCAA	2	10	493297	493306	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_015735	GTTAC	2	10	494704	494713	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
190	NC_015735	TACCA	2	10	505678	505687	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
191	NC_015735	GTAGG	2	10	514586	514595	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015735	CAATG	2	10	519799	519808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
193	NC_015735	ATTGA	2	10	520049	520058	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015735	TGTAG	2	10	520059	520068	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
195	NC_015735	AACAG	2	10	528156	528165	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_015735	ATTGA	2	10	537299	537308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015735	GATCA	2	10	537844	537853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_015735	TAAAA	2	10	538275	538284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.