MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Moranella endobia PCIT chromosome

Total Repeats: 3339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015735	AGCT	2	8	310665	310672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_015735	GGT	2	6	310725	310730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_015735	CGG	2	6	310812	310817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_015735	TCA	2	6	310840	310845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_015735	CGT	2	6	310920	310925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_015735	GCT	2	6	310974	310979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_015735	CCT	2	6	311131	311136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_015735	GT	3	6	311173	311178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_015735	ACA	2	6	311234	311239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_015735	ATT	2	6	311289	311294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_015735	ATG	2	6	311296	311301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_015735	AGCAAA	2	12	311310	311321	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2013	NC_015735	GGC	2	6	311333	311338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_015735	GGT	2	6	311347	311352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_015735	ACC	2	6	311353	311358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_015735	AGAT	2	8	311451	311458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_015735	TTTAG	2	10	311461	311470	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_015735	TTA	2	6	311578	311583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_015735	ATT	2	6	315331	315336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_015735	TAA	2	6	315355	315360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_015735	TGA	2	6	315390	315395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_015735	TTAC	2	8	315421	315428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2023	NC_015735	AATC	2	8	315431	315438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2024	NC_015735	TAA	2	6	317853	317858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2025	NC_015735	TAA	2	6	317889	317894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_015735	CAT	2	6	317919	317924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2028	NC_015735	TAT	2	6	317964	317969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_015735	T	6	6	318054	318059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_015735	AT	3	6	318124	318129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_015735	ACC	2	6	318142	318147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_015735	TAATT	2	10	318153	318162	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2033	NC_015735	ATG	2	6	318202	318207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2034	NC_015735	TAGT	2	8	318219	318226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2036	NC_015735	GTT	2	6	318245	318250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2037	NC_015735	TAGC	2	8	318274	318281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2038	NC_015735	ATCT	2	8	318320	318327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2039	NC_015735	TGC	2	6	319267	319272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2041	NC_015735	TAACA	2	10	319356	319365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2042	NC_015735	TAAT	2	8	319374	319381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2043	NC_015735	T	8	8	319408	319415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_015735	AAT	2	6	319986	319991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2045	NC_015735	A	7	7	319999	320005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2047	NC_015735	CTG	2	6	320059	320064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2049	NC_015735	AG	3	6	320096	320101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_015735	AGT	2	6	321132	321137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_015735	AGT	2	6	321154	321159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_015735	TAAA	2	8	321173	321180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_015735	TA	5	10	321228	321237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_015735	AT	4	8	321250	321257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_015735	GCT	2	6	321266	321271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2061	NC_015735	AT	3	6	322940	322945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_015735	TGCA	2	8	322975	322982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2063	NC_015735	TTAT	2	8	322994	323001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_015735	CCA	2	6	323004	323009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2065	NC_015735	CA	3	6	323022	323027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2066	NC_015735	A	6	6	323086	323091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2067	NC_015735	A	7	7	323098	323104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_015735	TGA	2	6	323155	323160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_015735	CAT	2	6	323596	323601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2073	NC_015735	TC	3	6	323695	323700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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2081	NC_015735	GTG	2	6	323902	323907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2082	NC_015735	TTCA	2	8	323917	323924	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2083	NC_015735	TAC	2	6	323930	323935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2089	NC_015735	TAT	2	6	324066	324071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2090	NC_015735	GTTA	2	8	324149	324156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_015735	TGTAGA	2	12	324182	324193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_015735	AT	3	6	324219	324224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_015735	CTCAT	2	10	324232	324241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2095	NC_015735	TGT	2	6	327316	327321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2096	NC_015735	TAA	2	6	327448	327453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_015735	T	8	8	327471	327478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_015735	ATG	2	6	327595	327600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_015735	AAT	2	6	327620	327625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2103	NC_015735	TC	3	6	327631	327636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2104	NC_015735	ATT	2	6	327641	327646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_015735	GA	3	6	327647	327652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_015735	ATGTT	2	10	327684	327693	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_015735	T	7	7	327692	327698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2108	NC_015735	CTAGGA	2	12	327765	327776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2111	NC_015735	AAT	2	6	328869	328874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2112	NC_015735	TAACC	2	10	328893	328902	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2113	NC_015735	TAG	2	6	328913	328918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2114	NC_015735	CAT	2	6	328934	328939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2116	NC_015735	GT	3	6	329000	329005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_015735	T	8	8	329005	329012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_015735	TAT	2	6	329063	329068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2119	NC_015735	ATT	2	6	329115	329120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2121	NC_015735	T	6	6	329633	329638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2122	NC_015735	AGA	2	6	329657	329662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2123	NC_015735	TCA	2	6	329663	329668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2125	NC_015735	TATATG	2	12	329744	329755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2126	NC_015735	GCA	2	6	329768	329773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2129	NC_015735	A	6	6	329843	329848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_015735	AGT	2	6	329853	329858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2132	NC_015735	GTT	2	6	329889	329894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2133	NC_015735	CGA	2	6	330052	330057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2134	NC_015735	GCTAC	2	10	330102	330111	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2135	NC_015735	CTA	2	6	330150	330155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_015735	TAATT	2	10	330158	330167	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_015735	TAAG	2	8	330181	330188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2138	NC_015735	ACC	2	6	330195	330200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2266	NC_015735	AATATT	2	12	343396	343407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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