MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	GC	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015724	TG	3	6	3702	3707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015724	GC	3	6	3762	3767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015724	CG	3	6	3838	3843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015724	GA	3	6	4032	4037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015724	CG	3	6	4150	4155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015724	CG	3	6	4216	4221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_015724	GC	4	8	7019	7026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015724	GC	3	6	7089	7094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_015724	AC	3	6	7762	7767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015724	GC	3	6	14649	14654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015724	GC	4	8	26206	26213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015724	CG	3	6	29312	29317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015724	GA	3	6	29558	29563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015724	CG	3	6	29940	29945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015724	GC	3	6	29973	29978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015724	GC	3	6	30093	30098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015724	GC	3	6	30261	30266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015724	GC	3	6	30578	30583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015724	CG	3	6	38309	38314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015724	GC	3	6	38490	38495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015724	TA	3	6	39654	39659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015724	CG	3	6	39722	39727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015724	GC	3	6	40715	40720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015724	AT	3	6	40749	40754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015724	AT	3	6	43509	43514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015724	CG	3	6	44351	44356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015724	GA	3	6	44570	44575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015724	GC	3	6	49188	49193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015724	GC	3	6	54267	54272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015724	CG	5	10	56163	56172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015724	GA	3	6	58431	58436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015724	AC	4	8	60563	60570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015724	GC	3	6	62723	62728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015724	CA	3	6	62916	62921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015724	CG	3	6	63021	63026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015724	GC	3	6	63043	63048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015724	TA	3	6	65668	65673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015724	GC	3	6	66545	66550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015724	GC	3	6	66552	66557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015724	CG	3	6	66962	66967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015724	GC	3	6	75665	75670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015724	CT	3	6	79717	79722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015724	TG	3	6	79917	79922	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015724	AG	3	6	84819	84824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015724	CG	4	8	93716	93723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015724	CA	4	8	95512	95519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015724	CG	3	6	103998	104003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015724	CG	4	8	104005	104012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015724	TA	3	6	104195	104200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015724	GC	3	6	105994	105999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015724	CG	3	6	107334	107339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015724	CG	3	6	107573	107578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015724	GC	3	6	107745	107750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015724	GC	3	6	107924	107929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015724	GC	4	8	108037	108044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015724	GC	3	6	108188	108193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015724	GC	3	6	115560	115565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015724	CG	3	6	116802	116807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015724	GC	4	8	119823	119830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015724	TG	3	6	121457	121462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015724	GC	3	6	121506	121511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015724	GC	3	6	133208	133213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_015724	GC	3	6	134361	134366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015724	CG	3	6	139410	139415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015724	CG	4	8	139440	139447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015724	TG	3	6	141201	141206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015724	CG	3	6	141261	141266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015724	GC	3	6	154803	154808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015724	CT	3	6	155033	155038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015724	AT	3	6	168233	168238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015724	CG	3	6	175226	175231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015724	GC	3	6	179208	179213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015724	CG	3	6	179214	179219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015724	CT	3	6	180623	180628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015724	CG	3	6	181420	181425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015724	TA	3	6	181546	181551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015724	CG	3	6	183595	183600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015724	CG	4	8	183642	183649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015724	CG	3	6	183777	183782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015724	GC	3	6	184268	184273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015724	GC	3	6	184614	184619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015724	CT	3	6	184624	184629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015724	AG	3	6	185810	185815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015724	AG	3	6	185904	185909	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015724	GC	3	6	189723	189728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015724	GC	3	6	189731	189736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015724	GC	3	6	192115	192120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015724	GA	3	6	193239	193244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015724	TC	3	6	196602	196607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015724	GC	3	6	196661	196666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015724	GA	3	6	197929	197934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015724	CG	5	10	199551	199560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015724	GT	3	6	201537	201542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015724	GC	3	6	201710	201715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015724	CG	3	6	201864	201869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015724	GA	3	6	201994	201999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015724	AC	3	6	206183	206188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_015724	GA	3	6	210956	210961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015724	AC	3	6	211282	211287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015724	AG	3	6	211706	211711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015724	GT	4	8	211778	211785	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015724	TG	3	6	211839	211844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015724	CT	3	6	216425	216430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015724	GA	3	6	221630	221635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015724	GA	3	6	225258	225263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015724	CA	3	6	228080	228085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015724	GC	3	6	229243	229248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015724	GC	3	6	229772	229777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015724	GC	3	6	229780	229785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015724	TC	3	6	231238	231243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015724	GC	3	6	232600	232605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015724	GC	3	6	232656	232661	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015724	GA	3	6	232831	232836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015724	GA	3	6	233452	233457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015724	GC	3	6	233536	233541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015724	CA	3	6	234822	234827	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015724	GC	3	6	236866	236871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015724	CG	3	6	241784	241789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_015724	GC	3	6	242337	242342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015724	GC	3	6	257072	257077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015724	CG	3	6	265095	265100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015724	CG	3	6	271632	271637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015724	GC	3	6	277221	277226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015724	CG	4	8	277477	277484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_015724	GC	3	6	278097	278102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015724	GT	3	6	278119	278124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015724	CG	3	6	278176	278181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015724	CG	3	6	280750	280755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015724	GC	3	6	280788	280793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015724	CG	3	6	281009	281014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015724	GC	3	6	281070	281075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_015724	GC	3	6	281590	281595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015724	GC	3	6	281745	281750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015724	GC	4	8	282398	282405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015724	GC	3	6	282432	282437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_015724	GC	3	6	282488	282493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_015724	CG	3	6	285220	285225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015724	AC	3	6	285336	285341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_015724	AG	3	6	285393	285398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015724	GA	3	6	285627	285632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015724	GC	3	6	299287	299292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_015724	GC	3	6	299820	299825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_015724	GC	4	8	302303	302310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015724	CG	3	6	305259	305264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_015724	CA	3	6	311641	311646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_015724	AG	5	10	312024	312033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015724	AG	5	10	312366	312375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015724	GC	3	6	313408	313413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015724	CG	3	6	313538	313543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_015724	GA	4	8	317791	317798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015724	GC	3	6	330367	330372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015724	CG	4	8	336135	336142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015724	TG	3	6	336440	336445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015724	GC	3	6	336611	336616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_015724	AC	3	6	339558	339563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_015724	CG	3	6	339634	339639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.