MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015722	TAA	2	6	500986	500991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015722	CTG	2	6	501008	501013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_015722	ATT	3	9	501018	501026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015722	T	7	7	501084	501090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015722	TAC	2	6	501163	501168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015722	T	6	6	501184	501189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015722	GAA	2	6	501192	501197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015722	ACTAT	2	10	501203	501212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3009	NC_015722	CCT	2	6	501234	501239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_015722	ACTATA	2	12	501246	501257	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3011	NC_015722	A	7	7	501259	501265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015722	G	6	6	501266	501271	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015722	ATT	2	6	501292	501297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015722	G	10	10	501313	501322	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015722	ACT	2	6	501335	501340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015722	AAC	2	6	501346	501351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015722	TAA	2	6	501363	501368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015722	TTAAAG	2	12	501401	501412	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015722	ATGA	2	8	501695	501702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015722	AACCT	2	10	501712	501721	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3021	NC_015722	AG	3	6	501746	501751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015722	ACTG	2	8	501752	501759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_015722	G	8	8	501800	501807	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015722	GAG	2	6	501883	501888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015722	AT	3	6	501897	501902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015722	A	7	7	501903	501909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015722	ATTG	2	8	501943	501950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_015722	ATT	2	6	501974	501979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_015722	AGGT	2	8	501988	501995	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_015722	ACCT	2	8	502011	502018	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_015722	GAT	2	6	502068	502073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015722	TAC	2	6	502089	502094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015722	CAT	2	6	502126	502131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_015722	TTAA	2	8	502154	502161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015722	CTAG	2	8	502170	502177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_015722	GAA	2	6	502186	502191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_015722	CTT	2	6	502241	502246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_015722	CTG	2	6	502257	502262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015722	CTAT	2	8	502275	502282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3040	NC_015722	GGCT	2	8	502422	502429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3041	NC_015722	ATTA	2	8	502436	502443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015722	TAAT	2	8	502464	502471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015722	TA	3	6	504596	504601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015722	T	6	6	504628	504633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015722	ATC	2	6	504669	504674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015722	CTT	2	6	504687	504692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_015722	CCTTCG	2	12	504701	504712	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3048	NC_015722	ATT	2	6	504729	504734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_015722	T	7	7	505091	505097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015722	AATC	2	8	505143	505150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_015722	GTT	2	6	505200	505205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_015722	A	6	6	505255	505260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_015722	GCA	2	6	505368	505373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015722	ATG	2	6	505374	505379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_015722	TCT	2	6	505401	505406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015722	AAAG	2	8	505460	505467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015722	TA	3	6	505470	505475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015722	TTG	2	6	505497	505502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015722	GC	3	6	505590	505595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3060	NC_015722	CTT	2	6	505596	505601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_015722	TAA	2	6	505611	505616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015722	AAAT	2	8	505703	505710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015722	TCG	2	6	505712	505717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_015722	AGAA	2	8	505763	505770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015722	AGC	2	6	505853	505858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_015722	A	6	6	505877	505882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015722	AGC	2	6	505913	505918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_015722	GAA	2	6	505994	505999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015722	ATA	2	6	506006	506011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015722	ATA	2	6	506043	506048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015722	AGA	2	6	506059	506064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015722	A	6	6	506071	506076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015722	AAT	2	6	506290	506295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015722	ATA	2	6	506309	506314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015722	A	6	6	506328	506333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015722	CTG	2	6	506408	506413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_015722	GT	3	6	506423	506428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_015722	T	6	6	506437	506442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015722	TAA	2	6	506775	506780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015722	T	8	8	506795	506802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_015722	TTTA	2	8	506812	506819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015722	C	7	7	506877	506883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3083	NC_015722	TATC	2	8	506900	506907	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_015722	CAC	2	6	506951	506956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_015722	TA	3	6	506985	506990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015722	GTG	2	6	507008	507013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_015722	AGT	2	6	507103	507108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015722	ATA	2	6	507470	507475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_015722	GTA	2	6	507510	507515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_015722	ATT	2	6	507521	507526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_015722	TA	3	6	507534	507539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_015722	TTG	2	6	507633	507638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015722	TTA	2	6	507646	507651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015722	TA	3	6	507951	507956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015722	AT	3	6	507957	507962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_015722	A	6	6	507972	507977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_015722	TTA	2	6	510925	510930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015722	ATA	2	6	510939	510944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015722	T	6	6	510957	510962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015722	CAT	2	6	511005	511010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_015722	AT	3	6	511009	511014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015722	AAT	2	6	511015	511020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015722	TTC	2	6	511040	511045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_015722	GTA	2	6	512048	512053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015722	GCT	3	9	512068	512076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_015722	AATGTT	2	12	512098	512109	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015722	GAA	2	6	513917	513922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015722	TTC	2	6	513973	513978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_015722	CTAG	2	8	513987	513994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_015722	TTA	2	6	514003	514008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015722	TTTTG	2	10	514043	514052	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015722	ATC	2	6	514094	514099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_015722	TTC	2	6	514122	514127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_015722	AAT	2	6	514186	514191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015722	CTC	2	6	514200	514205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_015722	AT	3	6	514388	514393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015722	GAG	2	6	514425	514430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015722	TCAA	2	8	514511	514518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_015722	AAG	2	6	514531	514536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015722	GTT	2	6	514539	514544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015722	TA	3	6	514590	514595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015722	ATC	2	6	514656	514661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015722	TC	3	6	514694	514699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_015722	TTA	2	6	514769	514774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015722	TTG	2	6	514814	514819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015722	TGTT	2	8	514832	514839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015722	GCA	2	6	514847	514852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_015722	CAG	2	6	514856	514861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015722	CAA	2	6	514897	514902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_015722	CT	3	6	514934	514939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_015722	GA	4	8	514940	514947	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015722	CAT	2	6	515034	515039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_015722	ATC	2	6	515112	515117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_015722	CAAA	2	8	515121	515128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3135	NC_015722	CTA	2	6	515135	515140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_015722	TTAT	2	8	515156	515163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_015722	GAA	2	6	515175	515180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3139	NC_015722	AAAAC	2	10	515312	515321	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3267	NC_015722	ATT	2	6	526891	526896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_015722	A	6	6	526897	526902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_015722	TAT	2	6	526929	526934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_015722	TATT	2	8	526984	526991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_015722	T	7	7	526990	526996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_015722	TTCTG	2	10	527610	527619	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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