MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015722	A	6	6	410802	410807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_015722	TTA	2	6	410830	410835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_015722	GAA	2	6	410850	410855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_015722	TGAA	2	8	411276	411283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_015722	ATT	2	6	411312	411317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_015722	GTG	2	6	411327	411332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_015722	GCA	2	6	411382	411387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_015722	AGG	2	6	411406	411411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_015722	AGA	2	6	411415	411420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_015722	A	6	6	411435	411440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_015722	TAT	2	6	411460	411465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_015722	TTA	2	6	411508	411513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_015722	ATT	2	6	411780	411785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_015722	ATT	2	6	411798	411803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_015722	A	6	6	411876	411881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_015722	ATT	2	6	411912	411917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_015722	TCT	2	6	411919	411924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_015722	TTAT	2	8	411963	411970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_015722	ATT	2	6	411985	411990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_015722	TTA	2	6	412089	412094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_015722	GAA	2	6	412142	412147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_015722	GCTAT	2	10	412241	412250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_015722	A	6	6	412267	412272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_015722	AGG	2	6	412330	412335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_015722	C	6	6	412336	412341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2526	NC_015722	ATT	2	6	412404	412409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_015722	ATG	2	6	412414	412419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_015722	ATT	3	9	412420	412428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_015722	TATG	2	8	412443	412450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_015722	TTTA	2	8	412466	412473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_015722	AGC	2	6	412491	412496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_015722	AAG	2	6	412964	412969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_015722	AGG	2	6	413005	413010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_015722	CTG	2	6	413014	413019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_015722	CCG	2	6	413028	413033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2536	NC_015722	TAC	2	6	413050	413055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_015722	ATT	2	6	413081	413086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_015722	ATT	2	6	413135	413140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_015722	AAG	2	6	413222	413227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_015722	CAA	2	6	413242	413247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_015722	TAT	2	6	413426	413431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_015722	ATA	2	6	413457	413462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_015722	A	8	8	413473	413480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_015722	TAT	2	6	413519	413524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_015722	CGC	2	6	413545	413550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2546	NC_015722	GA	3	6	413593	413598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_015722	GAGGT	2	10	413600	413609	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_015722	T	6	6	415036	415041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_015722	T	6	6	415090	415095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_015722	AT	3	6	415111	415116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_015722	CAAG	2	8	415133	415140	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2552	NC_015722	ATAC	2	8	415143	415150	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2553	NC_015722	AAG	2	6	415151	415156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_015722	TATT	2	8	415196	415203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_015722	TAA	2	6	415215	415220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_015722	AAT	2	6	415227	415232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_015722	ACC	2	6	415236	415241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_015722	A	6	6	415266	415271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_015722	C	7	7	415344	415350	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2560	NC_015722	AAAT	2	8	415351	415358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_015722	CAA	2	6	415368	415373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_015722	CCAA	2	8	417907	417914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2563	NC_015722	TTA	2	6	417919	417924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_015722	ATT	2	6	417925	417930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_015722	T	6	6	417936	417941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_015722	T	6	6	419355	419360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_015722	TTGTT	2	10	421476	421485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_015722	GTT	2	6	421505	421510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_015722	AAGG	2	8	421517	421524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_015722	T	6	6	421529	421534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_015722	TGA	2	6	421540	421545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_015722	CGGT	2	8	421626	421633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_015722	GTT	2	6	421637	421642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_015722	TGA	2	6	421654	421659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_015722	A	6	6	421659	421664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_015722	TAT	2	6	422523	422528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_015722	ATT	2	6	423706	423711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_015722	AG	4	8	426854	426861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_015722	CAT	2	6	426872	426877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_015722	ATA	2	6	427050	427055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_015722	GCGA	2	8	427114	427121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_015722	GT	3	6	427127	427132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_015722	TCAA	2	8	427174	427181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2584	NC_015722	AAG	2	6	427195	427200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_015722	GTT	2	6	427203	427208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_015722	GTTT	2	8	427225	427232	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_015722	TGA	2	6	427245	427250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_015722	TA	3	6	427283	427288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_015722	T	6	6	427331	427336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_015722	ATC	2	6	427350	427355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2591	NC_015722	ATGA	2	8	427375	427382	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_015722	TC	3	6	427388	427393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_015722	TTA	2	6	427462	427467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_015722	TTG	2	6	427507	427512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_015722	GCA	2	6	427540	427545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_015722	CAG	2	6	427549	427554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_015722	CAA	2	6	427590	427595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_015722	CT	3	6	427627	427632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_015722	GA	4	8	427633	427640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_015722	CAT	2	6	427725	427730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2601	NC_015722	TTAT	2	8	427847	427854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_015722	GA	3	6	427864	427869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_015722	CTT	2	6	427888	427893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_015722	ATA	2	6	427944	427949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_015722	C	6	6	428427	428432	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2606	NC_015722	CAGT	2	8	428475	428482	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2607	NC_015722	CT	3	6	428483	428488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2608	NC_015722	ATC	2	6	428489	428494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_015722	AGGTT	2	10	428513	428522	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_015722	TCAT	2	8	428532	428539	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2611	NC_015722	TTC	2	6	428626	428631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_015722	CTA	2	6	428689	428694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_015722	TTG	2	6	428713	428718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_015722	TAG	2	6	428841	428846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_015722	TCAT	2	8	428874	428881	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2616	NC_015722	T	6	6	428884	428889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_015722	CTT	2	6	428903	428908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_015722	T	6	6	429141	429146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_015722	TTA	2	6	429152	429157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_015722	GCT	2	6	429239	429244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_015722	T	6	6	429283	429288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_015722	TGA	2	6	429355	429360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_015722	AGT	2	6	429374	429379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_015722	TTG	2	6	429390	429395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_015722	TAA	2	6	429400	429405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_015722	TTG	2	6	429461	429466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_015722	TAT	2	6	429543	429548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_015722	TGC	2	6	429631	429636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_015722	TA	3	6	429723	429728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_015722	CGA	2	6	429742	429747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_015722	AGC	2	6	429774	429779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_015722	GCAT	2	8	429793	429800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2633	NC_015722	GTA	2	6	429874	429879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_015722	AGCA	2	8	429882	429889	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2635	NC_015722	AG	3	6	429892	429897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2637	NC_015722	AAT	2	6	429960	429965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2914	NC_015722	GTAC	2	8	487832	487839	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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