MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015722	G	6	6	241084	241089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015722	TAA	2	6	241122	241127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015722	GAA	2	6	241151	241156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015722	GTG	2	6	241158	241163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015722	T	8	8	242923	242930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015722	AAT	2	6	243496	243501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015722	ACT	2	6	243505	243510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_015722	TC	3	6	243528	243533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_015722	TTA	2	6	243571	243576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015722	TTTA	2	8	243609	243616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015722	TA	3	6	243622	243627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_015722	CTT	2	6	245855	245860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_015722	AAGC	2	8	245953	245960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_015722	TA	3	6	246007	246012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015722	ATT	3	9	246074	246082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015722	ATC	2	6	246116	246121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015722	TA	3	6	246148	246153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015722	CTA	2	6	246193	246198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015722	GCT	2	6	246249	246254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_015722	ACT	2	6	246264	246269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_015722	ACTT	2	8	246747	246754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1522	NC_015722	TTTA	2	8	246774	246781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015722	AAC	2	6	246810	246815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_015722	GAGTA	2	10	246836	246845	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015722	CTTT	2	8	246865	246872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_015722	ATG	2	6	247232	247237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015722	AT	3	6	247276	247281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015722	TAA	2	6	247291	247296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015722	A	6	6	248141	248146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015722	TA	3	6	248211	248216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015722	TTA	2	6	248217	248222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_015722	ATA	2	6	248284	248289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015722	GTTA	2	8	248352	248359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015722	GAA	2	6	248404	248409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015722	TAAAA	2	10	248454	248463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015722	A	7	7	248460	248466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015722	TA	4	8	248475	248482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_015722	ATT	2	6	248485	248490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015722	AGA	2	6	248493	248498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015722	ATT	2	6	248717	248722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015722	TAG	2	6	248730	248735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015722	GTT	2	6	248751	248756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015722	TGG	2	6	248790	248795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015722	CTT	2	6	248811	248816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_015722	AAT	2	6	250526	250531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015722	CTT	2	6	250537	250542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015722	CTAT	2	8	250601	250608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_015722	GAA	2	6	250656	250661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015722	GCA	2	6	250700	250705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_015722	GGC	2	6	250763	250768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015722	A	6	6	250841	250846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015722	ATT	2	6	250867	250872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015722	CCGTAA	2	12	250883	250894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_015722	AGC	2	6	250896	250901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_015722	TC	3	6	250917	250922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_015722	TGG	3	9	250951	250959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015722	AAC	2	6	250985	250990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_015722	T	7	7	251026	251032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015722	ATTG	2	8	251083	251090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015722	GCGA	2	8	251091	251098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_015722	GT	3	6	251103	251108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015722	TCAA	2	8	251149	251156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_015722	AAG	2	6	251171	251176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015722	GTT	2	6	251179	251184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015722	GCC	2	6	251190	251195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_015722	TC	3	6	251232	251237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1567	NC_015722	TTA	2	6	251319	251324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015722	TTG	2	6	251367	251372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015722	GCA	2	6	251400	251405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015722	CAG	2	6	251409	251414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_015722	CAA	2	6	251451	251456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_015722	CT	3	6	251488	251493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_015722	GA	4	8	251494	251501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015722	CAT	2	6	251586	251591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_015722	ATC	2	6	251664	251669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_015722	CAAA	2	8	251673	251680	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_015722	CTA	2	6	251687	251692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015722	TTAT	2	8	251708	251715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015722	GA	3	6	251725	251730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015722	CTT	2	6	251749	251754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_015722	AAAAC	2	10	251864	251873	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_015722	CTT	2	6	251898	251903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_015722	GATT	2	8	251914	251921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015722	CCT	2	6	252003	252008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_015722	AT	3	6	252041	252046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015722	TAA	2	6	252842	252847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015722	ATA	2	6	254059	254064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015722	TA	3	6	255653	255658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015722	TGT	2	6	255664	255669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015722	CAA	2	6	255742	255747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_015722	CTC	2	6	257781	257786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_015722	CTT	2	6	258518	258523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_015722	TCT	2	6	258538	258543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_015722	T	7	7	258556	258562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015722	TCT	2	6	258627	258632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_015722	CT	4	8	258631	258638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_015722	CT	3	6	258655	258660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_015722	TAA	2	6	258661	258666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015722	ATT	2	6	258685	258690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_015722	A	6	6	258742	258747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015722	TAT	2	6	258774	258779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015722	ATT	2	6	258789	258794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015722	TAAA	2	8	258826	258833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015722	ACC	2	6	258854	258859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_015722	TC	3	6	259205	259210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_015722	ATAA	2	8	259220	259227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015722	TAG	2	6	259243	259248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015722	TGAT	2	8	259261	259268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015722	GAT	2	6	259343	259348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015722	AG	3	6	259442	259447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015722	TTG	2	6	259479	259484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015722	CTT	2	6	259844	259849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_015722	GATT	2	8	259860	259867	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015722	CAC	2	6	259910	259915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_015722	CT	3	6	259950	259955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_015722	AT	3	6	259989	259994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015722	ATGGAG	2	12	260088	260099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015722	GAT	2	6	260156	260161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015722	TGG	2	6	260200	260205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015722	T	7	7	260249	260255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015722	CCAT	2	8	260286	260293	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_015722	TAC	2	6	260320	260325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015722	A	7	7	260339	260345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015722	TAG	2	6	260354	260359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015722	GAC	2	6	260364	260369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_015722	CAA	2	6	260390	260395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_015722	ACT	2	6	260401	260406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_015722	C	7	7	260415	260421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1629	NC_015722	G	6	6	260443	260448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015722	ACA	2	6	260461	260466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_015722	GAC	2	6	260487	260492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_015722	AAC	2	6	260574	260579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_015722	TTG	2	6	260625	260630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015722	TGG	2	6	260641	260646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015722	TTTTC	2	10	260664	260673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1637	NC_015722	CTT	2	6	260803	260808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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