MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015722	CAT	2	6	65500	65505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015722	AGG	2	6	65586	65591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015722	AGAT	2	8	65602	65609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015722	AATTA	2	10	65611	65620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015722	TA	3	6	65619	65624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015722	GAA	2	6	65675	65680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015722	GTTA	2	8	65686	65693	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015722	TAA	2	6	65740	65745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015722	GAT	2	6	65762	65767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015722	ATAG	2	8	65768	65775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015722	TAG	2	6	65788	65793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015722	ACA	2	6	65812	65817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015722	GCT	2	6	65876	65881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015722	CAA	2	6	65896	65901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015722	AGC	2	6	65941	65946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_015722	GTAAA	2	10	66010	66019	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015722	TAG	3	9	66040	66048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015722	GTG	2	6	66060	66065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015722	ATT	2	6	66076	66081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015722	ATT	2	6	66086	66091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015722	GAG	2	6	66163	66168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015722	TTGGT	2	10	66191	66200	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015722	TGAAT	2	10	66206	66215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015722	AAGGC	2	10	66224	66233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
525	NC_015722	AG	3	6	66246	66251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015722	CAA	2	6	66269	66274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015722	GTAG	2	8	66282	66289	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015722	AGA	2	6	66339	66344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015722	TTAA	2	8	66358	66365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015722	AGT	3	9	66373	66381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015722	ATT	2	6	66406	66411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015722	CTA	2	6	66556	66561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015722	TGA	2	6	66614	66619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015722	AAG	2	6	66670	66675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015722	ATGTAT	2	12	66737	66748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015722	TGGT	2	8	66758	66765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015722	AGA	2	6	66804	66809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015722	TAT	2	6	66820	66825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015722	AGA	2	6	66829	66834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015722	GATA	2	8	66877	66884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015722	AGA	2	6	66916	66921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015722	CAA	2	6	66946	66951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015722	GTA	2	6	66994	66999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015722	AGG	2	6	67033	67038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015722	ATA	2	6	67074	67079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015722	AAT	2	6	67109	67114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015722	AAT	2	6	67233	67238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015722	GA	3	6	67253	67258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015722	A	6	6	67278	67283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015722	AGAA	2	8	67341	67348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015722	CAA	2	6	67364	67369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015722	A	6	6	67373	67378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015722	GAA	2	6	67397	67402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015722	AG	3	6	67413	67418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015722	TGA	2	6	67449	67454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015722	ATG	2	6	67455	67460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015722	GA	3	6	67597	67602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015722	A	6	6	67727	67732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015722	TAA	2	6	67750	67755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015722	GAT	2	6	67818	67823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015722	ACG	2	6	67842	67847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_015722	CAA	2	6	67856	67861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015722	AT	3	6	67877	67882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015722	GTCCT	2	10	67915	67924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
565	NC_015722	ATT	2	6	67929	67934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015722	TA	3	6	68055	68060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015722	TAA	2	6	68092	68097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015722	TTA	2	6	68108	68113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015722	CAC	2	6	68240	68245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_015722	T	6	6	68247	68252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015722	ATAAA	2	10	69615	69624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015722	AT	3	6	72028	72033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015722	TCAA	2	8	72148	72155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_015722	AAG	2	6	72168	72173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015722	GTT	2	6	72176	72181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015722	GTTTT	2	10	72198	72207	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015722	TGA	2	6	72229	72234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015722	TC	3	6	72372	72377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
579	NC_015722	TTA	2	6	72447	72452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015722	TTG	2	6	72492	72497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015722	TGTT	2	8	72510	72517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015722	GCA	2	6	72525	72530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015722	CAG	2	6	72534	72539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015722	TC	3	6	72562	72567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
585	NC_015722	CAA	2	6	72578	72583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015722	CT	3	6	72616	72621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_015722	GA	4	8	72622	72629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015722	CAT	2	6	72714	72719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_015722	ATC	2	6	72792	72797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015722	CAAA	2	8	72801	72808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
591	NC_015722	CTA	2	6	72815	72820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015722	TTAT	2	8	72836	72843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015722	AATA	2	8	72850	72857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015722	TAT	2	6	72921	72926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015722	CTA	2	6	72968	72973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015722	CAA	2	6	73004	73009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015722	A	6	6	73013	73018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015722	ACA	2	6	73030	73035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015722	TA	3	6	73115	73120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015722	TACAA	2	10	75419	75428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
601	NC_015722	GTAGA	2	10	75429	75438	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015722	A	6	6	75438	75443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015722	TACT	2	8	76043	76050	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_015722	GCT	2	6	76059	76064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015722	ATT	2	6	76086	76091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015722	ATT	2	6	76132	76137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015722	GTA	2	6	76171	76176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015722	GAA	2	6	76740	76745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015722	TCG	2	6	76810	76815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_015722	GC	3	6	76882	76887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015722	TATT	2	8	78529	78536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015722	ATT	2	6	78566	78571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015722	TCTAC	2	10	78572	78581	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
614	NC_015722	TAT	2	6	78605	78610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015722	GAA	2	6	78616	78621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015722	AGA	2	6	78645	78650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015722	ACCT	2	8	78677	78684	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_015722	GAA	2	6	78705	78710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015722	GAT	2	6	78733	78738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015722	TTAA	2	8	78825	78832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015722	CTAG	2	8	78841	78848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_015722	GAA	2	6	78857	78862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015722	TACTCT	2	12	78900	78911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_015722	CTT	2	6	78912	78917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_015722	TCC	2	6	79090	79095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_015722	CAA	2	6	79111	79116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_015722	TTA	2	6	79133	79138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015722	GTT	2	6	79156	79161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015722	ATTTT	2	10	79200	79209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015722	TAATA	2	10	79213	79222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015722	CAAA	2	8	79224	79231	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_015722	TA	4	8	79244	79251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015722	AG	3	6	79461	79466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015722	T	6	6	80395	80400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015722	AT	3	6	80428	80433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015722	TTAA	2	8	80489	80496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015722	TCT	2	6	80498	80503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_015722	C	8	8	80706	80713	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
639	NC_015722	TCT	2	6	80791	80796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015722	TAA	2	6	80812	80817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015722	TA	3	6	80964	80969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015722	CTT	2	6	81019	81024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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644	NC_015722	TTC	2	6	81181	81186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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