MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_015722	GAA	2	6	1139495	1139500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_015722	TGG	2	6	1139535	1139540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_015722	CAA	2	6	1139552	1139557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_015722	AG	4	8	1139578	1139585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_015722	ACC	2	6	1139601	1139606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7506	NC_015722	TCTCC	2	10	1139650	1139659	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7507	NC_015722	CAAT	2	8	1139674	1139681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_015722	GCT	2	6	1139689	1139694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_015722	CAGC	2	8	1139695	1139702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7510	NC_015722	AT	3	6	1139789	1139794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_015722	TCAA	2	8	1139910	1139917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_015722	AAG	2	6	1139930	1139935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_015722	GTT	2	6	1139938	1139943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_015722	GTTTT	2	10	1139960	1139969	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_015722	TGA	2	6	1139982	1139987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_015722	TC	3	6	1140125	1140130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7517	NC_015722	GA	3	6	1140141	1140146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_015722	ACC	2	6	1140147	1140152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7519	NC_015722	CAA	2	6	1140178	1140183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_015722	CT	3	6	1140216	1140221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_015722	GA	4	8	1140222	1140229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_015722	TA	3	6	1140523	1140528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_015722	CGA	2	6	1140561	1140566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_015722	AGC	2	6	1140590	1140595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_015722	CA	3	6	1140602	1140607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7526	NC_015722	ACC	2	6	1140692	1140697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_015722	AAT	2	6	1141071	1141076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_015722	TAT	2	6	1141094	1141099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_015722	ATTT	2	8	1141118	1141125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_015722	TAA	2	6	1143100	1143105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_015722	AAAT	2	8	1143160	1143167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_015722	AAG	2	6	1143182	1143187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_015722	GAA	2	6	1143191	1143196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_015722	AAT	2	6	1143212	1143217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_015722	TA	3	6	1143244	1143249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_015722	CG	3	6	1143756	1143761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_015722	CCT	2	6	1143766	1143771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7538	NC_015722	TTA	2	6	1143780	1143785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_015722	TA	3	6	1143784	1143789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_015722	TA	3	6	1143798	1143803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_015722	AGA	2	6	1143854	1143859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_015722	TAAT	2	8	1143862	1143869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_015722	ATT	2	6	1143870	1143875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_015722	AT	3	6	1143980	1143985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_015722	TG	3	6	1143999	1144004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_015722	TCAT	2	8	1144008	1144015	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7547	NC_015722	TA	3	6	1144027	1144032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_015722	ATG	2	6	1144043	1144048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_015722	AT	3	6	1144065	1144070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_015722	CAT	2	6	1144182	1144187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_015722	TTA	2	6	1144255	1144260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_015722	CTAC	2	8	1144741	1144748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7553	NC_015722	TGG	2	6	1144963	1144968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_015722	TTA	2	6	1144982	1144987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_015722	AAATT	2	10	1145033	1145042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_015722	TTA	2	6	1145062	1145067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_015722	ATA	2	6	1145142	1145147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_015722	ATTA	2	8	1146102	1146109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7559	NC_015722	TAA	2	6	1146152	1146157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_015722	T	6	6	1146593	1146598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_015722	TGT	2	6	1146635	1146640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_015722	TTAA	2	8	1146658	1146665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_015722	T	6	6	1146675	1146680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_015722	ATA	2	6	1146692	1146697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_015722	TAT	2	6	1146773	1146778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_015722	TTTC	2	8	1146797	1146804	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7567	NC_015722	TCT	2	6	1146817	1146822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7570	NC_015722	ATT	2	6	1146847	1146852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_015722	TAAA	2	8	1146863	1146870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_015722	CTA	2	6	1146878	1146883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_015722	TA	3	6	1146882	1146887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_015722	CTT	2	6	1146931	1146936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_015722	ATT	2	6	1146939	1146944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7576	NC_015722	TA	3	6	1146960	1146965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_015722	ACA	2	6	1147022	1147027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7579	NC_015722	CTAT	2	8	1147131	1147138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7580	NC_015722	ATA	2	6	1147146	1147151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_015722	TTAA	2	8	1147168	1147175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_015722	AT	3	6	1147191	1147196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_015722	ATC	2	6	1147200	1147205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_015722	GAT	2	6	1147236	1147241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_015722	TTC	2	6	1147332	1147337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_015722	TCA	2	6	1147354	1147359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7588	NC_015722	TGC	2	6	1147447	1147452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_015722	TCTGAT	2	12	1147453	1147464	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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7591	NC_015722	AG	3	6	1147617	1147622	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_015722	CTA	2	6	1147726	1147731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7593	NC_015722	CTTA	2	8	1147740	1147747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_015722	AGA	2	6	1147765	1147770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_015722	CTA	2	6	1147784	1147789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_015722	TA	3	6	1147797	1147802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_015722	CAT	2	6	1147816	1147821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_015722	CTA	2	6	1147843	1147848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_015722	ACCT	2	8	1147933	1147940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7600	NC_015722	AAT	2	6	1147981	1147986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_015722	CTG	2	6	1147987	1147992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_015722	ATG	2	6	1148035	1148040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_015722	TGAT	2	8	1148106	1148113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_015722	GTT	2	6	1148132	1148137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_015722	CTCTGC	2	12	1148148	1148159	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7606	NC_015722	TGT	2	6	1148167	1148172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_015722	TAG	2	6	1148177	1148182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_015722	T	6	6	1148305	1148310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_015722	T	6	6	1148317	1148322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_015722	ATA	2	6	1148324	1148329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_015722	CAC	2	6	1148395	1148400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7612	NC_015722	A	7	7	1148432	1148438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_015722	TATAA	2	10	1148490	1148499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_015722	TAG	2	6	1148504	1148509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_015722	AAT	2	6	1148511	1148516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_015722	ATCA	2	8	1148521	1148528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7617	NC_015722	ACT	2	6	1149341	1149346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_015722	CTG	2	6	1149449	1149454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7619	NC_015722	ATA	2	6	1149480	1149485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_015722	CTA	2	6	1149528	1149533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_015722	AT	3	6	1149563	1149568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_015722	CTT	2	6	1149593	1149598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_015722	GCA	2	6	1149642	1149647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_015722	TAT	2	6	1149672	1149677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_015722	GTA	2	6	1149756	1149761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_015722	AGT	2	6	1149800	1149805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_015722	AAT	2	6	1149889	1149894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_015722	TAC	2	6	1149930	1149935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_015722	TCA	2	6	1150001	1150006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7630	NC_015722	CTTT	2	8	1150068	1150075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7632	NC_015722	GTA	2	6	1150162	1150167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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