MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 8006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015722	GT	3	6	852401	852406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015722	TTTGCA	2	12	852413	852424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5503	NC_015722	ACG	2	6	852435	852440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_015722	C	6	6	852441	852446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5505	NC_015722	CCAC	2	8	852449	852456	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5506	NC_015722	GTC	2	6	852465	852470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015722	TCAC	2	8	852527	852534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015722	CAT	2	6	852542	852547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015722	CTA	2	6	852566	852571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_015722	TAAA	2	8	852572	852579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015722	TTTA	2	8	852587	852594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_015722	GTT	2	6	852614	852619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_015722	TGA	2	6	852701	852706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_015722	ATAG	2	8	852713	852720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_015722	AGT	2	6	852739	852744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_015722	CTG	2	6	852753	852758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_015722	CTT	2	6	852795	852800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_015722	T	6	6	852804	852809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015722	CAG	2	6	852886	852891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_015722	TTC	2	6	852926	852931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_015722	ATT	2	6	852932	852937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_015722	TA	3	6	852943	852948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015722	CAA	2	6	852949	852954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_015722	A	7	7	852953	852959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_015722	TCA	2	6	853453	853458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_015722	TCA	2	6	853922	853927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_015722	T	6	6	853929	853934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_015722	AAG	2	6	854011	854016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_015722	TGA	2	6	854063	854068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_015722	AT	3	6	854168	854173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_015722	AG	3	6	854207	854212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_015722	TCAA	2	8	854293	854300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_015722	AAG	2	6	854313	854318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_015722	GTT	2	6	854321	854326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_015722	TC	3	6	854476	854481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5536	NC_015722	TTA	2	6	854551	854556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015722	GTT	2	6	854876	854881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_015722	ATC	2	6	854892	854897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_015722	CAAA	2	8	854901	854908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_015722	CTT	2	6	854977	854982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_015722	TAA	2	6	855029	855034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_015722	ACT	2	6	855107	855112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015722	GCT	2	6	855142	855147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_015722	ATA	2	6	855169	855174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_015722	CTC	2	6	855177	855182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_015722	CTT	2	6	855198	855203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_015722	TAAA	2	8	855214	855221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_015722	TC	3	6	855257	855262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5549	NC_015722	GTGG	2	8	855272	855279	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_015722	GT	3	6	855284	855289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_015722	TTTGCA	2	12	855296	855307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5552	NC_015722	ACG	2	6	855318	855323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_015722	C	6	6	855324	855329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5554	NC_015722	CCAC	2	8	855332	855339	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5555	NC_015722	GTC	2	6	855348	855353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_015722	TCAC	2	8	855410	855417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_015722	CAT	2	6	855425	855430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_015722	CTA	2	6	855449	855454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_015722	TAAA	2	8	855455	855462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_015722	TTTA	2	8	855470	855477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_015722	GTT	2	6	855497	855502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_015722	TGA	2	6	855584	855589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015722	ATAG	2	8	855596	855603	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015722	AGT	2	6	855622	855627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_015722	CTG	2	6	855636	855641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_015722	T	6	6	855672	855677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_015722	CA	3	6	855749	855754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_015722	T	6	6	855806	855811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_015722	TCTA	2	8	855858	855865	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_015722	ACA	2	6	855906	855911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_015722	AATT	2	8	855923	855930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_015722	CCGTAA	2	12	857469	857480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_015722	TTACTT	2	12	857509	857520	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5574	NC_015722	GT	3	6	857532	857537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_015722	AGA	2	6	857558	857563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_015722	GCTAAA	2	12	857568	857579	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5577	NC_015722	GT	3	6	857580	857585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_015722	AT	3	6	857626	857631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_015722	GTG	2	6	857731	857736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_015722	A	6	6	857769	857774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_015722	A	7	7	857795	857801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_015722	A	6	6	857811	857816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015722	CAA	2	6	857839	857844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_015722	TAT	2	6	858489	858494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_015722	GAA	2	6	858499	858504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_015722	CAT	2	6	858527	858532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_015722	CAG	2	6	858551	858556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_015722	TATT	2	8	858829	858836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_015722	A	6	6	859111	859116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_015722	TAA	2	6	859126	859131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_015722	TGC	2	6	859204	859209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_015722	TAT	2	6	859271	859276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_015722	TTA	2	6	859333	859338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_015722	CTTA	2	8	859444	859451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_015722	ATA	2	6	862077	862082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_015722	GCT	2	6	862104	862109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_015722	AGG	2	6	862150	862155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_015722	CAA	2	6	862218	862223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_015722	TAT	2	6	862685	862690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_015722	ATC	2	6	865513	865518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_015722	TA	3	6	865565	865570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_015722	TTG	2	6	865589	865594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_015722	TTTAAT	2	12	866168	866179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015722	T	8	8	866202	866209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_015722	ATT	2	6	866216	866221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_015722	AAT	2	6	866232	866237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_015722	ACC	2	6	866309	866314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_015722	TAA	2	6	866315	866320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_015722	ATAA	2	8	866338	866345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_015722	GTA	2	6	866361	866366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_015722	TAATC	2	10	867383	867392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5614	NC_015722	TTATG	2	10	867502	867511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_015722	T	6	6	867521	867526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_015722	T	6	6	867533	867538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_015722	TGG	2	6	867580	867585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015722	GCT	2	6	867620	867625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_015722	ATT	2	6	867646	867651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_015722	AAC	2	6	867738	867743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_015722	TACT	2	8	867824	867831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_015722	ATCA	2	8	867836	867843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_015722	AT	3	6	867944	867949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015722	GTG	2	6	868007	868012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_015722	TCAA	2	8	868053	868060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_015722	AAG	2	6	868073	868078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_015722	GTT	2	6	868081	868086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_015722	GTTTT	2	10	868103	868112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015722	TGA	2	6	868125	868130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_015722	TC	3	6	868267	868272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5631	NC_015722	TTA	2	6	868342	868347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5632	NC_015722	TTG	2	6	868387	868392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_015722	TGTT	2	8	868405	868412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5634	NC_015722	GCA	2	6	868420	868425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5636	NC_015722	CAA	2	6	868471	868476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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