MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellvibrio gilvus ATCC 13127 chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015671	CTCGCG	2	12	38956	38967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015671	GGTTCA	2	12	62896	62907	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015671	CCCCCG	2	12	79192	79203	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
4	NC_015671	CCCGCG	2	12	83724	83735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_015671	GCCGGG	2	12	94713	94724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015671	CCGAAC	2	12	142265	142276	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015671	TGGGGG	2	12	165219	165230	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015671	GGACCC	2	12	173671	173682	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_015671	CCGGCC	2	12	173749	173760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015671	AGGGCG	2	12	197374	197385	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_015671	AGCACG	2	12	234256	234267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015671	GGCTCG	2	12	236153	236164	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015671	CGATCG	2	12	236944	236955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015671	TCACTG	2	12	262822	262833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015671	CGCCGT	2	12	283197	283208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015671	CGTCGA	2	12	283332	283343	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015671	TACGTC	2	12	283432	283443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015671	CGACCA	2	12	292387	292398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015671	GGCCCG	2	12	292511	292522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_015671	CGATCA	2	12	292882	292893	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015671	TCGCTG	2	12	300098	300109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015671	GGGTGG	2	12	314893	314904	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015671	GCACCG	2	12	357923	357934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015671	GCGCGT	2	12	435533	435544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015671	CCGGAC	2	12	496305	496316	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_015671	ACCCGA	2	12	546405	546416	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015671	CCGCGT	2	12	557694	557705	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015671	CCCGCC	2	12	558199	558210	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
29	NC_015671	CTCGCC	4	24	567039	567062	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015671	TCACCG	2	12	582447	582458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015671	GCCAGG	2	12	586111	586122	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015671	CGGCGC	2	12	650617	650628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015671	CCGTCG	2	12	672958	672969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_015671	CGGAGA	2	12	684926	684937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015671	CGCTGG	2	12	691158	691169	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015671	GCGGCC	2	12	698416	698427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015671	TCCGGC	2	12	698445	698456	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015671	TGGACC	2	12	725627	725638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015671	GGCGCG	2	12	764443	764454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015671	CGTGCG	2	12	802622	802633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015671	GCGCCG	2	12	852224	852235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015671	CCCGCT	2	12	853767	853778	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015671	GCGCGA	2	12	882358	882369	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015671	CAACGA	2	12	898062	898073	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015671	GGTCAC	2	12	946897	946908	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015671	CGGACG	2	12	1015299	1015310	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015671	CGACGC	2	12	1017835	1017846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015671	CGTGCG	2	12	1018765	1018776	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015671	CGGCCC	2	12	1043702	1043713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015671	GCGCCC	2	12	1088165	1088176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015671	TGGGGG	2	12	1154970	1154981	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015671	ACCGGC	2	12	1174851	1174862	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015671	ACCCGC	2	12	1263943	1263954	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015671	GCCGCG	2	12	1270184	1270195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015671	ACGCGG	2	12	1311098	1311109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015671	GGTGCA	2	12	1313321	1313332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015671	GTGGCC	2	12	1342477	1342488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015671	GCGGCA	2	12	1458160	1458171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015671	CGGTTG	2	12	1468413	1468424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_015671	GACGGG	2	12	1481544	1481555	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015671	GCAGGG	2	12	1484045	1484056	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015671	GGGGGT	2	12	1555535	1555546	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015671	CAGTGG	2	12	1563632	1563643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015671	CGTGCG	2	12	1608581	1608592	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015671	CCCGGC	2	12	1627573	1627584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_015671	CACATG	2	12	1638935	1638946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015671	CCGTCG	2	12	1651932	1651943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015671	CGACCG	2	12	1681071	1681082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015671	CGAGCA	2	12	1681272	1681283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015671	GTCGCG	2	12	1681382	1681393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015671	TCGAGG	2	12	1690430	1690441	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015671	GACGGC	2	12	1708349	1708360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015671	CGGTGG	2	12	1752367	1752378	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015671	CGCGCA	2	12	1783900	1783911	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015671	TGCGGC	2	12	1817887	1817898	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015671	TCGGCG	2	12	1824903	1824914	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015671	GCCCCA	2	12	1828757	1828768	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_015671	CGACCA	8	48	1871280	1871327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_015671	GGCCGC	2	12	1874251	1874262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015671	CCACGA	2	12	1878281	1878292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015671	CGGCCG	2	12	1878428	1878439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015671	CCGCGG	2	12	1878686	1878697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015671	GCCGCG	2	12	1890289	1890300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015671	GGCACG	2	12	1929324	1929335	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015671	GCGCCC	2	12	2002777	2002788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015671	GTGACC	2	12	2020238	2020249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015671	CTCGAC	2	12	2020430	2020441	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015671	TCGCCG	2	12	2105782	2105793	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015671	TGCACT	2	12	2107440	2107451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015671	CACACG	2	12	2109698	2109709	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_015671	CTCGGC	2	12	2142513	2142524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015671	TGACCT	2	12	2142767	2142778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015671	GTACTT	2	12	2142921	2142932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_015671	CGCACG	2	12	2148882	2148893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015671	CGCCCG	2	12	2166685	2166696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015671	CGCACG	2	12	2208619	2208630	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015671	TCCGCG	2	12	2257478	2257489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_015671	CTTGAC	2	12	2334263	2334274	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015671	CTCGTC	2	12	2359984	2359995	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015671	CGTGCG	2	12	2363894	2363905	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015671	CCGCGC	2	12	2388196	2388207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015671	CCCCAC	2	12	2429984	2429995	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_015671	ACCCCC	2	12	2436669	2436680	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
104	NC_015671	GCCCGC	2	12	2465227	2465238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_015671	CCCGGA	2	12	2487938	2487949	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015671	TGCGCC	2	12	2504277	2504288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015671	CCCGCA	2	12	2504353	2504364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015671	GCCCGG	2	12	2506675	2506686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015671	CCGGGG	2	12	2510167	2510178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015671	GAGGTG	2	12	2527020	2527031	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015671	CCCGGT	2	12	2559783	2559794	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_015671	GGCCGG	2	12	2679781	2679792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015671	CCTGCA	2	12	2692654	2692665	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015671	GCGCCA	2	12	2692886	2692897	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015671	TGCACT	2	12	2693874	2693885	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015671	CACACG	2	12	2696134	2696145	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015671	CCGCGC	2	12	2714802	2714813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_015671	CGACGC	2	12	2725560	2725571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015671	GACGCG	2	12	2740851	2740862	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015671	GCCGAC	2	12	2774141	2774152	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015671	CGCACC	2	12	2775248	2775259	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015671	CGGGCC	2	12	2785058	2785069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015671	CCCACC	2	12	2841558	2841569	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_015671	ACGGCC	2	12	2881181	2881192	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015671	CGGGGG	2	12	2902723	2902734	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_015671	GGGGTG	2	12	2902827	2902838	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015671	GGCGCG	2	12	2915862	2915873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015671	TCACGC	2	12	2988655	2988666	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_015671	GGTGGG	2	12	3035998	3036009	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015671	CCCCGC	2	12	3048848	3048859	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
131	NC_015671	CCTGAT	2	12	3093694	3093705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015671	AAGGTC	2	12	3105224	3105235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_015671	AGCCAC	2	12	3115099	3115110	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015671	CTCGCG	2	12	3140053	3140064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015671	TACGGG	2	12	3159415	3159426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_015671	GGAGCG	2	12	3211861	3211872	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_015671	CCCGGT	2	12	3281830	3281841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_015671	ACGGCG	2	12	3307304	3307315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015671	CGTCGA	2	12	3346985	3346996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_015671	GCCCCG	2	12	3523314	3523325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.