MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015470	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015470	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015470	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015470	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015470	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015470	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015470	ATTT	2	8	26655	26662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015470	ATTA	2	8	26666	26673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015470	TTTC	2	8	31651	31658	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015470	TCTA	2	8	32055	32062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015470	AATT	2	8	32379	32386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015470	TTAA	2	8	32419	32426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015470	TTAA	2	8	33515	33522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015470	AGAT	2	8	33558	33565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015470	TCAA	2	8	37780	37787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015470	GTCG	2	8	44199	44206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015470	ATAA	2	8	49532	49539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015470	AAAG	2	8	52612	52619	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015470	TTTA	2	8	52622	52629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015470	GAAG	2	8	52725	52732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015470	AAAG	2	8	54790	54797	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015470	GTTT	2	8	59896	59903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015470	TATG	2	8	59911	59918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015470	CTTT	2	8	64571	64578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015470	GATA	2	8	70219	70226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015470	TAAT	2	8	77664	77671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015470	TATT	2	8	77681	77688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015470	TTAA	2	8	77690	77697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015470	TAAA	2	8	77721	77728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015470	ATTA	2	8	77738	77745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015470	TAAA	2	8	80502	80509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015470	AAAG	2	8	83482	83489	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015470	CAAG	2	8	84839	84846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015470	TTTA	2	8	87395	87402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015470	ATAA	2	8	87450	87457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015470	ATGT	2	8	93632	93639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015470	ATAC	2	8	99190	99197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015470	AACA	2	8	99361	99368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015470	TGAT	2	8	99629	99636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015470	TTAA	2	8	107110	107117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015470	ATTT	2	8	122758	122765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015470	AAAG	2	8	122933	122940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015470	TAAT	2	8	123102	123109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015470	TTAA	2	8	128517	128524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015470	CTGG	2	8	128668	128675	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015470	TTTA	2	8	128694	128701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015470	TGAT	2	8	139125	139132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015470	TAGT	2	8	140253	140260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015470	TTAT	2	8	146094	146101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015470	TTAT	2	8	146129	146136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015470	GTAA	2	8	146150	146157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015470	TTTA	2	8	147424	147431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015470	AATA	2	8	147479	147486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015470	ATTT	3	12	147537	147548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015470	TAAG	2	8	148604	148611	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015470	AAAG	2	8	148634	148641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015470	GATG	2	8	159378	159385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015470	GTAG	2	8	159404	159411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015470	AAAT	2	8	164573	164580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015470	ACTT	2	8	164626	164633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015470	TAGT	2	8	170085	170092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015470	TTCC	2	8	170397	170404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015470	AAGA	2	8	173682	173689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015470	TAAA	2	8	179358	179365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015470	TTTA	2	8	179419	179426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015470	AACT	2	8	179435	179442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015470	AGGG	2	8	185864	185871	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015470	AACA	2	8	185977	185984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015470	GATT	2	8	187303	187310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015470	AGAT	2	8	191790	191797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015470	GTTT	2	8	193723	193730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015470	TATT	2	8	195449	195456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015470	TAAA	3	12	195480	195491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015470	GTTT	2	8	196530	196537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015470	CACT	2	8	198178	198185	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015470	GCTT	2	8	198272	198279	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015470	CTTT	2	8	198432	198439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_015470	ATTA	2	8	198449	198456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015470	CTTT	2	8	198607	198614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015470	AATC	2	8	198615	198622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_015470	ATTA	2	8	198752	198759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015470	TAAT	2	8	201080	201087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015470	TAAA	2	8	204093	204100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015470	CAAA	2	8	205216	205223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015470	TTTA	2	8	205662	205669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015470	GTTT	2	8	211874	211881	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015470	GAAG	2	8	213207	213214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015470	AAAG	2	8	213269	213276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015470	CATA	2	8	213546	213553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015470	ATGT	2	8	213662	213669	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015470	AAGA	2	8	222929	222936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015470	AACA	2	8	226747	226754	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015470	ATTA	2	8	232251	232258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015470	CTTG	2	8	238177	238184	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_015470	GAAT	2	8	238228	238235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015470	AATT	2	8	238367	238374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015470	TTTC	2	8	238467	238474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015470	ATAA	2	8	239849	239856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015470	GCTT	2	8	240027	240034	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015470	GTTT	2	8	240898	240905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015470	TCAT	2	8	241128	241135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015470	AGGA	2	8	244058	244065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015470	TAAA	2	8	263028	263035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015470	GTTC	2	8	266715	266722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015470	TAAT	2	8	266818	266825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015470	AATT	2	8	266833	266840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015470	TAAT	2	8	267910	267917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015470	TAAA	2	8	268024	268031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015470	TTGT	2	8	274652	274659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015470	AAAT	2	8	276697	276704	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015470	TACT	2	8	281226	281233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015470	AATT	2	8	281247	281254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015470	TGTA	2	8	281290	281297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015470	GTTT	2	8	282199	282206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015470	ATTT	2	8	289852	289859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015470	TAAT	3	12	289899	289910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015470	TAGA	2	8	291736	291743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015470	TCTA	2	8	291768	291775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015470	TATT	2	8	291819	291826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015470	AATG	2	8	299916	299923	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015470	GTTT	2	8	300065	300072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015470	TGTT	2	8	301382	301389	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015470	ATTG	2	8	301469	301476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015470	TTGA	2	8	301540	301547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015470	GATT	2	8	307820	307827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015470	GAAA	2	8	307952	307959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015470	CTAC	2	8	308020	308027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_015470	GGGA	2	8	310680	310687	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015470	ATGC	2	8	319212	319219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015470	TTCG	2	8	319333	319340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015470	AGGA	2	8	319350	319357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015470	GCTG	2	8	327376	327383	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015470	TGCA	2	8	332831	332838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015470	AAAG	2	8	332968	332975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015470	GTTT	2	8	335585	335592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015470	AGTT	2	8	342407	342414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015470	CAGA	2	8	343251	343258	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_015470	TGAT	2	8	343277	343284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015470	TATT	2	8	345463	345470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015470	ATAA	2	8	349273	349280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015470	TCTT	2	8	350038	350045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_015470	AGAA	2	8	352040	352047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015470	ATTT	2	8	354586	354593	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015470	TAGT	2	8	354641	354648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015470	ATAC	2	8	356848	356855	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_015470	TTTG	2	8	362140	362147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015470	AGAA	2	8	362264	362271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015470	GCTT	2	8	363488	363495	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_015470	TTAA	2	8	372397	372404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015470	ATCT	2	8	375412	375419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015470	AACT	2	8	376256	376263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015470	GTTT	2	8	387243	387250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.