MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	ACTT	2	8	31	38	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015426	TTAT	2	8	77	84	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	TTAT	2	8	3015	3022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015426	CCTT	2	8	3262	3269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015426	ATTT	2	8	3396	3403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015426	TGTA	2	8	3576	3583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015426	ATTA	2	8	3959	3966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015426	CATA	2	8	3973	3980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015426	ATTA	2	8	3986	3993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015426	ATTT	2	8	5346	5353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	TTAC	2	8	5392	5399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015426	AGTA	2	8	7425	7432	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015426	ATAA	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015426	TAGA	2	8	7609	7616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015426	AATA	2	8	7835	7842	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015426	AATT	2	8	7895	7902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015426	TTAT	2	8	7963	7970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015426	AACC	2	8	8865	8872	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015426	AAAG	2	8	8884	8891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015426	ATAG	2	8	9205	9212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015426	ATTT	2	8	10701	10708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015426	TTTA	2	8	10757	10764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	ATAA	2	8	10796	10803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015426	AATA	2	8	10811	10818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015426	AATT	2	8	14268	14275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015426	TTAT	2	8	14364	14371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015426	GTTT	2	8	14950	14957	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015426	ATAA	2	8	15873	15880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015426	TATT	2	8	15910	15917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015426	AAAT	2	8	15946	15953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015426	ATTT	2	8	15962	15969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015426	AAAT	2	8	16129	16136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015426	TAAA	2	8	22255	22262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015426	ATTT	2	8	22266	22273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015426	TATT	2	8	22333	22340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015426	AATT	2	8	26859	26866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015426	AAAT	2	8	26899	26906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015426	TAAA	2	8	27810	27817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015426	ATTT	2	8	27837	27844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015426	TAAA	2	8	30838	30845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015426	AAAT	2	8	30990	30997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015426	ACAA	2	8	33106	33113	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015426	ATAA	2	8	33570	33577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015426	CTTT	2	8	33593	33600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_015426	AAAG	2	8	33777	33784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015426	TGGT	2	8	34144	34151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015426	CTTC	3	12	43136	43147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_015426	AGCT	2	8	44481	44488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015426	TGAT	2	8	44569	44576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015426	CATA	2	8	46177	46184	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015426	TACA	2	8	46293	46300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015426	CTTC	2	8	46322	46329	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015426	AATC	2	8	50536	50543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015426	GATG	2	8	50553	50560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015426	ATCT	2	8	51558	51565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015426	TAAA	2	8	51801	51808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015426	TAAT	2	8	51823	51830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015426	ATTT	2	8	52914	52921	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015426	ATTT	2	8	55043	55050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015426	CAAT	2	8	55545	55552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015426	TATT	2	8	56755	56762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015426	TAAT	2	8	56879	56886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015426	CTTT	2	8	57569	57576	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015426	AATA	2	8	59199	59206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015426	AATT	2	8	60745	60752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015426	ACAA	2	8	61800	61807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015426	TACT	2	8	61980	61987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015426	AATG	2	8	63011	63018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015426	TATT	2	8	65008	65015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015426	TAAT	2	8	66131	66138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015426	ATTA	2	8	72523	72530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015426	CTTA	2	8	73061	73068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015426	ACTT	2	8	73079	73086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015426	TAAT	2	8	73133	73140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015426	TTTG	2	8	74264	74271	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015426	TTGG	2	8	74305	74312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015426	TTAA	2	8	74822	74829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015426	TTTG	2	8	74875	74882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015426	AAAT	2	8	74903	74910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015426	TAAA	2	8	74945	74952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015426	AAAC	2	8	75368	75375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015426	TTTA	2	8	75421	75428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015426	TAAT	2	8	75526	75533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015426	TAAC	2	8	75873	75880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015426	TAAC	2	8	75940	75947	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015426	TAAC	2	8	76006	76013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015426	TAAC	2	8	76071	76078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015426	TAAC	2	8	76137	76144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015426	TAAC	2	8	76204	76211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_015426	TAAC	2	8	76271	76278	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_015426	TAAC	2	8	76338	76345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015426	TAAC	2	8	76402	76409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015426	TAAC	2	8	76468	76475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015426	TTTA	2	8	76526	76533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015426	TAAC	2	8	76534	76541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015426	TTAT	2	8	76790	76797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015426	TAAC	2	8	76862	76869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015426	TAAC	2	8	76928	76935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015426	TAAC	2	8	76997	77004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015426	TAAC	2	8	77062	77069	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015426	TAAC	2	8	77127	77134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015426	TTGA	2	8	77166	77173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015426	TAAC	2	8	77194	77201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015426	TAAC	2	8	77259	77266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015426	TAAC	2	8	77325	77332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015426	TAAC	2	8	77389	77396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_015426	TTTA	2	8	77424	77431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015426	TAAC	2	8	77454	77461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_015426	TAAC	2	8	77521	77528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015426	TAAC	2	8	77587	77594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_015426	CTTT	2	8	79905	79912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015426	GTAG	2	8	79914	79921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015426	TAAC	2	8	80701	80708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_015426	TAAC	2	8	80766	80773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015426	TAAC	2	8	80833	80840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015426	TAAC	2	8	80900	80907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015426	TAAG	2	8	80955	80962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015426	TAAC	2	8	80968	80975	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_015426	ATAG	2	8	81029	81036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015426	TAAC	2	8	82558	82565	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_015426	TAAC	2	8	82624	82631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_015426	TAAC	2	8	82689	82696	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015426	TAAC	2	8	83021	83028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015426	TAAT	2	8	84563	84570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015426	CAAT	2	8	87119	87126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_015426	AGAA	2	8	89418	89425	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015426	TTAT	2	8	95957	95964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015426	TATT	2	8	98693	98700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.