MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	TTA	2	6	22	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015426	TTA	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015426	AAG	2	6	59	64	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015426	TTC	2	6	680	685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015426	ATT	2	6	3275	3280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015426	AAC	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015426	ATA	2	6	3502	3507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015426	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015426	GTA	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015426	TTA	2	6	3564	3569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015426	GAA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015426	ATA	3	9	3616	3624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015426	AAC	2	6	3640	3645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015426	ATA	2	6	3818	3823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015426	ATA	2	6	3869	3874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015426	AGA	2	6	3930	3935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015426	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015426	GTA	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015426	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015426	AGG	2	6	4200	4205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015426	TAT	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015426	TAG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015426	ATT	2	6	5381	5386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015426	TAT	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015426	TAA	2	6	5641	5646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015426	ATG	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015426	GCA	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015426	TTA	2	6	7345	7350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015426	TTA	2	6	7362	7367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015426	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015426	AGA	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015426	TTC	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015426	AAC	2	6	7541	7546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015426	GAT	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015426	ATC	2	6	7590	7595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015426	TGT	2	6	7634	7639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015426	ATT	2	6	7730	7735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015426	TAA	2	6	7887	7892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015426	TTA	2	6	7908	7913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015426	TTA	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015426	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015426	TAA	2	6	8020	8025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015426	TAT	2	6	8049	8054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015426	TAC	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015426	TGA	2	6	8120	8125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015426	TAA	2	6	8149	8154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015426	GAT	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015426	AGG	2	6	8285	8290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015426	ATT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015426	TAA	3	9	9030	9038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015426	AAT	2	6	9645	9650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015426	ATG	2	6	9896	9901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015426	GTA	2	6	9965	9970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015426	AAT	2	6	9976	9981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015426	GAA	2	6	10054	10059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015426	TTA	2	6	10682	10687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015426	ATT	2	6	10731	10736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015426	TTA	2	6	10784	10789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015426	GAA	2	6	10908	10913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015426	TAA	3	9	10916	10924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015426	AAG	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015426	CTT	2	6	10948	10953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015426	ATA	2	6	12999	13004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015426	ATA	2	6	14219	14224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015426	TAC	2	6	14245	14250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015426	ACC	2	6	14309	14314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015426	ATA	2	6	14328	14333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015426	CTA	2	6	14335	14340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015426	TAA	2	6	14964	14969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015426	ATA	2	6	14980	14985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015426	TTA	2	6	15012	15017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015426	CAT	2	6	15226	15231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015426	TTA	2	6	15725	15730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015426	ATA	2	6	15931	15936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015426	ATA	3	9	16004	16012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015426	ATT	2	6	16099	16104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015426	GAA	2	6	16149	16154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015426	TAA	2	6	17600	17605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015426	TAT	2	6	17630	17635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015426	ATT	2	6	17787	17792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015426	AGT	2	6	17814	17819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015426	AAC	2	6	17898	17903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015426	AGA	2	6	18013	18018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015426	CTA	2	6	18021	18026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015426	CCT	2	6	18671	18676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015426	AGG	2	6	18693	18698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015426	TGT	2	6	18702	18707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015426	ATA	2	6	18763	18768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015426	ATT	2	6	18809	18814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015426	TAT	2	6	18837	18842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015426	AGG	2	6	18866	18871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015426	ATT	2	6	20693	20698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015426	TAT	2	6	20731	20736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015426	TTA	2	6	20779	20784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015426	TAA	2	6	20822	20827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015426	AGA	2	6	20877	20882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015426	TAA	2	6	20895	20900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015426	TAA	2	6	21960	21965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015426	TGT	2	6	22042	22047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015426	CAA	2	6	22208	22213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015426	AAT	2	6	24118	24123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015426	GCA	2	6	24279	24284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015426	ATA	2	6	25477	25482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015426	GTT	3	9	26590	26598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015426	TAA	2	6	26668	26673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015426	ATA	2	6	26676	26681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015426	TCA	2	6	26723	26728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_015426	TAA	3	9	26799	26807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015426	TGT	2	6	27755	27760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015426	TCC	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015426	TAA	2	6	29361	29366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015426	TAT	2	6	29379	29384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015426	AAT	2	6	29389	29394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015426	GTT	2	6	30913	30918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015426	TAA	2	6	31008	31013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015426	ATT	3	9	31243	31251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015426	AAT	2	6	31265	31270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015426	AGG	2	6	31482	31487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015426	TAA	2	6	33085	33090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015426	TTA	2	6	33189	33194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015426	ACA	2	6	33557	33562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015426	TAT	2	6	33651	33656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015426	TTA	3	9	33681	33689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015426	ATA	2	6	33707	33712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015426	GTA	2	6	33744	33749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015426	AAG	2	6	33794	33799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015426	ATA	2	6	33862	33867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015426	AGG	2	6	34302	34307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015426	TCC	2	6	34312	34317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_015426	TAT	2	6	34449	34454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015426	GTC	2	6	34461	34466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015426	AAC	2	6	34467	34472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015426	ATC	2	6	34494	34499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015426	AAC	2	6	34535	34540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015426	TAA	2	6	34568	34573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015426	ACT	2	6	34678	34683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015426	ATG	2	6	34715	34720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015426	AAT	2	6	34745	34750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015426	ATT	2	6	34764	34769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015426	AAC	2	6	34812	34817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015426	TGA	2	6	34844	34849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015426	TAT	2	6	35988	35993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015426	ATT	2	6	38155	38160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015426	CTA	2	6	38235	38240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_015426	ATT	2	6	39554	39559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_015426	TTA	2	6	39938	39943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_015426	TCT	2	6	40029	40034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NC_015426	TAA	2	6	44398	44403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015426	TTC	2	6	44424	44429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.