MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	ATATT	2	10	838	847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	TATCA	2	10	3153	3162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015418	TATCA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015418	TGATA	2	10	7365	7374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	TAATT	2	10	7387	7396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015418	CAATA	2	10	9750	9759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015418	ATATA	2	10	13425	13434	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015418	TAAAA	2	10	16883	16892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015418	ATATT	2	10	19115	19124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015418	TATAG	2	10	23351	23360	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015418	ACTAT	2	10	26900	26909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015418	ATTTT	2	10	27048	27057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015418	TCCTT	2	10	28138	28147	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_015418	TATAA	2	10	28244	28253	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015418	GCTTT	2	10	28483	28492	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015418	TTTGT	2	10	29474	29483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015418	ATTAT	2	10	31777	31786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015418	TAAAG	2	10	35673	35682	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015418	TAATA	2	10	37939	37948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015418	ATGAA	2	10	39013	39022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015418	AATGT	2	10	39609	39618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015418	ATTTT	2	10	39643	39652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015418	ATAAA	2	10	43100	43109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015418	ATACT	2	10	43158	43167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015418	TAATA	2	10	46868	46877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015418	TTGAA	2	10	47749	47758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015418	TTTAT	2	10	48337	48346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015418	TAAAA	2	10	51691	51700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015418	TTGTT	2	10	51905	51914	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015418	CACTA	2	10	53709	53718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015418	AGCTA	2	10	57852	57861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015418	TAAAG	2	10	59218	59227	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	TAAGT	2	10	59580	59589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015418	CTATT	2	10	61114	61123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015418	TTTGT	2	10	71613	71622	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015418	TCTTA	2	10	75445	75454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015418	TAATA	2	10	75651	75660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015418	TAAAA	2	10	76304	76313	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015418	TACTA	2	10	77056	77065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015418	TTAAA	2	10	77150	77159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.