MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	ATTT	2	8	145	152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015418	GTTT	2	8	241	248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015418	GATT	2	8	337	344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015418	AAAT	2	8	398	405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015418	ACTC	2	8	492	499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015418	TAAA	2	8	814	821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015418	ATTA	2	8	856	863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015418	AATT	2	8	4178	4185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015418	TAAA	2	8	5327	5334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015418	TAAA	2	8	6390	6397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015418	AAAT	2	8	6903	6910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015418	ATTT	2	8	7830	7837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015418	GTTT	2	8	9581	9588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015418	TATT	2	8	13294	13301	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015418	AATT	2	8	13351	13358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015418	TAAA	2	8	14306	14313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015418	ATGT	2	8	15366	15373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015418	AACT	2	8	19282	19289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015418	ATCT	2	8	20677	20684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015418	ATTT	2	8	20772	20779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015418	GTCA	2	8	20945	20952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015418	TTAA	2	8	20979	20986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015418	ACTA	2	8	21034	21041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015418	CTAT	2	8	23384	23391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015418	TTAT	2	8	24270	24277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015418	AAAG	2	8	24478	24485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015418	ATTT	2	8	26981	26988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015418	CATT	2	8	28365	28372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_015418	TACT	2	8	31326	31333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015418	AACT	2	8	31861	31868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015418	AATA	2	8	33238	33245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015418	TAAA	2	8	33291	33298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015418	TATG	2	8	37963	37970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015418	TCTT	2	8	37989	37996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015418	AAAT	2	8	40774	40781	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015418	TTTA	2	8	40796	40803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015418	TACA	2	8	43369	43376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015418	ATTT	2	8	45491	45498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015418	TAAA	2	8	46964	46971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015418	TTTC	2	8	47083	47090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015418	CCAA	2	8	47176	47183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015418	ATTT	2	8	47649	47656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015418	CAAA	2	8	48063	48070	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015418	ATTA	2	8	48072	48079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015418	TATT	2	8	49589	49596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015418	TAAT	2	8	49713	49720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015418	TTGT	2	8	51774	51781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015418	TTAA	2	8	52410	52417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015418	TGTA	2	8	52845	52852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015418	TTTA	2	8	53725	53732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015418	TACT	2	8	53745	53752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015418	TATT	2	8	56448	56455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015418	TATT	2	8	56512	56519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015418	TTAA	2	8	57916	57923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015418	AAAT	2	8	58042	58049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015418	TTAA	2	8	58054	58061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015418	AGGT	2	8	59530	59537	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015418	TTTA	2	8	60008	60015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015418	TAAC	2	8	64381	64388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015418	AATA	2	8	67258	67265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015418	TTAT	2	8	67546	67553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015418	TATT	2	8	67554	67561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015418	CGTA	2	8	67826	67833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015418	CTTT	2	8	71357	71364	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_015418	ATTT	2	8	71368	71375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015418	CTTC	2	8	71696	71703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015418	ATTT	2	8	72349	72356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015418	AATT	2	8	73766	73773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015418	ATGT	2	8	73774	73781	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015418	TTAA	2	8	73896	73903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015418	TACA	2	8	76350	76357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015418	CTTA	2	8	76835	76842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_015418	TAAA	2	8	76919	76926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015418	TTAT	2	8	77755	77762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015418	AAAT	2	8	78336	78343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015418	ACTA	2	8	79029	79036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015418	TATT	2	8	79064	79071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015418	GTAT	2	8	79093	79100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015418	TTAA	2	8	79157	79164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.