MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p1BKT015925

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015417	TTTA	2	8	351	358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015417	TTAT	2	8	479	486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015417	TCAA	2	8	498	505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015417	CAAA	2	8	721	728	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015417	AAAT	2	8	739	746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015417	AAAG	2	8	810	817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015417	ATGG	2	8	973	980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015417	AATT	2	8	1021	1028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015417	CAAT	2	8	1441	1448	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015417	TTGG	2	8	1462	1469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015417	TAAG	2	8	1687	1694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015417	TTTA	2	8	1867	1874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015417	TAAA	2	8	1893	1900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015417	ATTA	2	8	2718	2725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015417	ATTT	2	8	2869	2876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015417	AAAG	2	8	3302	3309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015417	TACT	2	8	3361	3368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_015417	ACTA	2	8	3383	3390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015417	CAAA	2	8	3482	3489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015417	TATT	2	8	5705	5712	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015417	AAGC	2	8	5808	5815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015417	AAAT	2	8	5986	5993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015417	TTAT	2	8	6064	6071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015417	TAAA	2	8	6263	6270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015417	AAAT	2	8	8465	8472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015417	ATAA	2	8	11869	11876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015417	ACTA	2	8	13117	13124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015417	AGTG	2	8	13287	13294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015417	ATAG	2	8	16614	16621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015417	CCAA	2	8	16629	16636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015417	ATTA	2	8	16995	17002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015417	ATAA	2	8	17003	17010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015417	TAAA	2	8	17090	17097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015417	TAAA	2	8	17157	17164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015417	TAAG	2	8	17227	17234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015417	ATAA	2	8	17859	17866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015417	ATAA	2	8	17926	17933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015417	AATA	2	8	17990	17997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015417	GGTT	2	8	18223	18230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015417	AAAT	2	8	22560	22567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015417	ATTA	2	8	24910	24917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015417	AATT	2	8	24953	24960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015417	TTGG	2	8	24977	24984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015417	TAAT	2	8	25325	25332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015417	AAAT	2	8	25448	25455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015417	AAAT	2	8	25509	25516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015417	ATAG	2	8	25618	25625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015417	TAAT	2	8	27244	27251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015417	CTTG	2	8	27550	27557	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_015417	TAAT	2	8	27572	27579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015417	TAAA	2	8	27730	27737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015417	AAAT	2	8	27823	27830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015417	AAAG	2	8	32892	32899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015417	ATTA	2	8	32956	32963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015417	AAGT	2	8	36803	36810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015417	GATT	2	8	40073	40080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015417	TAAA	2	8	40471	40478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015417	TCAA	2	8	41497	41504	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015417	ATTA	2	8	42927	42934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015417	GAAT	2	8	43743	43750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015417	CTTT	2	8	46298	46305	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015417	TTAA	2	8	46320	46327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015417	TTAA	2	8	47451	47458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015417	TAAA	2	8	47467	47474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015417	AAAT	2	8	50071	50078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015417	AAAG	2	8	51075	51082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015417	AGGT	2	8	53254	53261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015417	AAAG	2	8	58722	58729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015417	AAAG	2	8	58776	58783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015417	TAAA	2	8	58793	58800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015417	AATA	2	8	59247	59254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015417	AATT	2	8	59264	59271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015417	AAAT	2	8	60040	60047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015417	AGAA	2	8	60060	60067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015417	AAAT	2	8	60265	60272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015417	TTAA	2	8	61618	61625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015417	AAAT	2	8	61626	61633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015417	AAAC	2	8	73184	73191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015417	ATGA	2	8	73833	73840	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015417	ATTT	2	8	73863	73870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015417	ACTT	2	8	75371	75378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015417	TAAT	2	8	75423	75430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015417	AAGT	2	8	75621	75628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015417	ATAA	2	8	76509	76516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015417	ATTA	2	8	76519	76526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015417	AAAT	2	8	76527	76534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015417	ATTA	2	8	76615	76622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015417	AAGA	2	8	76627	76634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015417	TAAT	2	8	76658	76665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015417	TTAT	2	8	76857	76864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015417	TAAA	2	8	77523	77530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015417	AATT	2	8	77644	77651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015417	TTGT	2	8	78362	78369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015417	AAAT	2	8	82056	82063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015417	AAAG	2	8	82068	82075	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015417	TAAT	2	8	82137	82144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015417	ACAT	2	8	82246	82253	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_015417	TTTA	2	8	82840	82847	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015417	TAAT	2	8	82888	82895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015417	AAGG	2	8	82926	82933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015417	TTTA	2	8	83449	83456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015417	ATTA	2	8	83560	83567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015417	TTAA	2	8	83569	83576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015417	TAAT	2	8	83600	83607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015417	AAGT	2	8	83638	83645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015417	TAAA	2	8	86659	86666	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015417	TTAT	2	8	87634	87641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015417	TTAA	2	8	95527	95534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015417	TAGT	2	8	95549	95556	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015417	AAAT	2	8	95595	95602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015417	CAAA	2	8	95685	95692	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015417	AATT	2	8	96708	96715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015417	AAGT	2	8	96731	96738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015417	ATAA	2	8	97119	97126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015417	GATA	2	8	97795	97802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015417	GTTG	2	8	98216	98223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015417	AGAA	2	8	100293	100300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015417	ATTA	2	8	100329	100336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015417	GCAA	2	8	100410	100417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_015417	AAAG	2	8	103691	103698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015417	ATTT	2	8	111284	111291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015417	ATTC	2	8	112355	112362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015417	ATTA	2	8	113959	113966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015417	ATTT	2	8	114398	114405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015417	GAGT	2	8	114465	114472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015417	TTGT	2	8	114592	114599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015417	TAAT	2	8	114879	114886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015417	TAAT	2	8	122544	122551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015417	ATTT	2	8	129830	129837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015417	ATTT	2	8	130378	130385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015417	AAAT	2	8	130393	130400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015417	ACTA	2	8	130440	130447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015417	ATTG	2	8	131630	131637	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015417	ATTA	2	8	131720	131727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015417	TAAT	2	8	132763	132770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015417	ATTT	2	8	134074	134081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015417	TATT	2	8	136116	136123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015417	TAAA	2	8	136145	136152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015417	ATAA	2	8	142695	142702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015417	TACA	2	8	145325	145332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015417	TTTA	2	8	145368	145375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015417	ATTC	2	8	150797	150804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_015417	CTGA	2	8	150956	150963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015417	TTTA	2	8	153567	153574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015417	ATTT	2	8	153940	153947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015417	TTGT	2	8	154037	154044	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015417	AAAT	2	8	156464	156471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015417	ATTA	2	8	156627	156634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015417	CAAT	2	8	156647	156654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015417	TTTA	2	8	157724	157731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015417	GAAC	2	8	158830	158837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_015417	TATT	2	8	158864	158871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015417	AAAT	2	8	158980	158987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015417	TTCC	2	8	159571	159578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_015417	ATTT	2	8	160904	160911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015417	TAAT	2	8	160987	160994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015417	TTTA	2	8	161036	161043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015417	TATG	2	8	161715	161722	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015417	TATT	2	8	165989	165996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015417	CTTT	2	8	168190	168197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015417	TTAA	2	8	168208	168215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015417	TTAT	2	8	169953	169960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015417	CTTT	2	8	177996	178003	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_015417	TAAA	2	8	178223	178230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015417	GGTA	2	8	182811	182818	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015417	AATT	2	8	183936	183943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015417	ATTT	2	8	184287	184294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015417	ATTT	2	8	188599	188606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015417	AATT	2	8	189095	189102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015417	TGTT	2	8	192014	192021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015417	TAAT	2	8	192130	192137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015417	TAAT	2	8	193662	193669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015417	TCAA	2	8	194459	194466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_015417	TTTC	2	8	196162	196169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_015417	AATC	2	8	196395	196402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
176	NC_015417	GAAT	2	8	200102	200109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015417	GGGA	2	8	200132	200139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015417	TTTA	2	8	200305	200312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015417	TCTA	2	8	200330	200337	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_015417	TCTA	2	8	200389	200396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_015417	ATAA	2	8	200497	200504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015417	ATTA	2	8	200508	200515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015417	ATTT	2	8	200549	200556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015417	TCTT	2	8	200635	200642	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_015417	TTAC	2	8	200677	200684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_015417	ATTT	2	8	201922	201929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015417	TAGA	2	8	202280	202287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015417	ATTT	2	8	202312	202319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015417	TATT	2	8	202331	202338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015417	AATT	2	8	202895	202902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.