MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 2302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015408	GAT	2	6	507503	507508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015408	T	6	6	509562	509567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015408	T	6	6	509580	509585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015408	T	6	6	509604	509609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015408	A	6	6	509634	509639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015408	GTC	2	6	509774	509779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015408	T	6	6	509849	509854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015408	CA	3	6	509899	509904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_015408	AAT	2	6	509913	509918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015408	AG	3	6	509923	509928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015408	AG	3	6	510272	510277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015408	CCCTT	2	10	510542	510551	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1013	NC_015408	T	6	6	510556	510561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015408	AAG	2	6	510562	510567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015408	T	6	6	510580	510585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015408	TTTTG	2	10	510607	510616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015408	TGA	2	6	511730	511735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_015408	TAG	2	6	511740	511745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015408	CAG	2	6	511748	511753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015408	ATG	2	6	511759	511764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015408	GAA	2	6	511805	511810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015408	TCA	2	6	511936	511941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_015408	AAG	2	6	512056	512061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015408	TTA	2	6	512063	512068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015408	GA	3	6	512093	512098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015408	ATC	2	6	512104	512109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015408	GCC	2	6	512208	512213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_015408	GAG	2	6	512231	512236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015408	TCC	2	6	512283	512288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_015408	ATGT	2	8	512341	512348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015408	AAAT	2	8	513986	513993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015408	GAT	2	6	514103	514108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015408	TCT	2	6	514115	514120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_015408	T	8	8	514131	514138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015408	GA	3	6	514140	514145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_015408	GT	3	6	514180	514185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015408	CT	3	6	514217	514222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_015408	TTTG	2	8	514230	514237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015408	A	6	6	519286	519291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015408	GAA	2	6	519385	519390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_015408	ATT	2	6	519434	519439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_015408	TA	3	6	519520	519525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015408	TCATGG	2	12	519564	519575	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1044	NC_015408	CCT	2	6	519576	519581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_015408	GCTT	2	8	519682	519689	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1046	NC_015408	TTTC	2	8	519706	519713	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_015408	AAG	2	6	519824	519829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015408	CTC	2	6	519873	519878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_015408	AAG	2	6	519949	519954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015408	AGA	2	6	519997	520002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015408	AG	4	8	520007	520014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015408	CCA	2	6	520038	520043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_015408	GGA	2	6	520060	520065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015408	T	6	6	520082	520087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015408	AGG	2	6	520089	520094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015408	TCC	2	6	520172	520177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_015408	GGA	2	6	520208	520213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_015408	TAT	3	9	520282	520290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015408	AAG	2	6	520301	520306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015408	TGC	2	6	520316	520321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_015408	TGT	2	6	520349	520354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015408	CCTTT	2	10	520368	520377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_015408	ATG	2	6	520411	520416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015408	T	6	6	520426	520431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015408	T	6	6	520433	520438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015408	CAG	2	6	520467	520472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_015408	TAG	2	6	520568	520573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015408	ATG	3	9	520596	520604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015408	AGA	2	6	520733	520738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015408	CAT	2	6	520900	520905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_015408	ATT	2	6	520946	520951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015408	TTTCT	2	10	520952	520961	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_015408	GGT	2	6	521006	521011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015408	TGCT	2	8	521098	521105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_015408	GTT	2	6	521152	521157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015408	ATG	2	6	521187	521192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015408	A	6	6	521200	521205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_015408	GGA	2	6	521363	521368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015408	CCG	2	6	521430	521435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1081	NC_015408	GCA	2	6	521489	521494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_015408	TGT	2	6	521495	521500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015408	GTT	2	6	521558	521563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015408	ATTG	2	8	521591	521598	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015408	CTC	2	6	521599	521604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_015408	TTG	2	6	521621	521626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_015408	TTG	2	6	521759	521764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015408	TTG	2	6	521783	521788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015408	CTC	2	6	521812	521817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_015408	GTT	2	6	521834	521839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015408	T	8	8	521859	521866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015408	AAG	2	6	521924	521929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015408	AGG	2	6	521947	521952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_015408	AG	3	6	522109	522114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015408	GTAG	2	8	522134	522141	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015408	AAG	2	6	522241	522246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_015408	AG	3	6	522251	522256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_015408	AG	3	6	522276	522281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015408	AGA	2	6	522334	522339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_015408	AT	3	6	522349	522354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015408	AGAA	2	8	522375	522382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015408	GGGA	2	8	522411	522418	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015408	A	6	6	522433	522438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015408	C	6	6	522751	522756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1108	NC_015408	TAT	2	6	523118	523123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015408	TG	3	6	523151	523156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015408	AAT	2	6	523168	523173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015408	T	7	7	523189	523195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015408	AAG	2	6	523202	523207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015408	ATA	2	6	524636	524641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015408	ATT	2	6	524665	524670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015408	TC	3	6	525569	525574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_015408	TAT	2	6	525579	525584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015408	CCT	2	6	526055	526060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_015408	TAAG	2	8	526108	526115	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015408	T	7	7	526129	526135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015408	T	7	7	528476	528482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015408	TGAGTT	2	12	532165	532176	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_015408	A	6	6	533188	533193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_015408	AG	4	8	533201	533208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015408	TCTG	2	8	533219	533226	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_015408	ATCT	2	8	533272	533279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_015408	CTCCTA	2	12	533404	533415	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_015408	CT	3	6	533542	533547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015408	T	6	6	533553	533558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015408	ATT	2	6	535614	535619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015408	T	6	6	535651	535656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015408	TTTA	2	8	535684	535691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015408	TTC	2	6	536001	536006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015408	GTT	2	6	536835	536840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_015408	TA	3	6	536841	536846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_015408	AGGA	2	8	539764	539771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_015408	CT	3	6	539814	539819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_015408	T	8	8	539827	539834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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