MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 2302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015408	ATTTTT	2	12	242063	242074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015408	AAT	2	6	247021	247026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015408	GAAA	2	8	247048	247055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015408	ACAA	2	8	247134	247141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_015408	A	6	6	249074	249079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015408	A	7	7	249907	249913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015408	AGG	2	6	254241	254246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015408	TA	3	6	255615	255620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015408	A	6	6	255626	255631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015408	CTT	2	6	255656	255661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015408	AGA	2	6	255664	255669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015408	GTT	2	6	255677	255682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015408	CCTTA	2	10	259780	259789	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
514	NC_015408	TCC	2	6	259792	259797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015408	AAG	2	6	259850	259855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015408	T	6	6	259869	259874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015408	T	8	8	259876	259883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015408	AATC	2	8	266413	266420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015408	TTCCTT	2	12	267215	267226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015408	GCT	2	6	269542	269547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015408	CCTC	2	8	269587	269594	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
522	NC_015408	A	6	6	269607	269612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015408	CTT	2	6	271431	271436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015408	AGG	2	6	271446	271451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015408	T	7	7	273904	273910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015408	T	6	6	273912	273917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015408	ATA	2	6	273938	273943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015408	A	6	6	273943	273948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015408	AAAT	2	8	273967	273974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015408	TAA	2	6	274982	274987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015408	AG	3	6	274994	274999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015408	ACC	2	6	275014	275019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_015408	ACT	2	6	275106	275111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_015408	A	6	6	276781	276786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015408	AAC	2	6	276798	276803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_015408	ATG	2	6	278082	278087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015408	AGG	2	6	278195	278200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015408	AGC	2	6	283055	283060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_015408	T	6	6	284188	284193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015408	TC	3	6	284210	284215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_015408	ATA	2	6	284239	284244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015408	TTTG	2	8	284245	284252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015408	CGT	2	6	284303	284308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015408	A	6	6	284320	284325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015408	AAT	2	6	287920	287925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015408	ACA	2	6	287945	287950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015408	A	6	6	287970	287975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015408	CA	3	6	288049	288054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_015408	A	6	6	288057	288062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015408	AT	3	6	288113	288118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015408	A	6	6	288158	288163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015408	TTTTA	2	10	288187	288196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015408	AC	3	6	288221	288226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_015408	ATTT	2	8	288227	288234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015408	AAG	2	6	288259	288264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015408	ATG	2	6	292141	292146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015408	CCTA	2	8	292185	292192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
558	NC_015408	TGC	2	6	292251	292256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015408	ATA	2	6	292287	292292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015408	CT	3	6	292298	292303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
561	NC_015408	TC	3	6	292331	292336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015408	A	6	6	292339	292344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015408	GCT	2	6	292362	292367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015408	A	6	6	292378	292383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015408	TCT	2	6	292388	292393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015408	AT	3	6	293501	293506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015408	T	6	6	295307	295312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015408	AGT	2	6	295317	295322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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570	NC_015408	A	6	6	296594	296599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015408	A	6	6	296616	296621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015408	CTT	2	6	296647	296652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015408	T	6	6	296656	296661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015408	T	6	6	296663	296668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015408	T	9	9	296678	296686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015408	TAT	2	6	296726	296731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_015408	T	6	6	297097	297102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_015408	TA	4	8	301446	301453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015408	A	6	6	301487	301492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015408	T	8	8	301496	301503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015408	AAT	2	6	301519	301524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_015408	AAATAA	2	12	304205	304216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_015408	CAG	2	6	304217	304222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_015408	TC	3	6	306040	306045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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591	NC_015408	AGA	3	9	306084	306092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015408	TA	3	6	306097	306102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015408	T	8	8	309031	309038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015408	TAT	2	6	309055	309060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015408	TG	3	6	309064	309069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015408	T	6	6	309081	309086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015408	CAA	2	6	311313	311318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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599	NC_015408	AATC	2	8	311391	311398	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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603	NC_015408	G	7	7	316421	316427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_015408	GTT	2	6	316495	316500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015408	TGC	2	6	316514	316519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015408	GGGAT	2	10	316550	316559	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015408	GGA	2	6	316582	316587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015408	A	8	8	316635	316642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_015408	A	9	9	321466	321474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015408	CTA	2	6	322466	322471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_015408	AAT	2	6	322482	322487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015408	A	7	7	322498	322504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015408	TCG	2	6	322534	322539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015408	AGA	2	6	322540	322545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015408	TTATGT	2	12	322556	322567	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_015408	AAT	2	6	322594	322599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015408	TTA	2	6	322648	322653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015408	T	6	6	323324	323329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015408	T	6	6	325968	325973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015408	ATAC	2	8	329356	329363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
624	NC_015408	GTAT	2	8	329372	329379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015408	A	6	6	329431	329436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015408	AG	3	6	329443	329448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015408	T	7	7	329454	329460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015408	A	6	6	332124	332129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015408	TCTT	2	8	332154	332161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
630	NC_015408	T	7	7	332197	332203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015408	GTT	2	6	332218	332223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015408	T	6	6	332230	332235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015408	TAAAAA	2	12	332261	332272	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015408	A	8	8	332268	332275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015408	TAA	2	6	332288	332293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015408	A	6	6	332292	332297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015408	TGT	2	6	332301	332306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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639	NC_015408	A	6	6	334875	334880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015408	TGG	2	6	334881	334886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015408	CTT	2	6	334898	334903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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