MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 chromosome

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015391	TCTTTT	2	12	1439	1450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015391	ATTCTG	2	12	10422	10433	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015391	GAATAA	2	12	16451	16462	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015391	AAAAGA	2	12	19302	19313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015391	AAAATG	2	12	31292	31303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015391	GCTAAG	2	12	75202	75213	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015391	TAAAAA	2	12	82971	82982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015391	TTTATT	2	12	87158	87169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015391	TAACTA	2	12	90601	90612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_015391	TTTTTA	2	12	105465	105476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015391	TTATAG	2	12	132067	132078	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015391	GAAAAA	2	12	133371	133382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015391	TTTAAA	2	12	149604	149615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015391	TAGAAA	2	12	149765	149776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015391	TTAAAT	2	12	152440	152451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015391	TAAATA	2	12	171529	171540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015391	GTTTAA	2	12	197180	197191	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015391	TGGAAG	2	12	212565	212576	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015391	TAAAAA	2	12	219187	219198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015391	TGGAAG	2	12	225002	225013	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015391	AAAGAA	2	12	230967	230978	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015391	CATTTT	2	12	232389	232400	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015391	TTTTTA	2	12	241757	241768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015391	AGTGTT	2	12	260722	260733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015391	TACTTA	2	12	279380	279391	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015391	TTAGGT	2	12	305064	305075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015391	AAGATA	2	12	306927	306938	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015391	GGATTG	2	12	315264	315275	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015391	GAAAAA	2	12	316269	316280	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015391	GCGATA	2	12	316306	316317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015391	TGGAAG	2	12	321389	321400	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015391	AATAGG	2	12	324361	324372	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015391	TGAAAA	2	12	365652	365663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015391	TTTTGA	2	12	415151	415162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015391	CAATAA	2	12	437932	437943	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_015391	TTTTTA	2	12	463683	463694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015391	AGAAAC	2	12	468681	468692	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015391	CTCTTT	2	12	503987	503998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015391	TTAAGA	2	12	520599	520610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015391	AGTTTA	2	12	524370	524381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015391	CTATTC	2	12	539463	539474	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015391	AATAAA	2	12	542110	542121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015391	TGGAAG	2	12	556431	556442	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015391	TAAGAA	2	12	594694	594705	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015391	TAAAAA	2	12	597456	597467	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015391	TTTCAT	2	12	602697	602708	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015391	TGGAAG	2	12	614107	614118	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015391	CTTCTA	2	12	632044	632055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015391	TAGATG	2	12	632127	632138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015391	AAATGG	2	12	681229	681240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015391	AATTAA	2	12	701829	701840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015391	AAATAT	2	12	738346	738357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015391	ATTAAA	2	12	774485	774496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015391	CCTTAG	2	12	784182	784193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015391	ACAGCT	2	12	790797	790808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015391	TCTTAT	2	12	849100	849111	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_015391	AAAATA	2	12	851457	851468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015391	TAAAAT	2	12	869977	869988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015391	TGAAAA	2	12	870699	870710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015391	AGTCTA	2	12	878376	878387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_015391	TTAGTC	2	12	904307	904318	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015391	TAAAAA	2	12	922518	922529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015391	TGAAAA	2	12	1030288	1030299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015391	CAGTAT	2	12	1063690	1063701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015391	CTTCAT	2	12	1064552	1064563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015391	TTCAAT	2	12	1064575	1064586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015391	TATTTT	2	12	1065019	1065030	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015391	ATTTTA	2	12	1136135	1136146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015391	CTGATC	2	12	1201439	1201450	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015391	ATAGCG	2	12	1244619	1244630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015391	AGTTGC	2	12	1244893	1244904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015391	TTCTAT	2	12	1266681	1266692	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015391	GAACAG	2	12	1271560	1271571	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015391	TTTTAT	2	12	1314052	1314063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015391	TATCCT	2	12	1342705	1342716	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015391	ACTTCC	2	12	1400214	1400225	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015391	ACTTCC	2	12	1413166	1413177	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_015391	AGGTTT	2	12	1475618	1475629	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015391	AAATTT	2	12	1534777	1534788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015391	TTTTCA	2	12	1536702	1536713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015391	TTTAAA	2	12	1541304	1541315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015391	AATATA	2	12	1550563	1550574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015391	ATAGAT	2	12	1559280	1559291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015391	TTTCAA	2	12	1583513	1583524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015391	ATTTTT	2	12	1604652	1604663	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015391	TTAATT	2	12	1608135	1608146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015391	TTTAAT	2	12	1614853	1614864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015391	TTTATT	2	12	1623340	1623351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015391	AATCCT	2	12	1730572	1730583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015391	ACTTTT	2	12	1771572	1771583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015391	TACTTC	2	12	1782003	1782014	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015391	TTGAAA	2	12	1792676	1792687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015391	CCTTTA	2	12	1809070	1809081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015391	GTTAAA	2	12	1894458	1894469	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015391	ATTTTC	2	12	1943399	1943410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_015391	ATTTTC	2	12	1972300	1972311	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_015391	TTTACC	2	12	1980931	1980942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015391	TAAATC	2	12	2029411	2029422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015391	CTTATT	2	12	2030257	2030268	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_015391	TAAAAA	2	12	2039297	2039308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015391	ATAAAA	2	12	2063812	2063823	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015391	TTCATT	2	12	2190414	2190425	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_015391	TTAAAA	2	12	2197673	2197684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015391	AAAGTA	2	12	2214119	2214130	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015391	TAATAC	2	12	2245796	2245807	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_015391	TTGTTA	2	12	2247977	2247988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015391	AATAAC	2	12	2251034	2251045	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_015391	ATTCTT	2	12	2254284	2254295	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_015391	ACAAAG	2	12	2258324	2258335	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015391	ACTTTT	2	12	2339982	2339993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_015391	TTTTAT	2	12	2362465	2362476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015391	AAAAGT	2	12	2368175	2368186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015391	AAGAAT	2	12	2381564	2381575	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015391	AAAGAA	2	12	2398678	2398689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015391	TAAAAA	2	12	2416886	2416897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015391	ATCAAA	2	12	2430656	2430667	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_015391	CGCTTT	2	12	2465509	2465520	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015391	TATTTT	2	12	2483429	2483440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015391	ATCATA	2	12	2515854	2515865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_015391	TAAAAG	2	12	2531252	2531263	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015391	TGTTTT	2	12	2576207	2576218	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015391	ACTTCC	2	12	2593647	2593658	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_015391	GTTAAT	2	12	2617559	2617570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.