MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 chromosome

Total Repeats: 488

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015391	TTATT	2	10	3000	3009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015391	TAAAA	2	10	14702	14711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015391	CTTTT	2	10	19583	19592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_015391	TGAAA	2	10	19784	19793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015391	CTTAA	2	10	23117	23126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_015391	ATAAA	2	10	23377	23386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015391	TTGTC	2	10	28938	28947	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015391	TAATA	2	10	29950	29959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015391	GATTG	3	15	37568	37582	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015391	AATAT	2	10	38943	38952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015391	GAATG	2	10	39034	39043	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015391	TAAAT	2	10	39930	39939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015391	TTATA	2	10	44372	44381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015391	AAAGG	2	10	45917	45926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015391	TAACA	2	10	48513	48522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015391	GTTTA	2	10	49094	49103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015391	TAAAA	2	10	53154	53163	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015391	GTATC	2	10	61248	61257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015391	CTTTG	2	10	61308	61317	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_015391	TGAAA	2	10	66791	66800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015391	TTTTA	2	10	72453	72462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015391	ATTTT	3	15	75311	75325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015391	CTACT	2	10	75326	75335	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015391	CTTTT	2	10	77525	77534	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015391	ATTAT	2	10	78070	78079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015391	TAAAT	2	10	82938	82947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015391	TAGTT	2	10	83323	83332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015391	AAAAG	2	10	83381	83390	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015391	TATAT	2	10	83515	83524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015391	AAATC	2	10	85042	85051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015391	AGTTT	2	10	85325	85334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015391	CCTTT	2	10	85486	85495	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015391	CTAAT	2	10	85728	85737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015391	TTCTT	2	10	87692	87701	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_015391	TTGCA	2	10	87762	87771	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015391	ATTAA	2	10	89264	89273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015391	AAATG	2	10	99975	99984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015391	AAAAG	2	10	102762	102771	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015391	ATTTT	2	10	103275	103284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015391	AATCT	2	10	103988	103997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015391	AAAGG	2	10	112793	112802	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015391	GAGAG	2	10	115728	115737	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015391	GATTG	2	10	127954	127963	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015391	AAATA	2	10	131592	131601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015391	TTAAA	2	10	137287	137296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015391	TTTAC	2	10	139613	139622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015391	ATTTA	2	10	142160	142169	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015391	TATTT	2	10	146357	146366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015391	AACAA	2	10	146382	146391	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015391	TGTTT	2	10	147011	147020	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015391	TATAG	2	10	148960	148969	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015391	TATTT	2	10	151569	151578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015391	ATTTA	2	10	152501	152510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015391	ATTTT	2	10	154966	154975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015391	TACAA	2	10	155162	155171	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015391	ACATT	2	10	167317	167326	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_015391	TCTTT	2	10	177899	177908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015391	TAAAT	2	10	177982	177991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015391	ATCCA	2	10	182780	182789	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015391	ATATG	2	10	184349	184358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015391	CAAAA	2	10	189018	189027	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015391	TAAAT	2	10	197192	197201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015391	TTAAT	2	10	207399	207408	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015391	TCGTG	2	10	208998	209007	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015391	GTTAA	2	10	209708	209717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015391	ATTAT	2	10	219098	219107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015391	AAGTT	2	10	219615	219624	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015391	AACAA	2	10	219988	219997	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015391	TCGTG	2	10	221221	221230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015391	GTTAA	2	10	222145	222154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015391	TTAAT	2	10	226294	226303	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015391	AAAAG	2	10	226357	226366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015391	CATTA	2	10	230898	230907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015391	CTACA	2	10	237037	237046	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015391	ATTAA	2	10	243008	243017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015391	TAAAA	2	10	243088	243097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015391	TAAAG	2	10	243153	243162	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015391	GCAAT	2	10	247408	247417	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015391	GTTTA	2	10	265257	265266	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015391	AATTA	2	10	268586	268595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015391	GGGAT	2	10	277241	277250	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015391	TAAAA	2	10	280436	280445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015391	TGAAA	2	10	302358	302367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015391	GAAAA	2	10	310509	310518	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015391	TCGTG	2	10	317719	317728	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_015391	GTTAA	2	10	318532	318541	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015391	CAAAA	2	10	331498	331507	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015391	AGTAA	2	10	336881	336890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015391	GGGTA	2	10	345159	345168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015391	AGAGG	2	10	352130	352139	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015391	GAAAA	2	10	357204	357213	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015391	CAGTC	2	10	358702	358711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_015391	TTTAT	2	10	361062	361071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015391	ATTAT	2	10	362803	362812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015391	ACTTA	2	10	365879	365888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015391	TATCA	2	10	368486	368495	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_015391	GTAAA	2	10	369923	369932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015391	AAACT	2	10	371636	371645	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015391	TAAAT	2	10	376863	376872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015391	ATTTG	2	10	381480	381489	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015391	AATGA	2	10	386984	386993	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015391	CTTTT	2	10	409740	409749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015391	GCAAC	2	10	414853	414862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_015391	ATTTT	2	10	415082	415091	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015391	AATTA	2	10	418684	418693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015391	TTAAC	2	10	418956	418965	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015391	GTAAA	2	10	426824	426833	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015391	GAAAA	2	10	437389	437398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015391	CTATG	2	10	439756	439765	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015391	ATTTG	2	10	459213	459222	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015391	AAATT	2	10	461656	461665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015391	TAATA	2	10	461703	461712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015391	ATTGT	2	10	461903	461912	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015391	AATAA	2	10	463928	463937	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015391	TTAGT	2	10	473505	473514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015391	TAAAA	2	10	474887	474896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015391	CAGGG	2	10	474955	474964	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015391	CAGGG	2	10	475222	475231	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015391	AATAA	2	10	481299	481308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015391	TAAAC	2	10	481444	481453	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_015391	GTATA	2	10	483733	483742	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015391	TTTAC	2	10	488906	488915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015391	CTCAC	2	10	501103	501112	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_015391	TTCAT	2	10	501468	501477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015391	TAATA	2	10	503368	503377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015391	CTTTA	2	10	522872	522881	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_015391	ACAAA	2	10	524205	524214	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015391	AAATA	2	10	524503	524512	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015391	AAATG	2	10	527418	527427	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015391	AAGAT	2	10	532825	532834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015391	AATTA	2	10	539310	539319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015391	TAAAA	2	10	548142	548151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015391	AAACA	2	10	548597	548606	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_015391	TCGTG	2	10	552864	552873	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015391	GTTAA	2	10	553574	553583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015391	TTTAA	2	10	558133	558142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015391	ATTTA	2	10	561617	561626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015391	TTAAG	2	10	562564	562573	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015391	AAAGA	2	10	572955	572964	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015391	TGATA	2	10	574037	574046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015391	GAAAA	2	10	579613	579622	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015391	TAAAA	2	10	580514	580523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015391	TAAAT	2	10	583447	583456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015391	ATCTT	2	10	599204	599213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_015391	CTAGA	2	10	599287	599296	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015391	GATTC	2	10	608963	608972	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015391	TCGTG	2	10	610540	610549	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_015391	GTTAA	2	10	611250	611259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015391	TTAAT	2	10	616098	616107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.