MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. 17-4 plasmid pCAR50

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015390	TTAA	2	8	3292	3299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015390	GTTG	2	8	3336	3343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015390	TAAA	2	8	8531	8538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015390	CATT	2	8	8607	8614	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015390	CTTT	2	8	8636	8643	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015390	TAAA	2	8	8953	8960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015390	AGGA	2	8	10505	10512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015390	AAAC	2	8	13399	13406	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_015390	ATAA	2	8	13498	13505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015390	TCTT	2	8	14700	14707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015390	TAAA	2	8	14931	14938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015390	TAAA	2	8	15117	15124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015390	TAAC	2	8	15141	15148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015390	ATTT	2	8	15230	15237	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015390	TAAA	2	8	15280	15287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015390	TAAC	2	8	19679	19686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015390	TAAT	2	8	19780	19787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015390	TAGT	2	8	20024	20031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015390	TTTA	2	8	20077	20084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015390	ATTT	2	8	20981	20988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015390	AACA	2	8	21203	21210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015390	TTTG	2	8	21659	21666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015390	TACA	2	8	21934	21941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_015390	GTCT	2	8	22140	22147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015390	AATT	2	8	23509	23516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015390	GTTC	2	8	23588	23595	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015390	ACAG	2	8	23999	24006	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015390	TTAT	2	8	24007	24014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015390	ACAG	2	8	24031	24038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015390	TAAA	2	8	24104	24111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015390	TAAA	2	8	24188	24195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015390	CAAC	2	8	24206	24213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015390	TAGA	2	8	24296	24303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015390	TGCA	2	8	25227	25234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015390	GAAA	2	8	25277	25284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015390	AATT	2	8	25328	25335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015390	TTAT	2	8	25529	25536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015390	TATT	2	8	25676	25683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015390	TAAT	2	8	25853	25860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015390	ATTA	2	8	27912	27919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015390	AATA	2	8	28471	28478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015390	TTAC	2	8	29114	29121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015390	TTTA	2	8	29281	29288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015390	TAAA	2	8	30267	30274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015390	ATTA	2	8	30384	30391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015390	ATTT	2	8	30419	30426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015390	CATA	2	8	33770	33777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015390	ATCT	2	8	34026	34033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015390	TTAA	2	8	36721	36728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015390	AAAC	2	8	36830	36837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015390	TAAA	2	8	37932	37939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015390	AGCA	2	8	38791	38798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015390	TAAA	2	8	39141	39148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015390	ATTT	2	8	42103	42110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015390	ATTT	2	8	43357	43364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015390	AAGT	2	8	43383	43390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015390	TTAA	2	8	43519	43526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015390	TAGA	2	8	44047	44054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015390	AGTT	2	8	45314	45321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015390	TTAA	2	8	46575	46582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015390	CTTG	2	8	46704	46711	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015390	ACTA	2	8	48972	48979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015390	ATTC	2	8	49120	49127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015390	TTTA	2	8	49157	49164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015390	TAAA	2	8	49175	49182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015390	AAAC	2	8	49813	49820	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.