MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	TTATT	2	10	9764	9773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015275	TCGTG	2	10	11502	11511	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_015275	TATTT	2	10	12007	12016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015275	GGGAG	2	10	13032	13041	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015275	CCGTA	2	10	14142	14151	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_015275	AAGAT	2	10	15291	15300	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015275	TAGAA	2	10	23474	23483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015275	ATAAA	2	10	23533	23542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015275	GAGAA	2	10	41531	41540	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015275	TTAGA	2	10	42298	42307	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015275	TGAAT	2	10	42443	42452	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015275	TCGTG	2	10	47287	47296	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_015275	TGTTT	2	10	47793	47802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015275	TATTT	2	10	47868	47877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015275	AGTTT	2	10	48195	48204	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015275	AAATG	2	10	50347	50356	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015275	TTGTT	2	10	52325	52334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015275	ACAAT	2	10	52339	52348	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_015275	GATTT	2	10	53779	53788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015275	GATAC	2	10	55851	55860	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015275	TAAAA	2	10	56358	56367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015275	TACAA	2	10	56514	56523	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_015275	ATATC	2	10	68605	68614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_015275	GGGAG	2	10	69574	69583	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015275	CCGTA	2	10	70685	70694	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_015275	AAGAT	2	10	71841	71850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015275	TCGTG	2	10	77891	77900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015275	TTTTG	2	10	78399	78408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015275	GGGAG	2	10	79446	79455	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015275	CCGTA	2	10	80556	80565	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015275	AAGAT	2	10	81706	81715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015275	GAAAA	2	10	83640	83649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015275	TCGTG	2	10	85448	85457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015275	TTTTG	2	10	85957	85966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015275	GGGAG	2	10	87002	87011	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015275	CCGTA	2	10	88112	88121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_015275	AAGAT	2	10	89263	89272	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015275	GTTTG	2	10	94256	94265	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015275	ATAGG	2	10	96593	96602	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015275	CAGCT	2	10	102194	102203	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_015275	GATAA	2	10	106648	106657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015275	TGAAA	2	10	111279	111288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015275	TTAAA	2	10	111596	111605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015275	TAGTT	2	10	115002	115011	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015275	TATAA	2	10	118463	118472	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015275	TTTAT	2	10	121781	121790	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015275	ATAAA	2	10	121842	121851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015275	AGTGA	2	10	121914	121923	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015275	AAACA	2	10	132471	132480	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015275	AAAAC	2	10	132496	132505	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015275	TAAAG	2	10	136084	136093	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015275	GAGTA	2	10	136465	136474	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015275	CATAT	2	10	140863	140872	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015275	AAGAG	2	10	140886	140895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015275	TCGTG	2	10	142553	142562	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_015275	TGTTT	2	10	143060	143069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015275	GAAGC	2	10	143110	143119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015275	GGGAG	2	10	144155	144164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015275	CCGTA	2	10	145264	145273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_015275	AAGAT	2	10	146415	146424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015275	TAAAA	2	10	150843	150852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015275	TCGTG	2	10	152680	152689	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015275	TGTTT	2	10	153186	153195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015275	ACAAA	2	10	153493	153502	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015275	GGGAG	2	10	154289	154298	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015275	CCGTA	2	10	155398	155407	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015275	AAGAT	2	10	156548	156557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015275	TATAT	2	10	157580	157589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015275	AAAGT	2	10	157618	157627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015275	TTTAG	2	10	161466	161475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015275	TAATC	2	10	165106	165115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_015275	ATTAT	2	10	165428	165437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015275	ATAAG	2	10	165556	165565	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015275	TTAAT	2	10	165580	165589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015275	TTGTT	2	10	171002	171011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015275	ATTCA	2	10	171492	171501	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015275	TTGGT	2	10	171848	171857	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015275	ATTAT	2	10	173666	173675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015275	TCGCT	2	10	181158	181167	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015275	TATAT	2	10	182157	182166	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015275	AAGTA	2	10	182245	182254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015275	CTTAA	2	10	184665	184674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015275	ATTTG	2	10	188215	188224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015275	AAAGA	2	10	188290	188299	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015275	AAGTA	2	10	190458	190467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015275	ATTCT	2	10	193358	193367	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015275	AATAA	2	10	204662	204671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015275	AATTT	2	10	217926	217935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015275	ATATT	2	10	219800	219809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015275	AAGCT	2	10	230325	230334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015275	CGTTG	2	10	231628	231637	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015275	AAATA	2	10	236392	236401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015275	CTTTG	2	10	240262	240271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_015275	TATCA	2	10	249265	249274	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_015275	TAATG	2	10	264551	264560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015275	TTTGT	2	10	264813	264822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015275	GAGAA	2	10	270013	270022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015275	TGAGG	2	10	279612	279621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015275	TATAA	2	10	290130	290139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015275	CCTTT	2	10	296064	296073	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015275	CGGAC	2	10	296226	296235	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_015275	TTCAT	2	10	316012	316021	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_015275	AAAGG	2	10	317262	317271	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015275	GTATA	2	10	331460	331469	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015275	AAATA	2	10	339298	339307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015275	TAAAA	2	10	347414	347423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015275	ATATA	2	10	347460	347469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015275	ATATT	2	10	360409	360418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015275	TTATT	2	10	364248	364257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015275	ATATT	2	10	370295	370304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015275	TTAAA	2	10	370419	370428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015275	ATTAA	2	10	373074	373083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015275	TATTT	2	10	373438	373447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015275	TAATA	3	15	378879	378893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015275	TAGTA	2	10	379320	379329	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015275	TAAAG	2	10	395864	395873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015275	TTTAA	2	10	398044	398053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015275	AATAA	2	10	398842	398851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015275	TTATT	2	10	398880	398889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015275	AATTT	2	10	409984	409993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015275	TCGTG	2	10	423605	423614	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015275	TGTTT	2	10	424112	424121	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015275	ACCGA	2	10	424155	424164	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015275	ATCAA	2	10	425225	425234	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015275	TATAA	2	10	427164	427173	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015275	AAGGA	2	10	428371	428380	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015275	GGAAA	2	10	431100	431109	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015275	GAATG	2	10	447056	447065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015275	TAGGC	2	10	447125	447134	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015275	GAGGT	2	10	451672	451681	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015275	AATTT	2	10	454948	454957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015275	TGAGG	2	10	457642	457651	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015275	TTTGA	2	10	459663	459672	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015275	ATAAA	2	10	459899	459908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015275	TGTTA	2	10	470425	470434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015275	TTATA	2	10	471175	471184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015275	TTTAT	2	10	471242	471251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015275	TAAAT	2	10	471317	471326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015275	ACCAT	2	10	480467	480476	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_015275	ATTTT	2	10	482779	482788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015275	CAAAA	2	10	485364	485373	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_015275	GTTTT	2	10	485657	485666	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015275	ACAAA	2	10	487384	487393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015275	TCGCT	2	10	501552	501561	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015275	TAATC	2	10	504207	504216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_015275	TATAA	2	10	506423	506432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015275	GTTTT	2	10	516147	516156	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015275	GGGAG	2	10	538507	538516	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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