MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 10193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	AGG	2	6	15	20	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015275	CAT	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015275	CTA	3	9	1551	1559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015275	TAA	2	6	1578	1583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015275	TTA	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015275	GAT	2	6	4206	4211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015275	AAT	2	6	6161	6166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015275	ATA	2	6	9748	9753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015275	ACT	2	6	9810	9815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015275	GAT	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015275	ATA	2	6	9831	9836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015275	TTA	2	6	9846	9851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015275	CAA	2	6	9862	9867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015275	TAA	2	6	9957	9962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015275	CAA	2	6	10012	10017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015275	ATA	2	6	10105	10110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015275	AAT	2	6	10136	10141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015275	CCT	2	6	10235	10240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015275	GAA	2	6	10258	10263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015275	AAT	2	6	10293	10298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015275	TAA	2	6	10376	10381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015275	AGT	2	6	10422	10427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015275	TAC	2	6	10433	10438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015275	GGC	2	6	10488	10493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015275	GAG	2	6	10525	10530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015275	CTC	2	6	10535	10540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_015275	ATT	2	6	10648	10653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015275	CCA	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015275	CGA	2	6	10727	10732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015275	GCA	2	6	10801	10806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015275	CGC	2	6	10848	10853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015275	CAG	2	6	10890	10895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015275	GAA	2	6	10897	10902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015275	AAG	2	6	10922	10927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015275	CAG	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015275	GCT	2	6	11057	11062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015275	TGA	2	6	11071	11076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015275	GGA	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015275	GGC	2	6	11157	11162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015275	GAA	2	6	11399	11404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015275	GGT	2	6	11479	11484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015275	GTC	2	6	11493	11498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015275	TAG	2	6	11554	11559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015275	GGA	2	6	11605	11610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015275	ATC	2	6	11629	11634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015275	GCT	2	6	11673	11678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015275	CCT	2	6	11967	11972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_015275	TGA	2	6	12059	12064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015275	AAT	2	6	12498	12503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015275	CTA	2	6	12519	12524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015275	AGG	2	6	12724	12729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015275	GCG	2	6	12756	12761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015275	TCA	2	6	12858	12863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015275	ACC	2	6	12957	12962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015275	CTC	2	6	12978	12983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_015275	ATG	2	6	13089	13094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015275	AGG	2	6	13158	13163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015275	TAG	2	6	13216	13221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015275	CAG	2	6	13487	13492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015275	AGC	2	6	13620	13625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015275	ACG	2	6	13751	13756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015275	TAC	2	6	13948	13953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015275	TAT	2	6	13955	13960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015275	AGG	2	6	13978	13983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015275	GCT	2	6	14120	14125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015275	GAG	2	6	14169	14174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015275	GTT	2	6	14201	14206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015275	CGG	2	6	14417	14422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015275	GTA	2	6	14533	14538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015275	AGG	2	6	14634	14639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015275	CCT	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015275	GGT	2	6	14911	14916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015275	CGT	2	6	15107	15112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015275	CGT	2	6	15133	15138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015275	TGT	2	6	15209	15214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015275	GTA	2	6	15364	15369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015275	ATA	2	6	15415	15420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015275	CGC	2	6	15495	15500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_015275	CGG	2	6	15508	15513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015275	TAA	2	6	15581	15586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015275	TTA	2	6	15587	15592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015275	TTA	2	6	15594	15599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015275	AGC	2	6	15707	15712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015275	CAG	2	6	15724	15729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015275	TCG	2	6	15749	15754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015275	AGC	2	6	15895	15900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015275	TCG	2	6	15909	15914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015275	ATA	2	6	16204	16209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015275	AAT	2	6	16232	16237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015275	TAG	2	6	16718	16723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015275	ATT	2	6	17147	17152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015275	AAG	2	6	17222	17227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015275	TAA	2	6	17228	17233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015275	TAA	2	6	17235	17240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015275	TAA	2	6	18673	18678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015275	TAG	2	6	18778	18783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015275	TAA	2	6	19413	19418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015275	ATA	2	6	19694	19699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015275	TAT	2	6	19729	19734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015275	AGA	2	6	19774	19779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015275	ATT	2	6	19859	19864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015275	AGG	2	6	20459	20464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015275	AGA	2	6	23160	23165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015275	TAA	2	6	23301	23306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015275	TAA	2	6	23351	23356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015275	TTA	2	6	23415	23420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015275	GTA	2	6	23508	23513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015275	TAG	2	6	23517	23522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015275	TGC	2	6	23595	23600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015275	ATA	2	6	23615	23620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015275	TAT	2	6	27464	27469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015275	ATA	2	6	27473	27478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015275	TTA	2	6	27939	27944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015275	TAA	2	6	27968	27973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015275	ATT	2	6	28007	28012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015275	TAG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015275	TTA	2	6	28590	28595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015275	CCT	2	6	28931	28936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015275	TAT	2	6	28940	28945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015275	TAA	2	6	28950	28955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015275	ATT	2	6	28963	28968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015275	GAT	2	6	28973	28978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015275	TAT	2	6	28980	28985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015275	TAT	3	9	29004	29012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015275	ATA	2	6	29085	29090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015275	TAG	2	6	29130	29135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015275	ATG	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015275	ATA	3	9	29964	29972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015275	TAA	2	6	30002	30007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015275	AGA	2	6	30076	30081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015275	ACT	2	6	30775	30780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015275	AAT	2	6	30892	30897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015275	AGG	2	6	30933	30938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015275	AGG	2	6	32510	32515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015275	TAA	2	6	33855	33860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015275	GAG	2	6	33937	33942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015275	TAA	2	6	35116	35121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015275	AGA	2	6	35132	35137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015275	ATG	3	9	35202	35210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015275	AAG	2	6	35222	35227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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