MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 19274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015275	GAT	2	6	674169	674174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015275	AAG	2	6	674202	674207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015275	TAAA	2	8	674220	674227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015275	TAT	2	6	674228	674233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015275	AGG	2	6	674305	674310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015275	AGG	2	6	675967	675972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_015275	TA	4	8	676777	676784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015275	AAT	2	6	676801	676806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015275	GGA	2	6	676827	676832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015275	GAGAG	2	10	678065	678074	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015275	TGA	2	6	678130	678135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015275	A	7	7	678205	678211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015275	CTCTC	2	10	678240	678249	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4014	NC_015275	ATT	2	6	678263	678268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015275	AAG	2	6	678303	678308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015275	T	6	6	678330	678335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015275	TAG	2	6	678354	678359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015275	TTG	2	6	678372	678377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015275	GA	3	6	678386	678391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015275	A	6	6	678506	678511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015275	GCGGA	2	10	678536	678545	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4022	NC_015275	CT	3	6	678565	678570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_015275	GGA	3	9	678623	678631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015275	AGG	2	6	680011	680016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015275	GTT	2	6	681509	681514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015275	AGA	2	6	681535	681540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015275	GAG	2	6	681551	681556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015275	TA	3	6	682796	682801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015275	AAG	2	6	682802	682807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015275	GATT	2	8	682876	682883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015275	T	6	6	682897	682902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015275	TAT	2	6	682908	682913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015275	CTTC	2	8	682958	682965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_015275	A	6	6	682992	682997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015275	AG	3	6	682999	683004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015275	CT	3	6	683015	683020	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_015275	ATG	2	6	683021	683026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015275	TC	3	6	685042	685047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_015275	ATC	2	6	685072	685077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_015275	ATT	2	6	685094	685099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015275	TGT	2	6	685298	685303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015275	T	7	7	685370	685376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015275	TA	3	6	685382	685387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015275	TAA	2	6	685457	685462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015275	AATC	2	8	685524	685531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_015275	TCC	2	6	685546	685551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4052	NC_015275	TA	3	6	685799	685804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015275	TAA	2	6	686158	686163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015275	TTA	2	6	686208	686213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015275	ATA	2	6	686295	686300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_015275	TAA	2	6	686311	686316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015275	GAA	2	6	686379	686384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_015275	AGT	2	6	686387	686392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_015275	AAG	2	6	686396	686401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015275	TGA	2	6	686425	686430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015275	GGT	2	6	686599	686604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015275	GA	3	6	686610	686615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015275	T	7	7	686655	686661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015275	ATT	2	6	686703	686708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015275	AGC	2	6	686713	686718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4067	NC_015275	AGT	2	6	686828	686833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_015275	GAAA	2	8	686937	686944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015275	AATC	2	8	686984	686991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4083	NC_015275	A	6	6	688174	688179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_015275	A	7	7	688193	688199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_015275	ATA	2	6	692335	692340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4105	NC_015275	ATA	2	6	692912	692917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015275	GTA	2	6	692946	692951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4112	NC_015275	ATA	2	6	693168	693173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4114	NC_015275	CAAAT	2	10	693211	693220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4115	NC_015275	AG	3	6	693292	693297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015275	TAA	2	6	695935	695940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4119	NC_015275	A	6	6	696014	696019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015275	TAA	2	6	696042	696047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4123	NC_015275	AGG	2	6	700245	700250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_015275	A	6	6	703798	703803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015275	TGA	2	6	703819	703824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015275	T	6	6	703833	703838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015275	GCC	2	6	703879	703884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_015275	TAAA	3	12	703886	703897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015275	ATA	2	6	703898	703903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015275	TA	4	8	703923	703930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015275	ATA	2	6	703963	703968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_015275	A	6	6	703968	703973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_015275	TTA	2	6	704004	704009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_015275	AT	3	6	704012	704017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_015275	ACAA	2	8	704052	704059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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