MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 19274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015275	GGA	2	6	142656	142661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_015275	ATC	2	6	142680	142685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_015275	AC	3	6	142707	142712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_015275	GCT	2	6	142724	142729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_015275	A	6	6	142767	142772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015275	AC	3	6	142876	142881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_015275	G	7	7	142904	142910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_015275	GGGA	2	8	142937	142944	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015275	CCT	2	6	143019	143024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_015275	TGTTT	2	10	143060	143069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015275	GAAGC	2	10	143110	143119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_015275	TAC	2	6	143145	143150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_015275	TGA	2	6	143178	143183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015275	GACT	2	8	143260	143267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_015275	GGT	2	6	143312	143317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015275	GGT	2	6	143347	143352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_015275	CTA	2	6	143369	143374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_015275	TAAA	2	8	143392	143399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015275	TAC	2	6	143441	143446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_015275	ATA	2	6	143556	143561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015275	CTA	2	6	143641	143646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_015275	AGG	2	6	143846	143851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015275	AGAA	2	8	143852	143859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015275	GCG	2	6	143878	143883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_015275	CGT	2	6	143938	143943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_015275	TCA	2	6	143980	143985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_015275	G	6	6	144074	144079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_015275	ACC	2	6	144080	144085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_015275	C	6	6	144084	144089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1030	NC_015275	CTC	2	6	144101	144106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_015275	GGGAG	2	10	144155	144164	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015275	ATG	2	6	144212	144217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015275	AGG	2	6	144281	144286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015275	TAG	2	6	144339	144344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015275	CAG	2	6	144610	144615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_015275	GT	4	8	144684	144691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_015275	AGC	2	6	144743	144748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_015275	GA	3	6	144784	144789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_015275	AC	3	6	144818	144823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_015275	AAC	2	6	144872	144877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015275	TAC	2	6	145070	145075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015275	TAT	2	6	145077	145082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015275	AGG	2	6	145100	145105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_015275	GCT	2	6	145242	145247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_015275	CCGTA	2	10	145264	145273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1046	NC_015275	GAG	2	6	145291	145296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015275	GTT	2	6	145323	145328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_015275	TAGG	2	8	145380	145387	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015275	CGG	2	6	145541	145546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_015275	GTA	2	6	145657	145662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_015275	AGG	2	6	145758	145763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_015275	CT	3	6	145814	145819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_015275	CCT	2	6	145899	145904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_015275	GGT	2	6	146035	146040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_015275	CGT	2	6	146231	146236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_015275	CGT	2	6	146257	146262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_015275	GGAC	2	8	146313	146320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_015275	TGT	2	6	146333	146338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_015275	AAGAT	2	10	146415	146424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015275	GTA	2	6	146488	146493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015275	GTA	2	6	146559	146564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_015275	T	7	7	146605	146611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_015275	ATT	2	6	146686	146691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015275	TAG	2	6	146702	146707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015275	GAA	2	6	146745	146750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015275	A	6	6	146819	146824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_015275	TA	3	6	146834	146839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_015275	GA	3	6	146868	146873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_015275	GTA	2	6	146876	146881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_015275	A	6	6	147159	147164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015275	AGA	2	6	147179	147184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015275	AATA	2	8	147188	147195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015275	AGA	2	6	147212	147217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015275	TTG	2	6	147241	147246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015275	TA	3	6	147365	147370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015275	ATA	2	6	147376	147381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_015275	AACT	2	8	147410	147417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_015275	CTTT	2	8	147445	147452	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_015275	CCT	2	6	148328	148333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_015275	AT	3	6	148373	148378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_015275	GTT	2	6	148394	148399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015275	A	6	6	148410	148415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015275	AT	3	6	148442	148447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_015275	ATA	2	6	148451	148456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_015275	AATA	2	8	148458	148465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_015275	GAA	2	6	148485	148490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_015275	TA	3	6	148518	148523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_015275	AT	3	6	148536	148541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_015275	TATT	2	8	150678	150685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_015275	TTA	2	6	150690	150695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_015275	ATT	2	6	150700	150705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_015275	TTAA	2	8	150742	150749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_015275	AGA	2	6	150754	150759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_015275	TGA	2	6	150799	150804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015275	TAAAA	2	10	150843	150852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_015275	A	6	6	150849	150854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_015275	TA	3	6	150866	150871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_015275	A	6	6	150875	150880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_015275	AGT	2	6	150900	150905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_015275	TGG	2	6	150970	150975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_015275	GACT	2	8	151055	151062	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_015275	CGG	2	6	151127	151132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_015275	ATT	2	6	151161	151166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_015275	T	6	6	151198	151203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_015275	ATT	2	6	151261	151266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_015275	TGAT	2	8	151298	151305	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015275	CTT	2	6	151368	151373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_015275	AT	3	6	151374	151379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015275	TA	3	6	151384	151389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015275	A	6	6	151409	151414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015275	TAAG	2	8	151435	151442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015275	TAT	2	6	151452	151457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_015275	AGT	2	6	151592	151597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_015275	TAC	2	6	151603	151608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_015275	GGC	2	6	151658	151663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_015275	CGAA	2	8	151683	151690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_015275	AACG	2	8	151778	151785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_015275	CCA	2	6	151889	151894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_015275	CGA	2	6	151898	151903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_015275	GCA	2	6	151972	151977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015275	CGC	2	6	152019	152024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_015275	GAAG	2	8	152027	152034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015275	CAG	2	6	152061	152066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_015275	GAA	2	6	152068	152073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_015275	A	6	6	152072	152077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_015275	AAG	2	6	152093	152098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015275	CAG	2	6	152117	152122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_015275	GAGC	2	8	152140	152147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_015275	GCT	2	6	152228	152233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_015275	TGA	2	6	152242	152247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015275	GGA	2	6	152308	152313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_015275	GGC	2	6	152328	152333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_015275	GAA	2	6	152577	152582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1136	NC_015275	GTC	2	6	152671	152676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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