MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 19274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015275	A	6	6	76627	76632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015275	TAA	2	6	76765	76770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015275	AGT	2	6	76811	76816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015275	TAC	2	6	76822	76827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015275	T	6	6	76838	76843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015275	GGC	2	6	76877	76882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_015275	CGAA	2	8	76902	76909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_015275	GAG	2	6	76914	76919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015275	CTC	2	6	76924	76929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_015275	AACG	2	8	76997	77004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_015275	TAT	2	6	77039	77044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015275	CCA	2	6	77107	77112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_015275	CGA	2	6	77116	77121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015275	GCA	2	6	77190	77195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015275	CGC	2	6	77237	77242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015275	GAAG	2	8	77245	77252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015275	CAG	2	6	77279	77284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015275	GAA	2	6	77286	77291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_015275	A	7	7	77290	77296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015275	AAG	2	6	77312	77317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015275	CAG	2	6	77336	77341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_015275	GAGC	2	8	77359	77366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_015275	GCT	2	6	77447	77452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015275	TGA	2	6	77461	77466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015275	GGA	2	6	77527	77532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015275	GGC	2	6	77546	77551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_015275	GAA	2	6	77788	77793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015275	GGT	2	6	77868	77873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015275	GTC	2	6	77882	77887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015275	TCGTG	2	10	77891	77900	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
531	NC_015275	TAG	2	6	77943	77948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015275	AG	3	6	77971	77976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015275	GGA	2	6	77994	77999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015275	ATC	2	6	78018	78023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015275	AC	3	6	78045	78050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_015275	GCT	2	6	78062	78067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015275	A	6	6	78105	78110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015275	AC	3	6	78214	78219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015275	G	7	7	78242	78248	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015275	GGGA	2	8	78275	78282	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015275	CCT	2	6	78357	78362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_015275	GTTA	2	8	78388	78395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015275	TTTTG	2	10	78399	78408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015275	TGA	2	6	78449	78454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015275	GACT	2	8	78531	78538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_015275	G	6	6	78566	78571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015275	AAT	2	6	78647	78652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015275	TAC	2	6	78673	78678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015275	TAC	2	6	78698	78703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015275	AAT	2	6	78909	78914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015275	CTA	2	6	78930	78935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015275	AGG	2	6	79137	79142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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554	NC_015275	GCG	2	6	79169	79174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015275	CGT	2	6	79229	79234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015275	TCA	2	6	79271	79276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015275	G	6	6	79365	79370	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015275	ACC	2	6	79371	79376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_015275	C	6	6	79375	79380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
560	NC_015275	CTC	2	6	79392	79397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015275	GGGAG	2	10	79446	79455	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015275	ATG	2	6	79503	79508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015275	AGG	2	6	79572	79577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015275	TAG	2	6	79630	79635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015275	CAG	2	6	79901	79906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015275	GT	4	8	79975	79982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015275	AGC	2	6	80034	80039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_015275	GA	3	6	80075	80080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015275	AC	3	6	80109	80114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_015275	ACG	2	6	80165	80170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015275	TAC	2	6	80362	80367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015275	TAT	2	6	80369	80374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015275	AGG	2	6	80392	80397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015275	GCT	2	6	80534	80539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015275	CCGTA	2	10	80556	80565	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
576	NC_015275	GAG	2	6	80583	80588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_015275	GTA	2	6	80948	80953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015275	AGG	2	6	81049	81054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015275	CT	3	6	81105	81110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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584	NC_015275	GGT	2	6	81326	81331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_015275	CGT	2	6	81548	81553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_015275	AAGAT	2	10	81706	81715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015275	GTA	2	6	81849	81854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_015275	AT	3	6	82674	82679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015275	GTAA	2	8	82688	82695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015275	TA	3	6	82707	82712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015275	ACA	2	6	82721	82726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015275	TTG	2	6	82812	82817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015275	TGAC	2	8	82820	82827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_015275	CG	3	6	82855	82860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_015275	A	6	6	82930	82935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015275	AC	3	6	82980	82985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_015275	TAA	2	6	83002	83007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015275	A	6	6	83006	83011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015275	ATA	3	9	83037	83045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015275	TAT	3	9	83052	83060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015275	ATT	2	6	83103	83108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015275	AATA	2	8	83124	83131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015275	GATA	2	8	83136	83143	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015275	TAT	2	6	83165	83170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015275	TAG	2	6	83174	83179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015275	A	8	8	83255	83262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_015275	ACT	2	6	83339	83344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015275	AGT	2	6	83384	83389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_015275	TAA	2	6	83542	83547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015275	GAA	2	6	83605	83610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015275	GAAAA	2	10	83640	83649	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015275	AGA	2	6	83668	83673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015275	ATC	2	6	83676	83681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015275	AT	3	6	83690	83695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015275	CTCA	2	8	83703	83710	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_015275	TTA	2	6	83711	83716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015275	ATA	2	6	83778	83783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015275	GATA	2	8	83800	83807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015275	ACT	2	6	83855	83860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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635	NC_015275	TAGA	2	8	84085	84092	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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637	NC_015275	ATA	2	6	84124	84129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015275	ATA	2	6	84138	84143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015275	A	7	7	84152	84158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015275	ATG	2	6	84188	84193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015275	ACA	2	6	84218	84223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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