MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 19274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015275	TAA	2	6	1216773	1216778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015275	AAT	2	6	1216800	1216805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015275	TTTA	2	8	1216816	1216823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015275	TTA	2	6	1216858	1216863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015275	AGCCT	2	10	1216918	1216927	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6006	NC_015275	TTA	2	6	1216957	1216962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015275	CTAAT	2	10	1217020	1217029	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6008	NC_015275	TAT	2	6	1217060	1217065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_015275	TAA	2	6	1217079	1217084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015275	ATC	2	6	1217121	1217126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015275	AT	3	6	1217131	1217136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015275	AAG	2	6	1217172	1217177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015275	ATC	2	6	1217199	1217204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_015275	GCA	2	6	1217257	1217262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_015275	T	6	6	1217289	1217294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015275	CTA	2	6	1217350	1217355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015275	TTTC	2	8	1217429	1217436	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_015275	TAA	2	6	1217446	1217451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015275	AAT	2	6	1217626	1217631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015275	ATC	2	6	1217675	1217680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_015275	ATA	2	6	1217682	1217687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015275	ATTTT	2	10	1217770	1217779	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015275	T	6	6	1217776	1217781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015275	TATAA	2	10	1217849	1217858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015275	ATA	2	6	1217859	1217864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015275	GAA	2	6	1217871	1217876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015275	A	7	7	1217888	1217894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_015275	TAA	2	6	1217921	1217926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015275	ATA	2	6	1217936	1217941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015275	GAA	2	6	1218733	1218738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015275	AGCTG	2	10	1218791	1218800	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6032	NC_015275	CCT	2	6	1218844	1218849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_015275	AGG	2	6	1218891	1218896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015275	CA	4	8	1218924	1218931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_015275	TAG	2	6	1219010	1219015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015275	ATA	2	6	1219018	1219023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015275	A	6	6	1219023	1219028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015275	TG	3	6	1219031	1219036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015275	TCATAT	2	12	1219080	1219091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6040	NC_015275	CCA	2	6	1219105	1219110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_015275	AGT	2	6	1219153	1219158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015275	CAA	2	6	1219259	1219264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015275	ACA	2	6	1219281	1219286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015275	AGA	2	6	1219287	1219292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015275	GGC	2	6	1219339	1219344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015275	G	8	8	1219400	1219407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015275	ACC	2	6	1219418	1219423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_015275	GTG	2	6	1219431	1219436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_015275	AAG	2	6	1219460	1219465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015275	GTTT	2	8	1219468	1219475	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015275	ACT	2	6	1219492	1219497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015275	TAA	2	6	1219512	1219517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015275	TAA	2	6	1219533	1219538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015275	TAA	2	6	1219564	1219569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_015275	AGT	2	6	1219610	1219615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015275	A	6	6	1219617	1219622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015275	AGG	2	6	1219644	1219649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_015275	TGAA	2	8	1221071	1221078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015275	TTAT	2	8	1221165	1221172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015275	GCTAG	2	10	1221841	1221850	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6061	NC_015275	TGA	2	6	1221868	1221873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015275	TGACA	2	10	1221947	1221956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_015275	AT	3	6	1221961	1221966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015275	TGTA	2	8	1221967	1221974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015275	AT	3	6	1223660	1223665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015275	CAC	2	6	1223666	1223671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_015275	TGT	2	6	1223702	1223707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015275	ATTT	2	8	1223709	1223716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015275	ATTT	2	8	1223732	1223739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015275	GTA	2	6	1223755	1223760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015275	CA	3	6	1223763	1223768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_015275	TA	3	6	1223788	1223793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015275	AAT	2	6	1223803	1223808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015275	A	6	6	1223836	1223841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_015275	TA	3	6	1223849	1223854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015275	A	7	7	1223862	1223868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015275	ATC	2	6	1223874	1223879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_015275	ACA	2	6	1223881	1223886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_015275	GTA	2	6	1223911	1223916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015275	A	7	7	1225265	1225271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_015275	TG	3	6	1225280	1225285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015275	ATA	2	6	1225310	1225315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015275	TA	3	6	1225314	1225319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_015275	GGA	2	6	1225340	1225345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_015275	ACA	2	6	1226825	1226830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015275	A	6	6	1226840	1226845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_015275	GAAATA	2	12	1226849	1226860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_015275	TAT	2	6	1226900	1226905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_015275	TCTT	2	8	1226919	1226926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6090	NC_015275	A	7	7	1226929	1226935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_015275	TGT	2	6	1226943	1226948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6093	NC_015275	AGG	2	6	1226973	1226978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_015275	TAAT	2	8	1228892	1228899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015275	TTA	2	6	1228928	1228933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6097	NC_015275	AGT	2	6	1228990	1228995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6099	NC_015275	TAA	2	6	1229111	1229116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015275	AGT	2	6	1229157	1229162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015275	TAC	2	6	1229168	1229173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015275	T	6	6	1229184	1229189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015275	GGC	2	6	1229223	1229228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_015275	CGAA	2	8	1229248	1229255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6105	NC_015275	AACG	2	8	1229343	1229350	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6106	NC_015275	TAT	2	6	1229385	1229390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6108	NC_015275	CGA	2	6	1229462	1229467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_015275	GCA	2	6	1229536	1229541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015275	CGC	2	6	1229583	1229588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_015275	GAAG	2	8	1229591	1229598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015275	CAG	2	6	1229625	1229630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_015275	GAA	2	6	1229632	1229637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_015275	A	7	7	1229636	1229642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015275	AAG	2	6	1229658	1229663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_015275	CAG	2	6	1229682	1229687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_015275	GAGC	2	8	1229705	1229712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6118	NC_015275	GCT	2	6	1229793	1229798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015275	TGA	2	6	1229807	1229812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_015275	GGC	2	6	1229893	1229898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_015275	GAA	2	6	1230135	1230140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015275	GAT	2	6	1230163	1230168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_015275	GGT	2	6	1230215	1230220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015275	GTC	2	6	1230229	1230234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_015275	TCGTG	2	10	1230238	1230247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6127	NC_015275	TAG	2	6	1230290	1230295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015275	AG	3	6	1230318	1230323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_015275	GGA	2	6	1230341	1230346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_015275	ATC	2	6	1230365	1230370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015275	AC	3	6	1230392	1230397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_015275	GCT	2	6	1230409	1230414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015275	A	6	6	1230452	1230457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_015275	AC	3	6	1230561	1230566	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6135	NC_015275	G	7	7	1230589	1230595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6139	NC_015275	TTTTG	2	10	1230746	1230755	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6141	NC_015275	GACT	2	8	1230878	1230885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6149	NC_015275	AAT	2	6	1231364	1231369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6153	NC_015275	GCG	2	6	1231622	1231627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_015275	TAT	2	6	1246193	1246198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6251	NC_015275	AG	3	6	1246255	1246260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6257	NC_015275	T	6	6	1246343	1246348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_015275	TAGGA	2	10	1246359	1246368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_015275	ATTT	2	8	1246400	1246407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_015275	TTA	2	6	1246412	1246417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_015275	ATC	2	6	1246435	1246440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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