MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014909	ATTTTT	2	12	2132	2143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014909	GTTTTT	2	12	3613	3624	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014909	ATTTTT	2	12	52465	52476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014909	AATATA	2	12	60432	60443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014909	ATTGTT	2	12	60642	60653	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014909	TAAAAA	2	12	68510	68521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014909	AATTAA	2	12	70717	70728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014909	TGTATG	2	12	74002	74013	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014909	GTTAAG	2	12	79630	79641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014909	GTATGT	2	12	83722	83733	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014909	TAAAAA	2	12	83746	83757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014909	AGGTTG	2	12	86143	86154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014909	TATTTG	2	12	96494	96505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014909	TAGATT	2	12	109607	109618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014909	AAGATG	2	12	121653	121664	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014909	TTTTTA	2	12	122204	122215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014909	AATTAT	2	12	127107	127118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014909	TTAACA	2	12	127707	127718	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014909	TGTATA	2	12	134804	134815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014909	TTAATA	2	12	134982	134993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014909	TTAATA	2	12	147822	147833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014909	TATATG	2	12	149305	149316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014909	ATGTAA	2	12	177097	177108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014909	ATTAAG	2	12	177453	177464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014909	AATATA	2	12	196029	196040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014909	TTTTAT	2	12	196122	196133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014909	TAATAT	2	12	196147	196158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014909	TTTATA	2	12	207142	207153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014909	TATTAG	2	12	212500	212511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014909	TGGAAT	2	12	215063	215074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014909	ATTTTT	2	12	233026	233037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014909	TTTATT	2	12	234748	234759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014909	AGATTG	2	12	240436	240447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014909	ATTTTT	2	12	243736	243747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014909	TGAATA	2	12	245388	245399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014909	ATTTTA	2	12	248900	248911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014909	TTAAAA	2	12	250060	250071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014909	ATTTTT	2	12	250950	250961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014909	ATTTGC	2	12	251003	251014	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014909	AATTAA	2	12	264167	264178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014909	GTTATA	2	12	269937	269948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014909	ATTTTT	2	12	272364	272375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014909	ATCATA	2	12	287787	287798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014909	TTTTAA	2	12	290405	290416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014909	TAATTT	2	12	304891	304902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014909	GTTTTT	2	12	308191	308202	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014909	TTAATT	2	12	324706	324717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014909	TGAATT	2	12	331742	331753	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014909	TTTATT	2	12	334134	334145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014909	ATTATA	2	12	348896	348907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014909	ATACAT	2	12	353586	353597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014909	ATTTTA	2	12	353692	353703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014909	TTTAAA	2	12	361160	361171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014909	TTTAAA	2	12	371440	371451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014909	ACTTCA	2	12	384029	384040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014909	TAAATA	2	12	389133	389144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014909	TAAAAA	2	12	397983	397994	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014909	TTAATT	2	12	413986	413997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014909	TAAAAA	2	12	415097	415108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014909	ACAATA	2	12	417928	417939	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014909	TACTAT	2	12	438117	438128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014909	CAAAAA	2	12	455345	455356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014909	ACCTAT	2	12	460057	460068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014909	AGTATT	2	12	460808	460819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014909	TATTTA	2	12	464179	464190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014909	TATAAA	2	12	464415	464426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014909	TATATT	2	12	466197	466208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014909	TATTTT	2	12	466941	466952	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014909	AATTTT	2	12	486923	486934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014909	AAAATT	2	12	487309	487320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014909	AAATAA	2	12	489025	489036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014909	TCCCCC	2	12	492247	492258	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
73	NC_014909	AATATA	2	12	503504	503515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014909	ATAACA	2	12	505453	505464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014909	AATCAA	2	12	507045	507056	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014909	TAATTA	2	12	508691	508702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014909	ACTATA	2	12	514617	514628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014909	TAGAAC	2	12	518673	518684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014909	TATTTT	2	12	533302	533313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014909	TCTTTC	2	12	534736	534747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014909	AAAATA	2	12	563127	563138	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014909	TATCTT	2	12	563264	563275	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014909	TAATAT	2	12	572018	572029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014909	AATATC	2	12	594523	594534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014909	ACAATA	2	12	601574	601585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014909	ATATAA	2	12	607516	607527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014909	TATTAC	2	12	611198	611209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014909	ATAAAA	2	12	614203	614214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014909	ATTACA	2	12	623724	623735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014909	AAAAAT	2	12	623923	623934	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014909	AAAATG	2	12	631134	631145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014909	TAAAAA	2	12	633656	633667	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014909	AAAATA	2	12	642714	642725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014909	ATAAAA	2	12	650929	650940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014909	AATATT	2	12	651150	651161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014909	AAAATC	2	12	654314	654325	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014909	CTTATA	2	12	656780	656791	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014909	ACTCAA	2	12	660083	660094	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014909	TTCTTA	2	12	662725	662736	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014909	TACAAA	2	12	669954	669965	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014909	TTTATA	2	12	682066	682077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014909	AACATA	2	12	683431	683442	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014909	AATTTA	2	12	692880	692891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014909	TAATTT	2	12	697085	697096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014909	ATTTTT	2	12	697138	697149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014909	TATATG	2	12	697403	697414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014909	TTTAAT	2	12	697509	697520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014909	TTTTTC	2	12	699437	699448	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014909	TAATTA	2	12	706028	706039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014909	ATAGAA	2	12	716981	716992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014909	AAATTT	2	12	722395	722406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.