MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Blochmannia vafer str. BVAF chromosome

Total Repeats: 5257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014909	AATATC	2	12	594523	594534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4002	NC_014909	TAA	2	6	594537	594542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014909	CTT	2	6	594546	594551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_014909	ACA	2	6	594620	594625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_014909	AT	4	8	594665	594672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014909	AT	3	6	596721	596726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014909	AAT	2	6	597921	597926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014909	TTA	2	6	597945	597950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014909	AATA	2	8	597991	597998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014909	A	7	7	598061	598067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014909	ATT	2	6	598089	598094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014909	ACA	2	6	598112	598117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_014909	ATAC	2	8	598118	598125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_014909	T	6	6	598128	598133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014909	CTTAT	2	10	598137	598146	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4016	NC_014909	TAA	2	6	598161	598166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014909	CAT	2	6	598172	598177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_014909	AT	3	6	599808	599813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014909	TAAC	2	8	599865	599872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_014909	AAT	3	9	599873	599881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014909	TTA	2	6	601379	601384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014909	AT	3	6	601416	601421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014909	T	6	6	601427	601432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014909	TAT	2	6	601443	601448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014909	ATT	2	6	601461	601466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014909	AT	5	10	601471	601480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014909	ATA	2	6	601491	601496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014909	AAC	2	6	601500	601505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_014909	ATT	2	6	601527	601532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014909	ACAATA	2	12	601574	601585	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4031	NC_014909	TTTC	2	8	601594	601601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_014909	TCT	2	6	601613	601618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_014909	AAT	2	6	601660	601665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014909	ACT	2	6	601676	601681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_014909	AAT	2	6	601688	601693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014909	TTA	2	6	601706	601711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_014909	A	7	7	601732	601738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014909	TGT	2	6	601762	601767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_014909	TTA	2	6	601773	601778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014909	ATAA	2	8	601795	601802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014909	GTA	2	6	601832	601837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014909	A	8	8	603404	603411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014909	ATTT	2	8	603420	603427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014909	AAT	2	6	603435	603440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014909	CTA	2	6	603448	603453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_014909	ATT	2	6	603454	603459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014909	TTA	2	6	603460	603465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014909	ACA	2	6	603468	603473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_014909	T	8	8	603477	603484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014909	AT	4	8	603493	603500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014909	ATA	2	6	604974	604979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014909	ATTT	2	8	604987	604994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014909	ATC	3	9	604999	605007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_014909	TAC	2	6	606309	606314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_014909	AT	4	8	606359	606366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014909	TG	3	6	606370	606375	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014909	TA	3	6	606376	606381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014909	ATATAA	2	12	607516	607527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014909	T	6	6	607531	607536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014909	CA	3	6	607537	607542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_014909	ATT	2	6	607655	607660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_014909	AT	4	8	607683	607690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014909	TGA	2	6	607724	607729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014909	AAC	2	6	607733	607738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_014909	CAT	2	6	607740	607745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_014909	ATATA	2	10	607746	607755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014909	TTA	2	6	607759	607764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014909	ATT	2	6	608872	608877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014909	ATT	2	6	608917	608922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014909	AAT	2	6	608923	608928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014909	ATT	2	6	608966	608971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014909	TC	3	6	608974	608979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_014909	ATA	3	9	608993	609001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014909	AT	4	8	609008	609015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014909	CATT	2	8	609037	609044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4076	NC_014909	TCTCT	2	10	609495	609504	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_014909	TAAA	3	12	609508	609519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014909	TA	3	6	609541	609546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014909	A	6	6	609573	609578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014909	A	6	6	609580	609585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014909	ACA	2	6	609596	609601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_014909	AT	3	6	609611	609616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014909	ATT	2	6	609624	609629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014909	ATTAT	2	10	609649	609658	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014909	TA	3	6	610850	610855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_014909	AT	3	6	610897	610902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014909	ATA	2	6	610916	610921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014909	CAT	2	6	610937	610942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_014909	ATT	2	6	610960	610965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_014909	A	6	6	610966	610971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014909	TACAT	2	10	610984	610993	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4092	NC_014909	TACA	2	8	610995	611002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_014909	ATATA	2	10	611008	611017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014909	ATATT	2	10	611039	611048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014909	TTAA	2	8	611049	611056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014909	ATT	2	6	611090	611095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014909	TAA	2	6	611099	611104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014909	AT	3	6	611112	611117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014909	ATAC	2	8	611141	611148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4100	NC_014909	ATC	2	6	611152	611157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_014909	AAAT	2	8	611158	611165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014909	TATTAC	2	12	611198	611209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4103	NC_014909	AAC	2	6	611241	611246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_014909	AAT	2	6	611251	611256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014909	TA	3	6	611272	611277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014909	AAAT	2	8	611278	611285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014909	ACT	2	6	613407	613412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_014909	AAT	2	6	613417	613422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014909	A	6	6	613432	613437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014909	AAT	2	6	613447	613452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014909	TAA	2	6	613487	613492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014909	TA	3	6	613500	613505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014909	TAT	2	6	613510	613515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014909	AT	3	6	614053	614058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014909	AAT	2	6	614086	614091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014909	AAAT	2	8	614097	614104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014909	ATT	2	6	614118	614123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014909	T	6	6	614122	614127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014909	AT	3	6	614129	614134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014909	TAT	2	6	614145	614150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014909	ATAAAA	2	12	614203	614214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014909	A	7	7	614211	614217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014909	AACTC	2	10	615352	615361	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4124	NC_014909	ACCC	2	8	615398	615405	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4125	NC_014909	ATA	2	6	615429	615434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014909	TCCT	2	8	615460	615467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_014909	A	7	7	615488	615494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014909	AAT	2	6	615497	615502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014909	C	7	7	615529	615535	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4130	NC_014909	TAA	2	6	615556	615561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014909	TA	3	6	615565	615570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014909	ATT	2	6	615577	615582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014909	TAAA	2	8	615587	615594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014909	A	6	6	615592	615597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_014909	A	6	6	616341	616346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_014909	A	6	6	616352	616357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_014909	TA	5	10	616387	616396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_014909	ATA	2	6	617456	617461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_014909	TA	3	6	619256	619261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_014909	ATA	2	6	620106	620111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4267	NC_014909	AACTT	2	10	629562	629571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4270	NC_014909	CCCT	2	8	629690	629697	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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4272	NC_014909	CAG	2	6	629704	629709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4274	NC_014909	GT	3	6	629760	629765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4407	NC_014909	ATC	2	6	651043	651048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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