MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014796	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014796	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014796	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014796	TA	3	6	52217	52222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014796	TG	3	6	63310	63315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014796	AG	3	6	70240	70245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014796	GA	3	6	97073	97078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014796	GA	3	6	98982	98987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014796	AG	3	6	101793	101798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014796	TC	3	6	108277	108282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014796	AG	3	6	112367	112372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014796	TA	4	8	124061	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014796	TA	4	8	125329	125336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014796	TG	3	6	128432	128437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014796	AC	3	6	128566	128571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014796	AT	3	6	130243	130248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014796	TA	3	6	130526	130531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014796	CT	3	6	130622	130627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014796	CT	3	6	130753	130758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014796	GA	3	6	134365	134370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014796	AT	3	6	147215	147220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014796	AG	3	6	158087	158092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014796	AC	3	6	161119	161124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014796	GA	3	6	161349	161354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014796	AG	3	6	162515	162520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014796	AG	3	6	162560	162565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014796	AT	3	6	162594	162599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014796	TA	3	6	173177	173182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014796	AG	3	6	173221	173226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014796	AT	3	6	175416	175421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014796	AG	3	6	179476	179481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014796	CT	3	6	193717	193722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014796	AG	3	6	198353	198358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014796	TA	4	8	198374	198381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014796	AC	3	6	199242	199247	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014796	AT	3	6	210366	210371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014796	GT	3	6	210722	210727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014796	AG	3	6	210742	210747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014796	AT	3	6	215442	215447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014796	GA	3	6	215502	215507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014796	GT	3	6	215542	215547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014796	CT	3	6	215579	215584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014796	AG	3	6	215806	215811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014796	TC	3	6	215865	215870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014796	AG	3	6	222924	222929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014796	TA	4	8	232259	232266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014796	AG	3	6	237005	237010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014796	AT	3	6	237075	237080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014796	AG	3	6	241102	241107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014796	AG	3	6	244068	244073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014796	GT	3	6	261611	261616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014796	TC	3	6	266723	266728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014796	AT	4	8	266761	266768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014796	TC	3	6	267865	267870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014796	TG	3	6	268011	268016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014796	AG	3	6	274605	274610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014796	TG	3	6	276795	276800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014796	TC	3	6	276858	276863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014796	AG	3	6	276921	276926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014796	GT	3	6	277637	277642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014796	TC	3	6	282139	282144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014796	TA	3	6	282188	282193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014796	CA	3	6	299895	299900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014796	AT	3	6	301367	301372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014796	TC	3	6	301673	301678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014796	TG	3	6	307926	307931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014796	GA	3	6	308172	308177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014796	AT	3	6	308452	308457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014796	GA	3	6	310199	310204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014796	AC	3	6	310772	310777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014796	AG	3	6	313756	313761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014796	GA	3	6	313806	313811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014796	AC	3	6	319311	319316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014796	TG	3	6	324669	324674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014796	GA	3	6	324715	324720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014796	AG	3	6	327633	327638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014796	TG	3	6	328411	328416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014796	TC	3	6	329342	329347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014796	GT	3	6	329423	329428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014796	GT	3	6	329794	329799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014796	AC	3	6	330467	330472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014796	AG	3	6	330949	330954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014796	TC	3	6	336951	336956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014796	TA	3	6	339945	339950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_014796	CT	3	6	345448	345453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014796	TA	3	6	345521	345526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014796	TA	3	6	351100	351105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014796	CT	4	8	353716	353723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014796	TA	3	6	357207	357212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014796	AT	3	6	362398	362403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014796	TA	3	6	365039	365044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014796	AG	3	6	366045	366050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014796	AG	3	6	366428	366433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014796	AT	4	8	366543	366550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014796	GA	3	6	366559	366564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014796	AT	3	6	369439	369444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014796	TG	3	6	369688	369693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_014796	TC	3	6	377330	377335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014796	TA	3	6	381561	381566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014796	TA	3	6	396161	396166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_014796	GA	3	6	424440	424445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014796	GA	3	6	435173	435178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014796	TC	3	6	439706	439711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014796	AG	3	6	441691	441696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014796	CT	3	6	441762	441767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_014796	AG	3	6	442336	442341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014796	TA	3	6	442879	442884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014796	CT	3	6	444162	444167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014796	TC	3	6	449792	449797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014796	TG	3	6	455118	455123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014796	AG	3	6	455267	455272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014796	CT	4	8	458149	458156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014796	TA	3	6	461503	461508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014796	AG	3	6	464978	464983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014796	AG	3	6	471549	471554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_014796	AG	3	6	474382	474387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014796	AG	3	6	475883	475888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014796	TA	3	6	475963	475968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014796	AT	3	6	476506	476511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014796	AG	3	6	476538	476543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_014796	CA	3	6	479319	479324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_014796	CT	3	6	484181	484186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014796	AG	4	8	484369	484376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014796	TC	3	6	485942	485947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014796	TA	3	6	488704	488709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014796	GA	3	6	499225	499230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014796	AT	3	6	508415	508420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014796	AT	3	6	508453	508458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014796	AG	3	6	515138	515143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014796	CT	4	8	540416	540423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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142	NC_014796	TC	3	6	567752	567757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014796	GA	3	6	584683	584688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_014796	AC	3	6	584935	584940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_014796	AG	3	6	585159	585164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014796	AC	3	6	595615	595620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014796	GT	3	6	595635	595640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014796	AG	3	6	595746	595751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_014796	GA	5	10	615861	615870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.