MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 1512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014796	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014796	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014796	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014796	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014796	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014796	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014796	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014796	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014796	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014796	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014796	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014796	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014796	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014796	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014796	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014796	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014796	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014796	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014796	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014796	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014796	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014796	TTC	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014796	TTA	2	6	26698	26703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014796	AGG	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014796	AGA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014796	CTT	2	6	31984	31989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014796	AAT	2	6	32409	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014796	TTA	2	6	33430	33435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014796	AAG	2	6	33451	33456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014796	TGT	3	9	33530	33538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014796	AAG	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014796	TGG	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014796	TTC	2	6	37591	37596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014796	TTC	2	6	37632	37637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014796	TGC	2	6	37680	37685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014796	AGA	2	6	37870	37875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014796	TAT	2	6	38105	38110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014796	GAA	2	6	39481	39486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014796	TTA	2	6	42387	42392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014796	GAA	2	6	42409	42414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014796	GTT	2	6	43450	43455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014796	GAT	2	6	52233	52238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014796	TCG	2	6	52300	52305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014796	TTG	2	6	52315	52320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014796	GTC	2	6	52419	52424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014796	AAG	2	6	52519	52524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014796	CCT	2	6	52737	52742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_014796	TGC	2	6	52815	52820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014796	CCT	2	6	52821	52826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014796	TGC	2	6	52827	52832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014796	AGG	2	6	52846	52851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014796	AAT	2	6	54535	54540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014796	TGG	2	6	57866	57871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014796	GGT	2	6	58095	58100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014796	GGC	2	6	59453	59458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014796	GAG	2	6	59512	59517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014796	ATT	2	6	59561	59566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014796	TTA	2	6	59588	59593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014796	TAA	2	6	59662	59667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014796	AGA	2	6	59738	59743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014796	CTA	2	6	59977	59982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014796	CAA	2	6	63301	63306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014796	TTG	2	6	64382	64387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014796	GAA	2	6	64410	64415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014796	TCC	2	6	64495	64500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014796	AAT	2	6	64641	64646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014796	GTC	2	6	70295	70300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014796	AGA	2	6	70339	70344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014796	ATA	2	6	71243	71248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014796	TTA	3	9	74095	74103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014796	ATC	2	6	76092	76097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014796	TCA	2	6	77417	77422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014796	TTC	2	6	77494	77499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014796	TAT	2	6	77526	77531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014796	TAT	2	6	77785	77790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014796	AGA	2	6	80498	80503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014796	AAT	2	6	80594	80599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014796	TGT	2	6	81815	81820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014796	CAA	2	6	81900	81905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014796	TCC	2	6	81915	81920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014796	TTA	2	6	83428	83433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014796	AAT	2	6	83435	83440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014796	AGT	2	6	83448	83453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014796	GTT	2	6	87386	87391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014796	AGA	2	6	93519	93524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014796	AAG	2	6	93556	93561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014796	TAA	2	6	93563	93568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014796	AAT	2	6	93642	93647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014796	TTG	2	6	93680	93685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014796	GGT	2	6	93689	93694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014796	GTT	2	6	93959	93964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014796	AAG	2	6	98671	98676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014796	TCT	2	6	98943	98948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014796	AAC	2	6	99041	99046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014796	GCT	2	6	99217	99222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014796	ACA	2	6	99273	99278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014796	ATG	2	6	99375	99380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014796	ATA	2	6	99428	99433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014796	GTT	2	6	99461	99466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014796	ACT	2	6	99533	99538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014796	ATC	2	6	99555	99560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014796	TAG	2	6	99589	99594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014796	TTC	2	6	99694	99699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014796	ACT	2	6	101732	101737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014796	CAA	2	6	101782	101787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014796	TTA	2	6	108238	108243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014796	TCT	2	6	108317	108322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014796	AAC	2	6	108437	108442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014796	AGA	2	6	109136	109141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014796	GAA	2	6	110187	110192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014796	ATT	2	6	112378	112383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014796	TAC	2	6	118338	118343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014796	GAG	2	6	119159	119164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014796	ACT	2	6	120760	120765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014796	TCT	2	6	122644	122649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014796	AGT	2	6	122675	122680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014796	AAT	2	6	122772	122777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014796	ATT	2	6	122792	122797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014796	TGG	2	6	122805	122810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014796	TCC	2	6	125294	125299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014796	TAC	2	6	125306	125311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014796	TGT	2	6	125313	125318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014796	AAT	2	6	125769	125774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014796	ATT	2	6	128312	128317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014796	TTA	2	6	128347	128352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014796	TGT	2	6	128543	128548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014796	ACA	2	6	128615	128620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014796	TAC	2	6	128631	128636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014796	CTT	2	6	130366	130371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014796	ATT	2	6	130473	130478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014796	AGG	2	6	130493	130498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014796	TAA	2	6	130652	130657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014796	TAA	2	6	130786	130791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014796	ATT	2	6	130802	130807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014796	TAA	2	6	130820	130825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014796	TGT	2	6	131451	131456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014796	CAA	2	6	131489	131494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014796	TAT	2	6	131496	131501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014796	TAT	2	6	133305	133310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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