MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 3116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014796	ACAA	2	8	1092381	1092388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_014796	A	6	6	1092409	1092414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014796	AG	3	6	1092426	1092431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014796	TAA	2	6	1095271	1095276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014796	AAC	2	6	1095362	1095367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014796	AAT	2	6	1095374	1095379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014796	TAAT	2	8	1095406	1095413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014796	AATT	2	8	1095432	1095439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014796	TAATTT	2	12	1095463	1095474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014796	AAT	2	6	1095507	1095512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014796	TAA	2	6	1095536	1095541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014796	A	7	7	1095540	1095546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014796	ATT	2	6	1098112	1098117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014796	TCT	2	6	1099471	1099476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_014796	GAA	2	6	1100439	1100444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014796	TAT	2	6	1100470	1100475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014796	A	7	7	1100532	1100538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014796	T	6	6	1100567	1100572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014796	GA	3	6	1100638	1100643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014796	TAG	2	6	1109276	1109281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_014796	TA	3	6	1109305	1109310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014796	A	6	6	1109314	1109319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014796	AAG	2	6	1109338	1109343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014796	TCT	2	6	1109363	1109368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014796	ACT	2	6	1109385	1109390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014796	ATG	2	6	1113246	1113251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014796	AAC	2	6	1113284	1113289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_014796	AAT	2	6	1113302	1113307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014796	ATTC	2	8	1113410	1113417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_014796	TCA	2	6	1113425	1113430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_014796	CTT	2	6	1113492	1113497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014796	AAG	2	6	1113510	1113515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014796	T	6	6	1113517	1113522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014796	TTG	2	6	1113527	1113532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014796	TGT	2	6	1113573	1113578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014796	CT	3	6	1117368	1117373	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_014796	T	7	7	1120184	1120190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014796	T	6	6	1121145	1121150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014796	A	7	7	1121167	1121173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014796	TAG	2	6	1125394	1125399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014796	GTT	2	6	1125402	1125407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014796	ATA	2	6	1127929	1127934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014796	ACC	2	6	1128975	1128980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_014796	T	6	6	1128984	1128989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014796	A	6	6	1129084	1129089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014796	A	6	6	1129103	1129108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014796	TCA	2	6	1129116	1129121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_014796	ATTT	2	8	1129135	1129142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014796	TTCT	2	8	1130783	1130790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_014796	ACA	2	6	1130843	1130848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_014796	A	6	6	1130879	1130884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014796	A	6	6	1132190	1132195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014796	ATT	2	6	1132245	1132250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_014796	GTTA	2	8	1132321	1132328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014796	TAT	2	6	1133898	1133903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_014796	AAAATA	2	12	1133907	1133918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014796	CTT	2	6	1133926	1133931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_014796	ATT	2	6	1133934	1133939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014796	T	8	8	1133959	1133966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014796	TCT	2	6	1138047	1138052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014796	GTT	2	6	1138058	1138063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014796	T	6	6	1138098	1138103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014796	CTT	2	6	1138136	1138141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_014796	ATC	2	6	1138142	1138147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014796	ATT	2	6	1138167	1138172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014796	TTA	2	6	1138174	1138179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014796	TAC	2	6	1138210	1138215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014796	ATT	2	6	1138216	1138221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014796	GAA	2	6	1138293	1138298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014796	T	6	6	1138391	1138396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014796	A	6	6	1138407	1138412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014796	CTT	2	6	1138434	1138439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_014796	AGT	2	6	1138527	1138532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014796	TTGC	2	8	1138555	1138562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_014796	T	8	8	1138570	1138577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_014796	A	6	6	1138598	1138603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_014796	T	6	6	1142591	1142596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014796	T	6	6	1146443	1146448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_014796	AC	3	6	1146506	1146511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_014796	ATG	2	6	1146521	1146526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_014796	TAA	2	6	1146567	1146572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014796	CAA	2	6	1146576	1146581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014796	TACAGA	2	12	1146585	1146596	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3084	NC_014796	AAAAG	2	10	1146663	1146672	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014796	ATC	2	6	1146687	1146692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_014796	CAC	2	6	1146699	1146704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3087	NC_014796	GAA	2	6	1146731	1146736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_014796	TTC	2	6	1146746	1146751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014796	TC	3	6	1146750	1146755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_014796	A	6	6	1146794	1146799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_014796	T	6	6	1147866	1147871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_014796	AAT	2	6	1151553	1151558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014796	GCG	2	6	1151575	1151580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_014796	ATT	2	6	1153328	1153333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_014796	CAA	2	6	1153340	1153345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_014796	AAT	2	6	1153346	1153351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_014796	AAAG	2	8	1153383	1153390	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014796	TAA	2	6	1153411	1153416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014796	GAT	2	6	1153425	1153430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014796	A	6	6	1154703	1154708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_014796	T	6	6	1154726	1154731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014796	TTTA	2	8	1154747	1154754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014796	TC	3	6	1154755	1154760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3104	NC_014796	TTCT	2	8	1154806	1154813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_014796	A	6	6	1154898	1154903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014796	CGT	2	6	1159486	1159491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014796	TAAT	2	8	1159495	1159502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014796	GTTAAA	2	12	1159512	1159523	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014796	TA	4	8	1159525	1159532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014796	ATT	2	6	1159553	1159558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014796	A	7	7	1159568	1159574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014796	A	6	6	1159577	1159582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014796	ATA	2	6	1159630	1159635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014796	CCTTCG	2	12	1162301	1162312	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3115	NC_014796	AAG	2	6	1162367	1162372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014796	A	7	7	1164009	1164015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.