MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 3116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014796	AGG	2	6	201667	201672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014796	TTG	2	6	203643	203648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014796	GAA	2	6	203709	203714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014796	TAAA	2	8	204095	204102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014796	TTG	2	6	204116	204121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014796	TCT	2	6	205091	205096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014796	AAT	2	6	205158	205163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014796	T	7	7	205163	205169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014796	GAT	2	6	205178	205183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014796	TCT	2	6	205197	205202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014796	CAAA	2	8	205218	205225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_014796	TAG	2	6	205255	205260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014796	TTTA	2	8	205664	205671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014796	ATA	2	6	206174	206179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014796	AAC	2	6	210254	210259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014796	AT	3	6	210366	210371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014796	ATT	2	6	210375	210380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014796	ATT	2	6	210412	210417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014796	A	6	6	210441	210446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014796	T	6	6	210454	210459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014796	TTTTTA	2	12	210487	210498	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014796	GAA	2	6	210538	210543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014796	ATG	2	6	210583	210588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014796	GAT	2	6	210598	210603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014796	GCA	2	6	210673	210678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014796	TCG	2	6	210686	210691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014796	GATT	2	8	210704	210711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014796	GT	3	6	210722	210727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014796	AG	3	6	210742	210747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014796	AAAG	2	8	210756	210763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014796	TTG	2	6	210855	210860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014796	CTC	2	6	210890	210895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_014796	CTAA	2	8	210914	210921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
534	NC_014796	GTC	2	6	211078	211083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014796	T	6	6	211167	211172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014796	GTTT	2	8	211876	211883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014796	T	6	6	211895	211900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014796	TGA	2	6	215327	215332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014796	TAA	2	6	215364	215369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014796	T	6	6	215397	215402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014796	AT	3	6	215442	215447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014796	GA	3	6	215502	215507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014796	GT	3	6	215542	215547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014796	CT	3	6	215579	215584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_014796	T	6	6	215607	215612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014796	T	6	6	215670	215675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014796	T	6	6	215716	215721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014796	A	6	6	215767	215772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014796	AG	3	6	215806	215811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014796	TC	3	6	215865	215870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_014796	ATA	2	6	222916	222921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014796	AG	3	6	222924	222929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014796	AAGA	2	8	222931	222938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014796	AGA	2	6	225894	225899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014796	ATAAA	2	10	225900	225909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014796	A	6	6	225921	225926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014796	T	8	8	225976	225983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014796	G	6	6	226041	226046	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014796	CTT	2	6	226367	226372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014796	AACA	2	8	226749	226756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_014796	ATTTT	2	10	226757	226766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014796	TTA	2	6	226767	226772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014796	A	8	8	226805	226812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014796	TAA	2	6	226830	226835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014796	TAAAGA	2	12	226842	226853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014796	TAA	2	6	226866	226871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014796	A	6	6	226910	226915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014796	A	6	6	228296	228301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014796	T	7	7	228302	228308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014796	AAG	2	6	228335	228340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014796	TAT	2	6	228351	228356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014796	T	6	6	229239	229244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014796	ATA	2	6	229259	229264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014796	CCT	2	6	229733	229738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_014796	ATA	2	6	229761	229766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014796	T	8	8	229808	229815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014796	A	6	6	232239	232244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014796	ATTA	2	8	232253	232260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014796	TA	4	8	232259	232266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014796	T	7	7	232270	232276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014796	T	6	6	232307	232312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014796	GAT	2	6	232324	232329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014796	GCG	2	6	232338	232343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014796	GAT	2	6	232381	232386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014796	T	6	6	235977	235982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014796	AG	3	6	237005	237010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014796	AT	3	6	237075	237080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014796	CTA	2	6	237184	237189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014796	CTTG	2	8	238179	238186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_014796	GAAT	2	8	238230	238237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014796	GAA	3	9	238244	238252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014796	T	6	6	238267	238272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014796	AAG	2	6	238276	238281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014796	T	7	7	238291	238297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014796	AAG	2	6	238330	238335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014796	ACC	2	6	238349	238354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014796	AATT	2	8	238369	238376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014796	GAT	2	6	238410	238415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014796	TTTC	2	8	238469	238476	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_014796	GTT	2	6	238497	238502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014796	A	8	8	238537	238544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014796	AGA	2	6	238579	238584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014796	ATTATA	2	12	239711	239722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014796	A	6	6	239746	239751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014796	CTT	2	6	239783	239788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014796	TAAAA	2	10	240128	240137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014796	T	6	6	240172	240177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014796	GTTT	2	8	240900	240907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014796	TAG	2	6	240968	240973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014796	A	7	7	241060	241066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014796	AG	3	6	241102	241107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014796	TAT	2	6	241118	241123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014796	TCAT	2	8	241130	241137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
614	NC_014796	ATA	2	6	241145	241150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014796	TGT	2	6	242666	242671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014796	TTGAAT	2	12	244024	244035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014796	AGGA	2	8	244060	244067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014796	AG	3	6	244068	244073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014796	T	7	7	244082	244088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014796	GTTT	2	8	247703	247710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014796	T	6	6	247720	247725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014796	AAT	2	6	247814	247819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014796	TCA	2	6	247851	247856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014796	AAG	2	6	247858	247863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014796	ACA	2	6	249757	249762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_014796	T	6	6	250229	250234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014796	GAA	2	6	252288	252293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014796	AAT	2	6	252321	252326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014796	T	8	8	252337	252344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014796	TTG	2	6	253036	253041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014796	TGA	2	6	253089	253094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014796	T	6	6	253120	253125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014796	T	7	7	253169	253175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014796	T	6	6	253191	253196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014796	A	7	7	253199	253205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014796	TAT	2	6	255848	255853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014796	TTG	2	6	255878	255883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014796	TTTAA	2	10	255890	255899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014796	AAGAT	2	10	255964	255973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014796	T	6	6	261588	261593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014796	GT	3	6	261611	261616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_014796	A	6	6	261755	261760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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