MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	AAAAAT	2	12	65481	65492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014758	AGATTT	2	12	71911	71922	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014758	GTTTTA	2	12	145376	145387	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014758	TTAAAA	2	12	163496	163507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014758	TAAAAA	2	12	199528	199539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014758	TAAGAA	2	12	211497	211508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014758	ATAAAA	2	12	236509	236520	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014758	AATCAA	2	12	300555	300566	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014758	AATTTT	2	12	347938	347949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014758	AAATTT	2	12	399722	399733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014758	ATATTC	2	12	441765	441776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014758	ATTATA	2	12	476180	476191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014758	TTAATT	2	12	560695	560706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014758	AAAGGG	2	12	677141	677152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014758	TTAATA	2	12	796423	796434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014758	AATATA	2	12	801729	801740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014758	TAAAAA	2	12	802181	802192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014758	GTTTTT	2	12	829987	829998	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014758	TTTTCA	2	12	843443	843454	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014758	ATTTTA	2	12	1032224	1032235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014758	ATTATA	2	12	1158593	1158604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014758	AATGAT	2	12	1202741	1202752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014758	CATTTT	2	12	1209156	1209167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014758	TGCCGG	2	12	1214288	1214299	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014758	GGGTGA	2	12	1225292	1225303	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014758	GGGTGT	4	24	1225316	1225339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014758	GGGTGA	2	12	1225340	1225351	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014758	ATTATA	2	12	1229741	1229752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014758	TTATCA	2	12	1230435	1230446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014758	AACAAT	2	12	1321128	1321139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014758	AAATTA	2	12	1352311	1352322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014758	TTTTAT	2	12	1406175	1406186	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014758	CTTTTT	2	12	1417146	1417157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014758	TATTTT	2	12	1447179	1447190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014758	AAATGA	2	12	1518072	1518083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014758	TTAAAA	2	12	1535399	1535410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014758	ATTTTT	2	12	1581933	1581944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014758	TAAATG	2	12	1599415	1599426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014758	ATTTTT	2	12	1621683	1621694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014758	TCTTTA	2	12	1668427	1668438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014758	ATCATA	2	12	1670016	1670027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014758	ATTTTA	2	12	1740009	1740020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014758	ATTTTT	2	12	1825710	1825721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014758	TAAATG	2	12	1829394	1829405	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014758	AGAAAT	2	12	1987140	1987151	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014758	TTAAAG	2	12	1990587	1990598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014758	CTTTTC	2	12	2019583	2019594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014758	TTTTCA	2	12	2020779	2020790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014758	TGAAAA	2	12	2026006	2026017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014758	CAAATA	2	12	2027562	2027573	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014758	GGTAAG	2	12	2032081	2032092	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014758	ACCTCT	2	12	2051867	2051878	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014758	ATCTGA	2	12	2052391	2052402	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014758	ACGTTA	2	12	2111328	2111339	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014758	ATTTTT	2	12	2113818	2113829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014758	GTTAAA	2	12	2131216	2131227	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.