MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	TTA	2	6	44	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014749	GGA	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014749	GTC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014749	GTA	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014749	CTG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014749	CTG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014749	TTA	2	6	1194	1199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014749	TGA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014749	ATT	2	6	1381	1386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014749	TTC	2	6	1432	1437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014749	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014749	AGA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014749	ACT	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014749	ATC	3	9	1694	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014749	TCC	2	6	1739	1744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014749	CTC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014749	TAA	3	9	7869	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014749	GAT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014749	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014749	TTA	2	6	9807	9812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014749	TAG	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014749	ATA	2	6	9833	9838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014749	ATT	2	6	10040	10045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014749	ATT	2	6	10050	10055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014749	TAG	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014749	GTA	2	6	10475	10480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014749	CAA	2	6	10489	10494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014749	AAT	2	6	10533	10538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014749	AAT	2	6	10754	10759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014749	AGA	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014749	TGA	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014749	TAT	2	6	11116	11121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014749	ATT	2	6	12819	12824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014749	TAT	2	6	12836	12841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014749	AGG	2	6	16515	16520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014749	GCT	2	6	17317	17322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014749	CTA	2	6	17452	17457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014749	GTA	2	6	17516	17521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014749	TAT	2	6	17721	17726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014749	ATT	2	6	19091	19096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014749	TTC	2	6	19382	19387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014749	ATT	2	6	19689	19694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014749	AAT	2	6	19698	19703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014749	TTA	2	6	19818	19823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014749	TAC	2	6	19893	19898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014749	TAA	3	9	19907	19915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014749	ATT	2	6	21003	21008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014749	TAT	2	6	21018	21023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014749	GAA	2	6	21084	21089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014749	GAA	2	6	21114	21119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014749	ATT	2	6	21185	21190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014749	GTT	2	6	21209	21214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014749	AAG	2	6	21225	21230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014749	TAA	2	6	21286	21291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014749	GAC	2	6	21394	21399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014749	GTA	2	6	21466	21471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014749	ACT	2	6	21923	21928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014749	GAT	2	6	21958	21963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014749	CTT	2	6	21967	21972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014749	ATG	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014749	GAA	2	6	22539	22544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014749	CTA	2	6	24104	24109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014749	TCC	2	6	24957	24962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014749	CTA	2	6	24991	24996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014749	ATC	2	6	25091	25096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014749	ATC	2	6	25208	25213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014749	TAT	4	12	28628	28639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014749	GTA	2	6	28671	28676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014749	ATT	2	6	28869	28874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014749	ATT	2	6	28918	28923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014749	AAG	2	6	28940	28945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014749	TCT	2	6	28952	28957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014749	AAT	2	6	30651	30656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014749	ATT	2	6	30959	30964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014749	CTA	2	6	31277	31282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014749	AAT	2	6	31362	31367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014749	GTA	2	6	31455	31460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014749	AGG	2	6	31496	31501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014749	TTA	2	6	32982	32987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014749	CTT	3	9	33090	33098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014749	AAT	2	6	33161	33166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014749	ATC	2	6	33280	33285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014749	GAA	2	6	33335	33340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014749	TTG	2	6	33456	33461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014749	TCC	2	6	33742	33747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014749	TAT	2	6	33768	33773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014749	TGC	2	6	33819	33824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014749	TCC	2	6	35574	35579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_014749	GAG	2	6	35595	35600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014749	AAT	2	6	35761	35766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014749	CCT	2	6	36813	36818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014749	TGT	2	6	36955	36960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014749	ATG	2	6	36961	36966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014749	CAA	2	6	36983	36988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014749	AAC	2	6	36990	36995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014749	TAT	2	6	37407	37412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014749	TAT	2	6	39052	39057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014749	TCC	2	6	40766	40771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014749	TAC	2	6	40808	40813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014749	AAT	2	6	40861	40866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014749	TGA	2	6	42459	42464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014749	AAT	2	6	42466	42471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014749	AAT	2	6	42476	42481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014749	AGA	2	6	42676	42681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014749	GTA	2	6	50363	50368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014749	AGT	2	6	56639	56644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014749	AAT	2	6	58287	58292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014749	AAT	2	6	58323	58328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014749	AGA	2	6	58623	58628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014749	ATT	2	6	58650	58655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014749	ACA	2	6	58693	58698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.