MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 5597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014721	TGG	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014721	GAA	2	6	1644	1649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014721	ATT	2	6	4167	4172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014721	GGT	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014721	TGA	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014721	AGG	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014721	GAA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014721	TGA	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014721	ATT	2	6	9054	9059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014721	TCT	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014721	ATT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014721	AAC	2	6	9304	9309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014721	AGA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014721	TTG	2	6	9566	9571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014721	ATT	2	6	9585	9590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014721	TAT	2	6	9801	9806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014721	GAA	2	6	9898	9903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014721	TCT	2	6	10128	10133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014721	GAA	2	6	10176	10181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014721	GTA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014721	ATA	2	6	10346	10351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014721	TAA	2	6	10353	10358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014721	TAT	2	6	10422	10427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014721	AGT	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	TTA	2	6	10466	10471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014721	GGT	2	6	10503	10508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014721	TGA	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014721	ATT	2	6	10615	10620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014721	TGA	2	6	10650	10655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014721	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	TGA	2	6	10737	10742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	CTT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014721	TGA	2	6	10758	10763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014721	ATT	2	6	10822	10827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014721	GAA	2	6	15040	15045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014721	GGC	2	6	18261	18266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014721	TGA	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014721	TGA	3	9	18471	18479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014721	TCT	3	9	18585	18593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014721	AGA	2	6	18823	18828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014721	GTT	2	6	18968	18973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014721	ATT	2	6	19021	19026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014721	AAT	2	6	19171	19176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014721	TAC	2	6	19223	19228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014721	GAG	2	6	19235	19240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014721	AGG	2	6	19327	19332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014721	AGC	2	6	24671	24676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014721	GCT	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014721	AAG	2	6	24896	24901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014721	ACT	2	6	25201	25206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014721	GAA	2	6	25237	25242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014721	AGC	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014721	ATC	2	6	25433	25438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014721	AGA	2	6	25521	25526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014721	ATG	2	6	25592	25597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014721	GAC	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014721	ACA	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014721	TGG	2	6	25700	25705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014721	AAG	2	6	25709	25714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	ATA	3	9	25816	25824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014721	CAG	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014721	GAT	2	6	25863	25868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	AAG	2	6	25871	25876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014721	GAA	2	6	25948	25953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	GAA	2	6	25993	25998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014721	TGA	2	6	26007	26012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014721	AGA	2	6	27358	27363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014721	ATA	2	6	27371	27376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014721	AGA	2	6	27409	27414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014721	GAA	3	9	27505	27513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014721	AGA	2	6	27523	27528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014721	AGA	2	6	27616	27621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014721	GAG	2	6	27790	27795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014721	AGT	2	6	27812	27817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014721	GAA	2	6	27874	27879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	ATG	2	6	28000	28005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	TCC	2	6	28044	28049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014721	TGC	2	6	28112	28117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014721	ATG	2	6	32345	32350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014721	ATT	2	6	32356	32361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014721	TAT	2	6	32385	32390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014721	TAA	2	6	32424	32429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014721	TCT	2	6	32499	32504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014721	CAA	2	6	32858	32863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014721	ACA	2	6	32908	32913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014721	AAG	2	6	32974	32979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014721	AAT	2	6	32996	33001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014721	ATT	2	6	33020	33025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014721	TAC	2	6	33034	33039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014721	AAT	2	6	33061	33066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014721	ATT	2	6	33070	33075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	AAG	2	6	35106	35111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014721	TTG	3	9	35152	35160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014721	CAG	2	6	35233	35238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014721	GTG	2	6	35251	35256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014721	AGA	2	6	35312	35317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014721	AGA	2	6	35444	35449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014721	AGA	2	6	35531	35536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014721	GCA	2	6	35544	35549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014721	TTA	2	6	35677	35682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014721	AAC	2	6	35717	35722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014721	GCA	2	6	35739	35744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014721	GGA	2	6	35910	35915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014721	GTA	2	6	35997	36002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014721	TGA	2	6	36089	36094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014721	CGA	2	6	36095	36100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014721	CAA	2	6	36142	36147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014721	GAA	3	9	36152	36160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014721	TTA	2	6	36415	36420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014721	TAG	2	6	36436	36441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014721	AAG	2	6	36480	36485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	TAG	2	6	36493	36498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014721	ATG	2	6	36505	36510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014721	AGA	2	6	36530	36535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014721	AAT	2	6	36537	36542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014721	TAT	2	6	36552	36557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014721	AAG	2	6	36570	36575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	AGA	2	6	36590	36595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014721	TGT	2	6	36596	36601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014721	GTA	2	6	36727	36732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014721	TGT	2	6	36733	36738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014721	ATT	2	6	36751	36756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014721	CAA	2	6	36769	36774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014721	TAG	2	6	36820	36825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014721	GGT	2	6	36912	36917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014721	AGG	3	9	36929	36937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014721	ATT	2	6	36956	36961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014721	ATA	2	6	36984	36989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014721	TAC	2	6	37039	37044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014721	TAA	2	6	37051	37056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014721	TAG	2	6	37066	37071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014721	TTA	2	6	37110	37115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014721	AGG	2	6	37139	37144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014721	ATA	2	6	37159	37164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014721	AGG	2	6	37166	37171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014721	AAG	2	6	37180	37185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014721	AAG	2	6	37273	37278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014721	ATG	2	6	37297	37302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014721	CAA	2	6	37455	37460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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