MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kristjanssonii 177R1B chromosome

Total Repeats: 10943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014721	TA	4	8	41	48	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014721	TG	3	6	1449	1454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014721	TTA	2	6	1554	1559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014721	TGG	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014721	A	6	6	1633	1638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014721	GAA	2	6	1644	1649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014721	T	7	7	2762	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014721	ATT	2	6	4167	4172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014721	GGT	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014721	TGAT	2	8	6305	6312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014721	TGA	2	6	6315	6320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014721	AGG	2	6	6330	6335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014721	GAA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014721	A	6	6	8879	8884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014721	TAAG	2	8	8897	8904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014721	T	6	6	8942	8947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014721	TA	3	6	8963	8968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014721	TGA	2	6	8991	8996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014721	ATT	2	6	9054	9059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014721	TTTCT	2	10	9085	9094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014721	ATTCCT	2	12	9129	9140	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014721	TCTT	2	8	9141	9148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014721	CTTAA	2	10	9151	9160	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014721	TCT	2	6	9187	9192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014721	ATT	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014721	A	7	7	9226	9232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014721	TC	3	6	9239	9244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014721	AAC	2	6	9304	9309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014721	AT	3	6	9369	9374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014721	GATA	2	8	9386	9393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014721	AGA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014721	TTG	2	6	9566	9571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014721	ATT	2	6	9585	9590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014721	AT	3	6	9598	9603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014721	AG	3	6	9608	9613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014721	AG	3	6	9735	9740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014721	TGAA	2	8	9761	9768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014721	TAT	2	6	9801	9806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014721	AAAT	2	8	9818	9825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014721	A	6	6	9832	9837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014721	GAA	2	6	9898	9903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014721	AAGGA	2	10	9930	9939	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014721	GA	3	6	9960	9965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014721	A	6	6	9990	9995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014721	AAGT	2	8	10049	10056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014721	TCT	2	6	10128	10133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014721	GAA	2	6	10176	10181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014721	AG	3	6	10214	10219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014721	A	6	6	10228	10233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014721	A	8	8	10245	10252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014721	GTA	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014721	ATA	2	6	10346	10351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014721	TAA	2	6	10353	10358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014721	AACT	2	8	10380	10387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014721	GAAA	2	8	10409	10416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014721	TAT	2	6	10422	10427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014721	AGT	2	6	10456	10461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014721	TTA	2	6	10466	10471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014721	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014721	GGT	2	6	10503	10508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014721	TGA	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014721	AAAT	2	8	10601	10608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014721	ATT	2	6	10615	10620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014721	TA	3	6	10644	10649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014721	TGA	2	6	10650	10655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014721	A	6	6	10655	10660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014721	TTGC	2	8	10693	10700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014721	TTA	2	6	10708	10713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014721	TGA	2	6	10737	10742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014721	CTT	2	6	10748	10753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014721	TGA	2	6	10758	10763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014721	TG	3	6	10781	10786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014721	AGAAT	2	10	10808	10817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014721	ATT	2	6	10822	10827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014721	A	7	7	10839	10845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014721	AG	3	6	10939	10944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014721	GA	3	6	10945	10950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014721	AG	3	6	13070	13075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014721	T	7	7	15002	15008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014721	GAA	2	6	15040	15045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014721	AG	3	6	18255	18260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014721	GGC	2	6	18261	18266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014721	TGA	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014721	GACAAA	2	12	18366	18377	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014721	A	6	6	18444	18449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014721	TGA	3	9	18471	18479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014721	AAGA	2	8	18516	18523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014721	TCT	3	9	18585	18593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014721	A	6	6	18674	18679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014721	AT	3	6	18788	18793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014721	A	6	6	18804	18809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014721	AGA	2	6	18823	18828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014721	TATG	2	8	18858	18865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014721	A	6	6	18944	18949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014721	GTT	2	6	18968	18973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014721	AATACC	2	12	18980	18991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014721	ATT	2	6	19021	19026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014721	A	7	7	19137	19143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014721	T	6	6	19165	19170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014721	AAT	2	6	19171	19176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014721	TAC	2	6	19223	19228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014721	GAG	2	6	19235	19240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014721	T	6	6	19252	19257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014721	T	7	7	19319	19325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014721	AGG	2	6	19327	19332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014721	AGC	2	6	24671	24676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014721	GCT	2	6	24713	24718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014721	CATT	2	8	24719	24726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014721	A	6	6	24740	24745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014721	A	6	6	24862	24867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014721	AAG	2	6	24896	24901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014721	AAAAAT	2	12	24904	24915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014721	AT	3	6	24946	24951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014721	GTTAG	2	10	25060	25069	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014721	GTAAA	2	10	25091	25100	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014721	A	7	7	25170	25176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014721	ACT	2	6	25201	25206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014721	GAA	2	6	25237	25242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014721	A	6	6	25263	25268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014721	AGC	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014721	AG	3	6	25344	25349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014721	T	6	6	25380	25385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014721	ATC	2	6	25433	25438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014721	AGA	2	6	25521	25526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014721	ATG	2	6	25592	25597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014721	GAC	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014721	ACA	2	6	25661	25666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014721	TGG	2	6	25700	25705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014721	AAG	2	6	25709	25714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014721	GATA	2	8	25752	25759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014721	AGATA	2	10	25809	25818	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014721	ATA	3	9	25816	25824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014721	CAG	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014721	GAT	2	6	25863	25868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014721	AAG	2	6	25871	25876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014721	TA	3	6	25888	25893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014721	AGCA	2	8	25896	25903	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014721	GAA	2	6	25948	25953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014721	GAA	2	6	25993	25998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014721	TGA	2	6	26007	26012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014721	AGA	2	6	27358	27363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014721	ATA	2	6	27371	27376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014721	CAAG	2	8	27384	27391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014721	AG	3	6	27390	27395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014721	AAGA	2	8	27398	27405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014721	AGA	2	6	27409	27414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014721	AG	4	8	27416	27423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014721	AGAAA	2	10	27478	27487	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014721	GAA	3	9	27505	27513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014721	AGA	2	6	27523	27528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014721	AGA	2	6	27616	27621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014721	AT	3	6	27701	27706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014721	AT	3	6	27781	27786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014721	GAG	2	6	27790	27795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_014721	AT	3	6	27836	27841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014721	T	6	6	27851	27856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014721	GAAAA	2	10	28159	28168	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014721	A	6	6	28210	28215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014721	T	6	6	32484	32489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_014721	AAAT	2	8	38947	38954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_014721	GTATAT	2	12	39036	39047	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_014721	GAT	2	6	39111	39116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014721	ATG	2	6	39235	39240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014721	TTG	2	6	39253	39258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014721	AGA	2	6	39263	39268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014721	GCAG	2	8	39306	39313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
297	NC_014721	ATATGA	2	12	39353	39364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014721	TTA	2	6	39366	39371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_014721	TAA	2	6	39505	39510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_014721	TAC	3	9	39606	39614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_014721	AGA	2	6	39641	39646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_014721	GTT	2	6	39882	39887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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328	NC_014721	T	6	6	40341	40346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_014721	AT	3	6	45774	45779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_014721	GTG	2	6	45842	45847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_014721	A	7	7	45883	45889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_014721	AGTA	2	8	45924	45931	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_014721	AGT	2	6	46179	46184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_014721	AAT	2	6	51784	51789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_014721	TCT	2	6	51808	51813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_014721	GTT	2	6	55441	55446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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