MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 190

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	TTTGTC	2	12	24748	24759	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014720	TGAAAA	2	12	47079	47090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014720	CCCTTT	2	12	76122	76133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014720	TTTTCA	2	12	77702	77713	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014720	ACTTTC	2	12	79645	79656	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014720	ATTTTT	2	12	94936	94947	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014720	AAATAA	2	12	118366	118377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014720	GGAAAA	2	12	267977	267988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014720	ATTAGC	2	12	279134	279145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014720	AAGATT	2	12	279289	279300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014720	TTGAGT	2	12	279500	279511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014720	TGAAAA	2	12	352033	352044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014720	ACAAAA	2	12	395303	395314	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014720	GAGAAG	2	12	395919	395930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014720	TAAAAA	2	12	420302	420313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014720	GAAAAA	2	12	420431	420442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014720	GTTTTT	2	12	423368	423379	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014720	GATTTT	2	12	427142	427153	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014720	TGTCAT	2	12	427823	427834	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014720	AGAAAA	2	12	428357	428368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014720	ATTATA	2	12	432920	432931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014720	GTCTTT	2	12	441984	441995	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014720	TTATGG	2	12	454108	454119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014720	GACAAA	2	12	462226	462237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014720	TTGAAG	2	12	462360	462371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014720	GTAAAA	2	12	471652	471663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014720	AGGAAA	2	12	473927	473938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014720	CCTTTG	2	12	474592	474603	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014720	GATTTT	2	12	504801	504812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014720	TGTCAT	2	12	505481	505492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014720	ACAAAA	2	12	522992	523003	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014720	TAAAAA	2	12	526172	526183	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014720	TAATTG	2	12	554494	554505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014720	CAAAAA	2	12	562433	562444	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014720	ATGGAA	2	12	629187	629198	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014720	TAACTA	2	12	637319	637330	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014720	ATACTC	2	12	644199	644210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014720	CAAAAA	2	12	659745	659756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014720	ACAAGA	2	12	664107	664118	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014720	TAGATA	2	12	679875	679886	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014720	TCCATC	2	12	680285	680296	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014720	ACTGTA	2	12	699664	699675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014720	AAAAAT	2	12	714391	714402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014720	CTAAAG	2	12	720113	720124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014720	AAGATT	2	12	720362	720373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014720	AAAGCC	2	12	720740	720751	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014720	GAACTG	2	12	730065	730076	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014720	ATTGAC	2	12	734102	734113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014720	AATTTT	2	12	772364	772375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014720	TAAAAG	2	12	838770	838781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014720	CTCCCT	2	12	850428	850439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014720	AATTTT	2	12	856876	856887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014720	TAAAAA	2	12	860847	860858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014720	AACAAA	2	12	863690	863701	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014720	TTGATA	2	12	898385	898396	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014720	GACAAA	2	12	918354	918365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014720	TTATTT	2	12	918942	918953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014720	TCGTTT	2	12	919829	919840	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014720	AATCAA	2	12	929730	929741	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014720	ACAAAA	2	12	945612	945623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014720	GGGTTA	2	12	1015314	1015325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014720	AGTAAA	2	12	1019839	1019850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014720	TAAAAT	2	12	1031831	1031842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014720	GAAAGT	2	12	1039280	1039291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014720	GACAAA	2	12	1039716	1039727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014720	CTAAAG	2	12	1050708	1050719	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014720	AAGATT	2	12	1050957	1050968	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014720	AAAATT	2	12	1057778	1057789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014720	TATAAT	2	12	1109514	1109525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014720	ATTAAG	2	12	1116222	1116233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014720	TAAAAA	2	12	1132876	1132887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014720	GAAAAA	2	12	1133431	1133442	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014720	AAGGCT	2	12	1170066	1170077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014720	GAGAAG	2	12	1170612	1170623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014720	TTTTTA	2	12	1195316	1195327	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014720	CTCACA	2	12	1231533	1231544	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014720	GAGATT	2	12	1243755	1243766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014720	ACATGA	2	12	1247985	1247996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014720	CGCTTG	2	12	1248600	1248611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014720	AAAGTC	2	12	1256772	1256783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014720	TGTTAT	2	12	1267832	1267843	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014720	AAATCA	2	12	1278294	1278305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014720	TGATAT	2	12	1280146	1280157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014720	TAATTG	2	12	1281357	1281368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014720	ATAAAA	2	12	1295760	1295771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014720	AAAACA	2	12	1298903	1298914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014720	AAATAT	2	12	1303519	1303530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014720	TTACTT	2	12	1339318	1339329	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014720	TCTTTT	2	12	1364536	1364547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014720	AAATAT	2	12	1368391	1368402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014720	TATTTT	2	12	1369844	1369855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014720	TCAAAA	2	12	1372343	1372354	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014720	TAAAAA	2	12	1372361	1372372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014720	AATTAC	2	12	1393561	1393572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014720	AAAATT	2	12	1393616	1393627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014720	TTATAA	2	12	1403411	1403422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014720	ATTTTT	2	12	1495714	1495725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014720	ATAATG	2	12	1596537	1596548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014720	TCTCAC	2	12	1609485	1609496	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014720	ACTTCT	2	12	1666967	1666978	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014720	AAGAAA	2	12	1702018	1702029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014720	AAAACG	2	12	1702443	1702454	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014720	CTCTTG	2	12	1728170	1728181	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014720	TTATTT	2	12	1746146	1746157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014720	AAAAAC	2	12	1833616	1833627	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014720	TAATTT	2	12	1878902	1878913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014720	TTATTT	2	12	1880505	1880516	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014720	AAATTA	2	12	1890437	1890448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014720	AATTTA	2	12	1906938	1906949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014720	ATACAT	2	12	1908759	1908770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014720	TAAATA	2	12	1910060	1910071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014720	TTTACT	2	12	1925993	1926004	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014720	AATTTT	2	12	1926050	1926061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014720	ACAAAA	2	12	1926277	1926288	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014720	TAACAA	2	12	1927811	1927822	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014720	TTTTGC	2	12	1939041	1939052	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014720	TGTAAT	2	12	1944378	1944389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014720	GTTGCT	2	12	1947262	1947273	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014720	CTTTTT	2	12	1952862	1952873	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014720	CCCAGC	2	12	1958619	1958630	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014720	CAAAAA	2	12	2063919	2063930	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014720	AAAAAC	2	12	2066238	2066249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014720	CAAAAA	2	12	2067808	2067819	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014720	AATCTT	2	12	2081414	2081425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014720	CTTTAG	2	12	2081663	2081674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014720	GCAAAA	2	12	2085590	2085601	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014720	ACTTTC	2	12	2089552	2089563	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014720	GATAAT	2	12	2110229	2110240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014720	TTTGAT	2	12	2115022	2115033	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014720	GATAAG	2	12	2128573	2128584	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014720	CAATTA	2	12	2134572	2134583	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014720	TTTCAT	2	12	2142010	2142021	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014720	TTAATT	2	12	2149352	2149363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014720	GAAAGT	2	12	2197129	2197140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_014720	CTTTTT	2	12	2309690	2309701	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014720	ATGGCA	2	12	2319524	2319535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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139	NC_014720	TTTTCA	2	12	2343253	2343264	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014720	TTTTCA	2	12	2348331	2348342	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014720	TCAAAA	2	12	2378435	2378446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_014720	AACACA	2	12	2381238	2381249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014720	TTAAAT	2	12	2424864	2424875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014720	ATTTTT	2	12	2425763	2425774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014720	AGTAAC	2	12	2425798	2425809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_014720	TAAGTA	2	12	2439228	2439239	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014720	AGCCTT	2	12	2447856	2447867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_014720	GTTTTT	2	12	2461479	2461490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_014720	TCTTCC	2	12	2471625	2471636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_014720	CTTACA	2	12	2493019	2493030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_014720	CAATTT	2	12	2537582	2537593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.