MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 4748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	GTT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014720	GGA	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014720	AAT	2	6	9160	9165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014720	AAT	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014720	TTA	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014720	ATT	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014720	CAA	2	6	9323	9328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014720	TAA	3	9	9377	9385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014720	GAT	2	6	11368	11373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014720	AGG	2	6	11430	11435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014720	TGC	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014720	TAA	2	6	11660	11665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014720	AAT	2	6	11843	11848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014720	ATT	2	6	11916	11921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014720	GAA	2	6	11932	11937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014720	ATT	2	6	11973	11978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014720	GAA	2	6	12032	12037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014720	TGG	2	6	12146	12151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014720	TTA	2	6	12187	12192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014720	ATG	2	6	12204	12209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014720	TAA	2	6	12282	12287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014720	ATT	2	6	12408	12413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014720	GTA	2	6	12440	12445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014720	TCT	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014720	ATT	2	6	12483	12488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014720	CAA	2	6	12721	12726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014720	AAG	2	6	12785	12790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014720	AAT	2	6	12807	12812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014720	ATT	2	6	12831	12836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014720	TAC	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014720	AAT	2	6	12872	12877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014720	ATT	2	6	12881	12886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014720	AGA	3	9	21983	21991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014720	ACC	2	6	24193	24198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014720	GCT	2	6	24221	24226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014720	CTT	2	6	24233	24238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014720	CAC	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014720	AAG	4	12	24288	24299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014720	CAG	2	6	24300	24305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014720	AAT	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014720	CTT	2	6	24396	24401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014720	CTG	2	6	24577	24582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014720	ACA	2	6	24685	24690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014720	ATG	2	6	24790	24795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014720	TGT	2	6	24798	24803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014720	CTT	3	9	24940	24948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014720	TGA	2	6	25035	25040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014720	ATA	2	6	25041	25046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014720	TAG	2	6	25121	25126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014720	CTC	2	6	25138	25143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014720	ACA	2	6	25248	25253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014720	AAT	2	6	25370	25375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014720	CAG	2	6	25402	25407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014720	AAG	2	6	25681	25686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014720	ATT	2	6	25710	25715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014720	TAT	2	6	28363	28368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014720	ATT	2	6	28376	28381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014720	TAA	2	6	28490	28495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014720	TAT	2	6	29308	29313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014720	CAA	2	6	29343	29348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014720	TAA	2	6	35927	35932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014720	ATG	2	6	35937	35942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014720	AAG	2	6	36031	36036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014720	ACA	2	6	45953	45958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014720	AGA	2	6	46030	46035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014720	AAG	2	6	46120	46125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014720	CAA	2	6	46127	46132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014720	TAA	3	9	46218	46226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014720	GAA	2	6	46268	46273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014720	CAG	2	6	46356	46361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014720	GAT	2	6	46505	46510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014720	AGA	2	6	46513	46518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014720	AGA	2	6	46520	46525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014720	GAA	2	6	46526	46531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014720	TAA	2	6	46542	46547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014720	AGA	2	6	46555	46560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014720	TAA	2	6	46653	46658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014720	AGA	2	6	46689	46694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014720	TTG	2	6	46757	46762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014720	GTG	2	6	46853	46858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014720	CAG	2	6	46952	46957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014720	CTT	2	6	47007	47012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014720	GAA	2	6	47014	47019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014720	GGA	2	6	47036	47041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014720	AGA	2	6	47055	47060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014720	AAG	2	6	47064	47069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014720	AGA	2	6	47073	47078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014720	AAG	2	6	47113	47118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014720	AGA	3	9	47352	47360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014720	TAA	2	6	47462	47467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014720	TGG	2	6	47547	47552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014720	AAT	2	6	47553	47558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014720	TAA	2	6	47579	47584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014720	TTC	2	6	47601	47606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014720	GAT	2	6	47617	47622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014720	TTC	2	6	47717	47722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014720	AGG	2	6	47881	47886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014720	GAT	2	6	48438	48443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014720	TAC	2	6	50585	50590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014720	GAG	2	6	50663	50668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014720	AAG	2	6	50721	50726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014720	TCT	2	6	50733	50738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014720	CTT	2	6	50891	50896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014720	AAT	2	6	51001	51006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014720	GGC	2	6	51043	51048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014720	TAT	2	6	51073	51078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014720	GAA	2	6	51140	51145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014720	ATG	2	6	51207	51212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014720	ATT	2	6	51213	51218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014720	TGA	2	6	51250	51255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014720	TCC	2	6	52848	52853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014720	GAG	2	6	53073	53078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014720	CTT	2	6	54572	54577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014720	ATA	2	6	55291	55296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014720	AAT	2	6	55328	55333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014720	AAG	2	6	55346	55351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014720	GCA	2	6	56714	56719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014720	TAA	2	6	56772	56777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014720	GTA	2	6	60781	60786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014720	TAC	2	6	60845	60850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014720	AAT	2	6	60878	60883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014720	CAA	2	6	62072	62077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014720	AAG	2	6	62692	62697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014720	ATG	3	9	62820	62828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014720	GAG	2	6	62836	62841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014720	GTT	2	6	66904	66909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014720	AGA	2	6	66941	66946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014720	GTT	2	6	66954	66959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014720	ATT	2	6	70174	70179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014720	TAT	2	6	72778	72783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014720	AAG	2	6	72901	72906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014720	AGG	2	6	72911	72916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014720	TAG	2	6	74301	74306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014720	TTG	2	6	74308	74313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014720	ATA	2	6	75025	75030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014720	ATT	2	6	76055	76060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014720	TTC	2	6	76537	76542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014720	AGC	2	6	76613	76618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014720	CTT	2	6	76625	76630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014720	GAA	2	6	76679	76684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014720	AAG	2	6	76802	76807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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