MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor kronotskyensis 2002 chromosome

Total Repeats: 9603

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014720	GTT	2	6	11	16	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014720	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014720	T	7	7	3865	3871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014720	GGA	2	6	6705	6710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014720	AAT	2	6	9160	9165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014720	T	7	7	9215	9221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014720	AAT	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014720	TTA	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014720	ATT	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014720	T	6	6	9293	9298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014720	A	6	6	9305	9310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014720	CAA	2	6	9323	9328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014720	T	6	6	9332	9337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014720	AATTG	2	10	9367	9376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014720	TAA	3	9	9377	9385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014720	A	6	6	9415	9420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014720	GAT	2	6	11368	11373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014720	A	6	6	11374	11379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014720	AGG	2	6	11430	11435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014720	TGC	2	6	11598	11603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014720	AG	3	6	11629	11634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014720	TAA	2	6	11660	11665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014720	A	7	7	11782	11788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014720	ATTCA	2	10	11825	11834	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014720	AAT	2	6	11843	11848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014720	ATT	2	6	11916	11921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014720	GAA	2	6	11932	11937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014720	ATT	2	6	11973	11978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014720	GAA	2	6	12032	12037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014720	A	6	6	12040	12045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014720	A	8	8	12088	12095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014720	TGG	2	6	12146	12151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014720	TTA	2	6	12187	12192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014720	ATG	2	6	12204	12209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014720	TAA	2	6	12282	12287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014720	AT	3	6	12351	12356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014720	TA	3	6	12382	12387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014720	A	6	6	12392	12397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014720	ATT	2	6	12408	12413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014720	T	7	7	12412	12418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014720	T	6	6	12434	12439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014720	GTA	2	6	12440	12445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014720	TCT	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014720	ATT	2	6	12483	12488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014720	GAAA	2	8	12509	12516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014720	A	6	6	12514	12519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014720	A	6	6	12538	12543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014720	GA	3	6	12582	12587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014720	CAA	2	6	12721	12726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014720	T	7	7	12750	12756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014720	AAG	2	6	12785	12790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014720	AAT	2	6	12807	12812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014720	T	6	6	12823	12828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014720	ATT	2	6	12831	12836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014720	TAC	2	6	12845	12850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014720	AAT	2	6	12872	12877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014720	ATT	2	6	12881	12886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014720	AGA	3	9	21983	21991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014720	ACC	2	6	24193	24198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014720	GCT	2	6	24221	24226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014720	CTT	2	6	24233	24238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014720	CAC	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014720	AAG	4	12	24288	24299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014720	CAG	2	6	24300	24305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014720	AATGG	2	10	24308	24317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014720	TG	3	6	24330	24335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014720	AAT	2	6	24366	24371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014720	CTT	2	6	24396	24401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014720	T	6	6	24440	24445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014720	CTG	2	6	24577	24582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014720	TA	3	6	24597	24602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014720	CT	3	6	24603	24608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014720	ACA	2	6	24685	24690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014720	T	6	6	24691	24696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014720	TTTGTC	2	12	24748	24759	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014720	ATG	2	6	24790	24795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014720	TGT	2	6	24798	24803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014720	A	6	6	24839	24844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014720	CTT	3	9	24940	24948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014720	T	6	6	24968	24973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014720	TGA	2	6	25035	25040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014720	ATA	2	6	25041	25046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014720	TAG	2	6	25121	25126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014720	CTC	2	6	25138	25143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014720	ACA	2	6	25248	25253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014720	AT	3	6	25325	25330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014720	ATCTC	2	10	25357	25366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014720	AAT	2	6	25370	25375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014720	T	6	6	25375	25380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014720	CAG	2	6	25402	25407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014720	A	6	6	25510	25515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014720	T	6	6	25582	25587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014720	CCTC	2	8	25640	25647	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_014720	AAG	2	6	25681	25686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014720	ATT	2	6	25710	25715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014720	A	6	6	25736	25741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014720	CA	3	6	28345	28350	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014720	TAT	2	6	28363	28368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014720	ATT	2	6	28376	28381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014720	CAAA	2	8	28405	28412	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014720	TAA	2	6	28490	28495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014720	AAAAT	2	10	28496	28505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014720	TTTA	2	8	28506	28513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014720	A	7	7	28562	28568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014720	A	6	6	29256	29261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014720	A	6	6	29277	29282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014720	T	6	6	29298	29303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014720	TAT	2	6	29308	29313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014720	TA	3	6	29333	29338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014720	CAA	2	6	29343	29348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014720	ATTA	2	8	29360	29367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014720	TAAG	2	8	35828	35835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014720	TAATA	2	10	35868	35877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014720	TAA	2	6	35927	35932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014720	ATG	2	6	35937	35942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014720	ATTT	2	8	35960	35967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014720	T	6	6	35969	35974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014720	AAG	2	6	36031	36036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014720	GTAA	2	8	36111	36118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014720	GA	3	6	42301	42306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014720	A	6	6	43500	43505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014720	ACA	2	6	45953	45958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014720	AGA	2	6	46030	46035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014720	GA	3	6	46056	46061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014720	A	6	6	46061	46066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014720	AAG	2	6	46120	46125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014720	CAA	2	6	46127	46132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014720	TAA	3	9	46218	46226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014720	TAAA	2	8	46251	46258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014720	GAA	2	6	46268	46273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014720	T	6	6	46285	46290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014720	AG	3	6	46323	46328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014720	A	6	6	46340	46345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014720	CAG	2	6	46356	46361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014720	AGGA	2	8	46464	46471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014720	GAT	2	6	46505	46510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014720	AGA	2	6	46513	46518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014720	AGA	2	6	46520	46525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014720	GAA	2	6	46526	46531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014720	A	6	6	46534	46539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014720	TAA	2	6	46542	46547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014720	AGA	2	6	46555	46560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014720	A	6	6	46567	46572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014720	A	8	8	46578	46585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014720	GA	3	6	46608	46613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014720	TA	3	6	46629	46634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014720	TAA	2	6	46653	46658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014720	AGA	2	6	46689	46694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014720	A	7	7	46699	46705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_014720	AG	3	6	156187	156192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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